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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G247560
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 63562559-63565328 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1378 bp · TkA02G247560|TK1151|cDNA

TGGTAAGAAATAAACATGAAGCGGGTGAATTGTGATGCCTGCGTGGCAGCGTGAATGATGCCTGCGTGTATGGTGTGATATTTATTGCTTCAATTATTTGGATTTTTGTAACAGAGCAGATAAATAGAGAGGAATCAAGAAGGACAACCAACAACAATGGCGACACTGAAGGTACCATCAGCCGTCCCTTCTCCTTCTGAGGACTGTGAGCAACTCCGGAAAGCGTTTGCAGGTTGGGGAACAAATGAGGCATTGATCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

951 bp · TkA02G247560|TK1151|CDS

ATGGCGACACTGAAGGTACCATCAGCCGTCCCTTCTCCTTCTGAGGACTGTGAGCAACTCCGGAAAGCGTTTGCAGGTTGGGGAACAAATGAGGCATTGATCATTCAGATTCTGGCCCATAGAAATGGTGCTCAACGCAAAAATATTCAGGAAGCATACTTTCAAACATATGGTGAACATCTCCTCAAAGATTTGGACTCTGAGCTTTCAAGCGATTTTCAAAGGGCAGTGATGTTGTGGACATTGGAGCCAGCTGAGCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

316 aa · TkA02G247560|TK1151|PROTEIN

MATLKVPSAVPSPSEDCEQLRKAFAGWGTNEALIIQILAHRNGAQRKNIQEAYFQTYGEHLLKDLDSELSSDFQRAVMLWTLEPAERDAYLANEATKKLTASNWVLMEIACTRSSNHLLAVRKAYHAKYKKSLEEDVAHHTSGDFRKLLVPLVSAFRYEGEEVNMSVAKSEAKIVHQKICDKAYTDDELIRIITTRSKAQLNATLNQYNNQFGNTVTKDLKADPADEYLKFLRSTIKCLTVPEKYYEKVLRLAINKLGTD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G247560
TK1151 IDTkA02G247560
OH-1004 IDLXL04_035794
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)63.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.684 / OH-1004 99.684
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G247560
位置Chr02:63562559-63565328 (-)
描述Similar to ANN2: Annexin D2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65020 可能介导种苗发育过程中高尔基体来源囊泡的调控性定向分泌。 暂无已核实直接文献
At5g10230 致密素 D7。 暂无已核实直接文献
At1g35720 具有过氧化物酶活性。
Immunolocalization and histochemical evidence for the association of two different Arabidopsis annexins with secretion during early seedling growth and development.2005 · DOI: 10.1007/s00425-004-1374-7
Peroxidase activity of annexin 1 from Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2005.08.181
At5g10220 致密素 D6。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035794 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009639 response to red or far red light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009835 fruit ripening 生物过程
GO:0015774 polysaccharide transport 生物过程
GO:0017156 calcium-ion regulated exocytosis 生物过程
GO:0032940 secretion by cell 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G35720
ath:AT5G10220
ath:AT5G10230
ath:AT5G65020
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.470
排名 1 · TkA02G247560 · TK1151
细胞膜0.358
排名 2 · TkA02G247560 · TK1151
细胞核0.235
排名 3 · TkA02G247560 · TK1151
细胞外0.087
排名 4 · TkA02G247560 · TK1151
线粒体0.085
排名 5 · TkA02G247560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00191Annexin16-79 aa
PF29878CdiI_serr44-74 aa
PF24360DUF751645-64 aa
PF07700HNOB49-76 aa
PF19667DUF617082-109 aa
PF00191Annexin87-152 aa
PF24360DUF7516106-138 aa
PF30745DUF8720125-242 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G247560PF00191Annexin16793.1e-74245.7
TkA02G247560PF29878CdiI_serr44740.2113.1
TkA02G247560PF24360DUF751645641.7e-0525.5
TkA02G247560PF07700HNOB49760.07813.6
TkA02G247560PF19667DUF6170821090.1412.8
TkA02G247560PF00191Annexin871523.1e-74245.7
TkA02G247560PF24360DUF75161061381.7e-0525.5
TkA02G247560PF30745DUF87201252420.02714.5
TkA02G247560PF07700HNOB1582370.07813.6
TkA02G247560PF00191Annexin1722283.1e-74245.7
TkA02G247560PF29878CdiI_serr1992250.2113.1
TkA02G247560PF19667DUF61702192540.1412.8
TkA02G247560PF00191Annexin2483103.1e-74245.7
TkA02G247560PF24360DUF75162702941.7e-0525.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XEE2拟南芥sp|Q9XEE2|ANXD2_ARATH Annexin D269.300%Swiss-Prot高置信
Q9LX07拟南芥sp|Q9LX07|ANXD7_ARATH Annexin D769.200%Swiss-Prot高置信
Q9SYT0拟南芥sp|Q9SYT0|ANXD1_ARATH Annexin D168.100%Swiss-Prot高置信
Q9LX08拟南芥sp|Q9LX08|ANXD6_ARATH Annexin D666.600%Swiss-Prot高置信

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