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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G177870
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 45778484-45780986 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1614 bp · TkA02G177870|TK1151|cDNA

GCAGTCCTTGCTCTTGTGTACACGTTGTCAACATATGCTGGGCCTTTTCTTATAGATGCGTTTGTAGAATATGTAAATGGACATCGGGACTTAAAAGAGGGCTTTCTTCTAGTTTCGGCATTCTTTTTTGCGAAGATTGTAGAGTGTTTGGCAAACCGTCATCAAGATTTTAAGCTGAAACAAGCAGGAATCAAGGCAAGAGGTGCTTTAGTTGCAGCAATATACCTTAAAGGTTTGACCCTTTCGTCTAGGTCAAAGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1614 bp · TkA02G177870|TK1151|CDS

GCAGTCCTTGCTCTTGTGTACACGTTGTCAACATATGCTGGGCCTTTTCTTATAGATGCGTTTGTAGAATATGTAAATGGACATCGGGACTTAAAAGAGGGCTTTCTTCTAGTTTCGGCATTCTTTTTTGCGAAGATTGTAGAGTGTTTGGCAAACCGTCATCAAGATTTTAAGCTGAAACAAGCAGGAATCAAGGCAAGAGGTGCTTTAGTTGCAGCAATATACCTTAAAGGTTTGACCCTTTCGTCTAGGTCAAAGCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

538 aa · TkA02G177870|TK1151|PROTEIN

AVLALVYTLSTYAGPFLIDAFVEYVNGHRDLKEGFLLVSAFFFAKIVECLANRHQDFKLKQAGIKARGALVAAIYLKGLTLSSRSKQGQSNGEIINFVAVDAERIGDFSHYMHNPWLVILEVGLALAILYKNIGVSSLAAFVATVIVVSVNIPLGRFQKKFEEKLMKYKDKRMKTTSEILKNMRILKLHGWEMKFLSRIHDIRKDEARWLYKKVYSMAMTTFAFWVAPTFVAVATFGTCTLVGVQLDSGKVLSALATFKI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G177870
TK1151 IDTkA02G177870
OH-1004 IDLXL04_016188
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 36.698
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G177870
位置Chr02:45778484-45780986 (+)
描述Similar to ABCC3: ABC transporter C family member 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g13080 谷胱甘肽 S-结合物泵。
An ABC-transporter of Arabidopsis thaliana has both glutathione-conjugate and chlorophyll catabolite transport activity.1998 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1998.00076.x
At3g13090 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At3g13100 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XCD4 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016188 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008559 ABC-type xenobiotic transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G13080
ath:AT3G13090
ath:AT3G13100
dosa:Os03g0142800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.334
排名 1 · TkA02G177870 · TK1151
细胞膜0.220
排名 2 · TkA02G177870 · TK1151
内质网0.197
排名 3 · TkA02G177870 · TK1151
细胞质0.196
排名 4 · TkA02G177870 · TK1151
高尔基体0.109
排名 5 · TkA02G177870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane2-262 aa
PF27639VMP1_C40-55 aa
PF13476AAA_23162-178 aa
PF00005ABC_tran264-279 aa
PF00005ABC_tran331-463 aa
PF13555AAA_29339-356 aa
PF20703nSTAND1340-367 aa
PF01926MMR_HSR1341-365 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G177870PF00664ABC_membrane22626.5e-2692.3
TkA02G177870PF27639VMP1_C40550.1412.6
TkA02G177870PF13476AAA_231621780.2512.7
TkA02G177870PF00005ABC_tran2642791.8e-2074.7
TkA02G177870PF00005ABC_tran3314631.8e-2074.7
TkA02G177870PF13555AAA_293393560.1512.5
TkA02G177870PF20703nSTAND13403670.1712.2
TkA02G177870PF01926MMR_HSR13413650.1313.1
TkA02G177870PF02463SMC_N3423610.001119.2
TkA02G177870PF13476AAA_233423590.2512.7
TkA02G177870PF00350Dynamin_N3423620.2512.1
TkA02G177870PF13304AAA_213433590.0003521.3
TkA02G177870PF02463SMC_N3975040.001119.2
TkA02G177870PF13304AAA_214364980.0003521.3
TkA02G177870PF01926MMR_HSR14925130.1313.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK64拟南芥sp|Q9LK64|AB3C_ARATH ABC transporter C family member 368.500%Swiss-Prot高置信
Q8VZZ4拟南芥sp|Q8VZZ4|AB6C_ARATH ABC transporter C family member 662.500%Swiss-Prot高置信
Q9LK62拟南芥sp|Q9LK62|AB7C_ARATH ABC transporter C family member 762.500%Swiss-Prot高置信
A2XCD4水稻sp|A2XCD4|AB13C_ORYSI ABC transporter C family member 1356.300%Swiss-Prot高置信

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