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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G172620
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 44357302-44366149 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4099 bp · TkA02G172620|TK1151|cDNA

TTACTTCAATTCCTTTACCAGTCTTGTTGGAGCTCTTGTAGAACCTCCATGAAACTCGCCATCTCAAAGTCTAATTGTGTCGCCGGAGATTCAAGACAATCCGATGAAGCATTAACTTACATCACTTCACTCCCCCTTCACTGTAACTTTGTTACTTTATAACTTGGAATTAGCGAAATGCCCTACGCTTGAAACAACAAATAAAGAAGTGTTTTTTTTGCTTCAAATTACTAAAAGGACCTTCTTATTCATAAAAGTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1698 bp · TkA02G172620|TK1151|CDS

ATGAAAACCCGGGTGGAGAATGTTATATCATATCTAAAAACGGATATTGATGACGTAACCATGATCGGGATCAAAGGGATAGGAGGGGGTGGGAAGACAACTTTGGCTAGAGTTGTTTTTGACCAAATATCCTTTCAATTCGAAGGAATAAGTTTCGTTGAGAATGTCAGAGAAATTTCCAAGGCTTCTGTGTACGGTTTGGCATCGTTGCAAAATATAATTCTTAAAAATGTCTTAAATGATCAAAAGATCAACGTAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

565 aa · TkA02G172620|TK1151|PROTEIN

MKTRVENVISYLKTDIDDVTMIGIKGIGGGGKTTLARVVFDQISFQFEGISFVENVREISKASVYGLASLQNIILKNVLNDQKINVSGVYDGINMMKRTMISRKVLLVLDDVDDIEQLKVLAGDRSWFKKGSRIIITTRDENVLLAHGVNWVHNVNLLSSDEAICLFSRLAFKRDVPIQGYEELSRQVVAYASGLPLTITVLGSHLCDKDLDEWKDALERLKTIPLEKTLQKLELSFLSLPEDRKNIFLNVACILKGWEK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G172620
TK1151 IDTkA02G172620
OH-1004 IDLXL04_016216
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)71.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.558 / OH-1004 52.398
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G172620
位置Chr02:44357302-44366149 (+)
描述Similar to RPV1: Disease resistance protein RPV1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g18370 参与植物防御的 TIR-NB-LRR 受体样蛋白。
Matching NLR Immune Receptors to Autoimmunity in camta3 Mutants Using Antimorphic NLR Alleles.2017 · DOI: 10.1016/j.chom.2017.03.005

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016216 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.554
排名 1 · TkA02G172620 · TK1151
细胞核0.259
排名 2 · TkA02G172620 · TK1151
细胞膜0.144
排名 3 · TkA02G172620 · TK1151
内质网0.104
排名 4 · TkA02G172620 · TK1151
细胞外0.076
排名 5 · TkA02G172620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00931NB-ARC2-175 aa
PF24883NPHP3_N20-45 aa
PF05729NACHT24-143 aa
PF00004AAA26-115 aa
PF13306LRR_540-79 aa
PF13855LRR_857-76 aa
PF12799LRR_467-76 aa
PF12799LRR_4228-232 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G172620PF00931NB-ARC21754.1e-2279.3
TkA02G172620PF24883NPHP3_N20450.1313.2
TkA02G172620PF05729NACHT241430.0005220.6
TkA02G172620PF00004AAA261150.06414.4
TkA02G172620PF13306LRR_540790.004617.6
TkA02G172620PF13855LRR_857760.06813.7
TkA02G172620PF12799LRR_467764.58.4
TkA02G172620PF12799LRR_42282324.58.4
TkA02G172620PF13516LRR_62292374.78.2
TkA02G172620PF23282WHD_ROQ12433153e-1453.6
TkA02G172620PF13855LRR_83813980.06813.7
TkA02G172620PF24758LRR_At5g563703814860.1312.6
TkA02G172620PF12799LRR_43813944.58.4
TkA02G172620PF13516LRR_63823954.78.2
TkA02G172620PF23282WHD_ROQ13884063e-1453.6
TkA02G172620PF13855LRR_84154440.06813.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JWM0拟南芥sp|F4JWM0|DSC2_ARATH Disease resistance-like protein DSC233.700%Swiss-Prot中等置信

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