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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G134640
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 34780346-34783707 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1910 bp · TkA02G134640|TK1151|cDNA

GGAACTATATTCGTAATTCACTTGAGAAAGAAGCATCATCAAAACCCTAAAACCTATTCATTGCCGCATTGTTGTGGGTCTCGACTCTCAACCTCCCATTTTCCATTTTCGATTAGCAGGCGGCATAGAACCTGGATTCGCAGCAACTTTGATTAGAGAAAAATGGTTAAGAAGAAAGAGAGGTCCGTGAACGTTTCGGGAAAGCCAAAGCACTCTCTCGATGTCAACAGAGATGCCGGCAACAAGAACAAAAGCGGCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1563 bp · TkA02G134640|TK1151|CDS

ATGGTTAAGAAGAAAGAGAGGTCCGTGAACGTTTCGGGAAAGCCAAAGCACTCTCTCGATGTCAACAGAGATGCCGGCAACAAGAACAAAAGCGGCGGCACCGCCCGTACCTCCGCCACCGTTCGTCGTCTTAAGATGTACAAGACGAGGCCGAAGCGTGACTCCAAAGGAACCATTCTCAAACACGAATTGCAGTCAAAGGAGTTGCCTTCTACTCGTATACAACCTGATCGCCGCTGGTTCGGTAACACAAGAGTAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

520 aa · TkA02G134640|TK1151|PROTEIN

MVKKKERSVNVSGKPKHSLDVNRDAGNKNKSGGTARTSATVRRLKMYKTRPKRDSKGTILKHELQSKELPSTRIQPDRRWFGNTRVVNQKELEFFREELQSRLSSNYNVIMKERKLPMSLLNDHQKQARVHLLDTEPFADAFGPKGKRKRPKLVASDYESLLKRADGSHDAFEEKHGDEPEDPNADGFRDLVRHTMFEKGQSKRIWGELYKVIDSSDVIIQVLDARDPQGTRCRHLEKHLKEHCKHKHMILLLNKCDLTP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G134640
TK1151 IDTkA02G134640
OH-1004 IDLXL04_016490
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G134640
位置Chr02:34780346-34783707 (-)
描述Similar to NUG2: Nuclear/nucleolar GTPase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g52980 GTPase 参与 60S 前核糖体亚基的成熟。
Nuclear/nucleolar GTPase 2 proteins as a subfamily of YlqF/YawG GTPases function in pre-60S ribosomal subunit maturation of mono- and dicotyledonous plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.200816

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0352400 GTPase 参与 60S 前核糖体亚基的成熟。
Nuclear/nucleolar GTPase 2 proteins as a subfamily of YlqF/YawG GTPases function in pre-60S ribosomal subunit maturation of mono- and dicotyledonous plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.200816
UniProt: A2XGQ1 参与前 60S 核糖体亚基成熟的 GTP 酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016490 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042254 ribosome biogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0003924 GTPase activity 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0016787 hydrolase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52980
dosa:Os03g0352400
hsa:29889
mmu:230737
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.743
排名 1 · TkA02G134640 · TK1151
细胞质0.215
排名 2 · TkA02G134640 · TK1151
线粒体0.060
排名 3 · TkA02G134640 · TK1151
细胞膜0.042
排名 4 · TkA02G134640 · TK1151
内质网0.017
排名 5 · TkA02G134640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08153NGP1NT46-171 aa
PF00350Dynamin_N89-134 aa
PF00025Arf203-259 aa
PF01926MMR_HSR1206-255 aa
PF00009GTP_EFTU210-259 aa
PF00350Dynamin_N210-255 aa
PF02421FeoB_N214-258 aa
PF08477Roc214-257 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G134640PF08153NGP1NT461712.6e-47161.0
TkA02G134640PF00350Dynamin_N891340.001919.0
TkA02G134640PF00025Arf2032590.01415.6
TkA02G134640PF01926MMR_HSR12062554.7e-2072.5
TkA02G134640PF00009GTP_EFTU2102590.001518.9
TkA02G134640PF00350Dynamin_N2102550.001919.0
TkA02G134640PF02421FeoB_N2142581.3e-0628.8
TkA02G134640PF08477Roc2142570.01915.9
TkA02G134640PF03193RsgA_GTPase2333640.0003421.2
TkA02G134640PF00025Arf2993420.01415.6
TkA02G134640PF00009GTP_EFTU3083320.001518.9
TkA02G134640PF02421FeoB_N3113741.3e-0628.8
TkA02G134640PF01926MMR_HSR13123774.7e-2072.5
TkA02G134640PF00350Dynamin_N3123410.001919.0
TkA02G134640PF08477Roc3123340.01915.9
TkA02G134640PF00009GTP_EFTU3443730.001518.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C923拟南芥sp|Q9C923|NUG2_ARATH Nuclear/nucleolar GTPase 277.300%Swiss-Prot高置信
Q10LF7水稻sp|Q10LF7|NUG2_ORYSJ Nuclear/nucleolar GTPase 274.500%Swiss-Prot高置信
A2XGQ1水稻sp|A2XGQ1|NUG2_ORYSI Nuclear/nucleolar GTPase 274.500%Swiss-Prot高置信

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