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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G121900
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 31667877-31670099 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1812 bp · TkA02G121900|TK1151|cDNA

GCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCACTTAGCTGTTGCTAGCTGTCATAATCCTTTCTTCCATGTGACTCACCTCCCTCCTCCATCTGCCCTCCATCAAAACAATTCTACAATCCCCTATTTACATTCACTCTCAATTCTCAACTAATCCTCAACACCACTTGTTCATATATTCATACATGTTTGGTCGTTTTTGAAGGTTTTTGAAGGTCTTTCGGTTTTTAGCTTTGGAATTT...

921 bp · TkA02G121900|TK1151|CDS

ATGGCGCAATTGCCGCCAAAAGCGCCAACAATGGCGCAGAAATGGCCGTCGTTTTCGTACCAGACGATGCCGCCGATGATGCCGATTTCAGCCTCGCAGCCACCGAGCTGGATGGACGACTTCCTTGATTTCTCTTCAGCCAGGCGGAATGCTCACCGGAGATCCGCCAGCGATCCGATTGCGTTTGTGGAAACTCCGTTTATTAATGAATGTCGTAATTCCAATGCTAATGATCATCATCAGTCGTTGATACCTTGCTC...

306 aa · TkA02G121900|TK1151|PROTEIN

MAQLPPKAPTMAQKWPSFSYQTMPPMMPISASQPPSWMDDFLDFSSARRNAHRRSASDPIAFVETPFINECRNSNANDHHQSLIPCSNNNGFERLDDEQLSSMFSDDVTANLQSSSTPSEENSDNDEPRTSPPQEQLPSQLKNEPGEVEDGGNYEQDTDSLKAPFTFCSDGGTIVDPKRVKRILANRQSAQRSRVRKLHYISELERSVTNLQTEVSTLSPRVAFLDHQRLILNVDNSSLKQRIAALAQDKIFKDAHQEAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G121900
TK1151 IDTkA02G121900
OH-1004 IDLXL04_016581
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.346 / OH-1004 95.597
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G121900
位置Chr02:31667877-31670099 (-)
描述Similar to BZIP61: Basic leucine zipper 61
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0211800 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
Os02g0247100 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
Os01g0756200 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_016581 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G42380
ath:AT3G58120
dosa:Os01g0211800
dosa:Os01g0756200
dosa:Os02g0247100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.972
排名 1 · TkA02G121900 · TK1151
细胞质0.102
排名 2 · TkA02G121900 · TK1151
细胞膜0.029
排名 3 · TkA02G121900 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA02G121900 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA02G121900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03131bZIP_Maf95-115 aa
PF08232Striatin115-157 aa
PF07716bZIP_2176-223 aa
PF00170bZIP_1178-223 aa
PF03131bZIP_Maf178-229 aa
PF16526CLZ178-193 aa
PF25994HH_AprE187-285 aa
PF30935ZC2HC1C_CC187-215 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G121900PF03131bZIP_Maf951150.0001523.0
TkA02G121900PF08232Striatin1151570.09413.8
TkA02G121900PF07716bZIP_21762239.8e-0935.9
TkA02G121900PF00170bZIP_11782232.1e-0938.0
TkA02G121900PF03131bZIP_Maf1782290.0001523.0
TkA02G121900PF16526CLZ1781935.28.2
TkA02G121900PF25994HH_AprE1872850.1313.1
TkA02G121900PF30935ZC2HC1C_CC1872150.4811.2
TkA02G121900PF26022CC_Liprin_beta1932480.03415.1
TkA02G121900PF04977DivIC1962280.3811.3
TkA02G121900PF05837CENP-H1972720.6610.5
TkA02G121900PF06156YabA2002730.01716.4
TkA02G121900PF28175T4SS_LegC2C72032800.07112.7
TkA02G121900PF16526CLZ2032475.28.2
TkA02G121900PF00170bZIP_12322472.1e-0938.0
TkA02G121900PF07716bZIP_22322489.8e-0935.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IN23拟南芥sp|F4IN23|BZP34_ARATH Basic leucine zipper 3448.900%Swiss-Prot中等置信
Q9M2K4拟南芥sp|Q9M2K4|BZP61_ARATH Basic leucine zipper 6145.500%Swiss-Prot中等置信
Q5QNI5水稻sp|Q5QNI5|BZP02_ORYSJ Basic leucine zipper 243.500%Swiss-Prot中等置信
Q6K3R9水稻sp|Q6K3R9|BZP19_ORYSJ Basic leucine zipper 1942.700%Swiss-Prot中等置信
Q5JMK6水稻sp|Q5JMK6|BZP06_ORYSJ Basic leucine zipper 641.200%Swiss-Prot中等置信

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