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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G119360
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 31131370-31132227 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

571 bp · TkA02G119360|TK1151|cDNA

CGAACTTTCAGGTTCAATGGCCCGTGAATGGACAGGGATTCAGCTCTTTCCTCTTGCAACCCAAACAAAGTTGTTGGAACTACTCGGAGATTTAAAAACGAAGGAAAGAACCAGTTTGACTATTCTGGTAATGGGAAAGGGCGGTGTAGGTAAATCTTCAACCATAAACTCCATTCTTGGTGAAAGAGCAGTTTCAGTCAGTGCCTTCCAGTCAGATGTACCAAGACCCGTGATGGTATCCCGTTCATGGTCTGGATTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

555 bp · TkA02G119360|TK1151|CDS

ATGGCCCGTGAATGGACAGGGATTCAGCTCTTTCCTCTTGCAACCCAAACAAAGTTGTTGGAACTACTCGGAGATTTAAAAACGAAGGAAAGAACCAGTTTGACTATTCTGGTAATGGGAAAGGGCGGTGTAGGTAAATCTTCAACCATAAACTCCATTCTTGGTGAAAGAGCAGTTTCAGTCAGTGCCTTCCAGTCAGATGTACCAAGACCCGTGATGGTATCCCGTTCATGGTCTGGATTCACATTGAACATCATAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

185 aa · TkA02G119360|TK1151|PROTEIN

MAREWTGIQLFPLATQTKLLELLGDLKTKERTSLTILVMGKGGVGKSSTINSILGERAVSVSAFQSDVPRPVMVSRSWSGFTLNIIDTPGIVEGGYVNDQVLDLIKRFLLNKTIDVLLYVDRLDAYRVDNLDKQIVKAITESFGKEVWSKGMVVLTHAQLTPPDCLSYDDFFGKRSEALLKVVES

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G119360
TK1151 IDTkA02G119360
OH-1004 IDLXL04_021778
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 53.468
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G119360
位置Chr02:31131370-31132227 (-)
描述Similar to TOC34: Translocase of chloroplast 34
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g05000 GTPase 参与蛋白质前体导入叶绿体。
Two Toc34 homologues with different properties.2003 · DOI: 10.1021/bi034001q
The Arabidopsis ppi1 mutant is specifically defective in the expression, chloroplast import, and accumulation of photosynthetic proteins.2003 · DOI: 10.1105/tpc.012955
An outer envelope membrane component of the plastid protein import apparatus plays an essential role in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02024.x
Deletion of core components of the plastid protein import machinery causes differential arrest of embryo development in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1055/s-2005-873044
At1g02280 GTPase 参与蛋白质前体导入叶绿体。
Chloroplast protein translocon components atToc159 and atToc33 are not essential for chloroplast biogenesis in guard cells and root cells.2001 · DOI: 10.1104/pp.127.1.90
Two Toc34 homologues with different properties.2003 · DOI: 10.1021/bi034001q
Unusual nucleotide-binding properties of the chloroplast protein import receptor, atToc33.2003 · DOI: 10.1016/s0014-5793(03)00478-2
Dimerization of Toc-GTPases at the chloroplast protein import machinery.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m305946200
The Arabidopsis ppi1 mutant is specifically defective in the expression, chloroplast import, and accumulation of photosynthetic proteins.2003 · DOI: 10.1105/tpc.012955
The roles of toc34 and toc75 in targeting the toc159 preprotein receptor to chloroplasts.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m307873200
An outer envelope membrane component of the plastid protein import apparatus plays an essential role in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02024.x
In vivo assessment of the significance of phosphorylation of the Arabidopsis chloroplast protein import receptor, atToc33.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2005.12.055
Phospho-mimicry mutant of atToc33 affects early development of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1016/j.febslet.2007.11.071

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021778 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0019750 chloroplast localization 生物过程
GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程
GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009707 chloroplast outer membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0003924 GTPase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02280
ath:AT3G16620
ath:AT5G05000
cre:CHLRE_06g252200v5
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.469
排名 1 · TkA02G119360 · TK1151
细胞核0.271
排名 2 · TkA02G119360 · TK1151
细胞膜0.212
排名 3 · TkA02G119360 · TK1151
内质网0.093
排名 4 · TkA02G119360 · TK1151
线粒体0.092
排名 5 · TkA02G119360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00158Sigma54_activat8-25 aa
PF00158Sigma54_activat16-54 aa
PF13191AAA_1618-54 aa
PF00931NB-ARC19-77 aa
PF03193RsgA_GTPase20-93 aa
PF05049IIGP26-53 aa
PF07693KAP_NTPase30-152 aa
PF00735Septin32-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G119360PF00158Sigma54_activat8250.2611.7
TkA02G119360PF00158Sigma54_activat16540.2611.7
TkA02G119360PF13191AAA_1618540.003518.6
TkA02G119360PF00931NB-ARC19770.07613.3
TkA02G119360PF03193RsgA_GTPase20939.1e-0832.8
TkA02G119360PF05049IIGP26530.0314.1
TkA02G119360PF07693KAP_NTPase301520.01215.5
TkA02G119360PF00735Septin321090.001818.3
TkA02G119360PF04548AIG1341841.1e-33117.0
TkA02G119360PF00009GTP_EFTU34550.1612.2
TkA02G119360PF02421FeoB_N351200.003117.8
TkA02G119360PF01926MMR_HSR1361433.8e-1247.1
TkA02G119360PF00350Dynamin_N36593.4e-0524.6
TkA02G119360PF04670Gtr1_RagA361250.0813.1
TkA02G119360PF00142Fer4_NifH36530.1112.7
TkA02G119360PF00910RNA_helicase36560.1813.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38906拟南芥sp|Q38906|TOC34_ARATH Translocase of chloroplast 34, chloroplastic68.300%Swiss-Prot高置信
O23680拟南芥sp|O23680|TOC33_ARATH Translocase of chloroplast 33, chloroplastic64.900%Swiss-Prot高置信

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