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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G116080
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 30296051-30296410 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

360 bp · TkA02G116080|TK1151|cDNA

ATGCTTGTAAAAGCGGATGATTTTTTTTATAGTGGACTCCAACTTATGGGAAATACTTCGAATGTGGTTGGGTTTGCAGTGACTCCTGTGACTGTAGTAGAGTTGCCGGGACTTAACACTCTTGGTATTTCAATGGCACGTTTAGACTTTGCCCCACAGGGTATAAACCCCCCTCACACACACCCTCGGGCCACTGAAATTTTGACTGTTTTGGAAGGCAGTATTCAAGTCAAATTTGTTACATCTAACCGTGAAAATCG...

CDS

下载 CDS FASTA

360 bp · TkA02G116080|TK1151|CDS

ATGCTTGTAAAAGCGGATGATTTTTTTTATAGTGGACTCCAACTTATGGGAAATACTTCGAATGTGGTTGGGTTTGCAGTGACTCCTGTGACTGTAGTAGAGTTGCCGGGACTTAACACTCTTGGTATTTCAATGGCACGTTTAGACTTTGCCCCACAGGGTATAAACCCCCCTCACACACACCCTCGGGCCACTGAAATTTTGACTGTTTTGGAAGGCAGTATTCAAGTCAAATTTGTTACATCTAACCGTGAAAATCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

119 aa · TkA02G116080|TK1151|PROTEIN

MLVKADDFFYSGLQLMGNTSNVVGFAVTPVTVVELPGLNTLGISMARLDFAPQGINPPHTHPRATEILTVLEGSIQVKFVTSNRENRLITKVLNKGDVFVFSQGLIHFQKTSLLPIDRN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G116080
TK1151 IDTkA02G116080
OH-1004 IDLXL04_019412
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)77.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.597 / OH-1004 10.206
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G116080
位置Chr02:30296051-30296410 (-)
描述Similar to Os02g0491600: Putative germin-like protein 2-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0491800 可能在植物防御中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0491600 可能在植物防御中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0491700 可能在植物防御中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os08g0189100 在广谱抗病性中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019412 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0030145 manganese ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
dosa:Os02g0491600
dosa:Os02g0491700
dosa:Os02g0491800
dosa:Os08g0189100
dosa:Os08g0189850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.777
排名 1 · TkA02G116080 · TK1151
细胞质0.065
排名 2 · TkA02G116080 · TK1151
溶酶体／液泡0.058
排名 3 · TkA02G116080 · TK1151
内质网0.037
排名 4 · TkA02G116080 · TK1151
细胞核0.016
排名 5 · TkA02G116080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00027cNMP_binding7-36 aa
PF00190Cupin_116-110 aa
PF07847PCO_ADO29-83 aa
PF19591DUF609640-97 aa
PF07883Cupin_248-107 aa
PF19480DUF601652-80 aa
PF05899Cupin_364-105 aa
PF00027cNMP_binding64-99 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G116080PF00027cNMP_binding7360.1512.7
TkA02G116080PF00190Cupin_1161105e-34117.8
TkA02G116080PF07847PCO_ADO29830.1112.6
TkA02G116080PF19591DUF609640970.2212.5
TkA02G116080PF07883Cupin_2481077.4e-0832.7
TkA02G116080PF19480DUF601652800.02115.2
TkA02G116080PF05899Cupin_3641050.01815.4
TkA02G116080PF00027cNMP_binding64990.1512.7
TkA02G116080PF22061CSN7_HB_subdom881020.2611.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6K5P8水稻sp|Q6K5P8|GL23_ORYSJ Putative germin-like protein 2-371.000%Swiss-Prot高置信
Q6K5Q0水稻sp|Q6K5Q0|GL21_ORYSJ Putative germin-like protein 2-171.000%Swiss-Prot高置信
Q6K5P9水稻sp|Q6K5P9|GL22_ORYSJ Putative germin-like protein 2-268.200%Swiss-Prot高置信
Q6YZA9水稻sp|Q6YZA9|GL82_ORYSJ Germin-like protein 8-269.100%Swiss-Prot高置信

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