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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G112470
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 29466368-29470792 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2543 bp · TkA02G112470|TK1151|cDNA

CGAAGAGTGGATAAAACAACTTCCGACCGACCCTCTCTTTCATCTATTTAATCAAACACCCCCTACACATATCCATTTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACGTCAGCCACCACCACCACCACCGCAGATCTTCAAATTGAAAAGCATCTCCCCTATTTCCTCGGCCACGATTCAGCATTTTTCAGCTACTGATTGCAAAATTCAGTTGTATAAAATTTGCTTGTGTCGTTGATAGTGGGTGCCGAGCCTTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1746 bp · TkA02G112470|TK1151|CDS

ATGCAACAAGATCCGCGCAGAAAGAATCCAAAAGAGGTTGAATTCTTCACGGAGTACGGTGAATCAAATCGATACAAAATCTTGGAGATCATAGGGAAGGGAAGTTACGGAGTCGTTTGTTCCGCTATTGACACACACACCGGGGAAAAAGTTGCAATCAAGAAAATAACCGACATCTTTGAACATGCCTCCGACGCTATTCGTATCTTGCGTGAAATCAAATTACTCAGGCTTTTAAGACATCCTGATATCGTTGAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

581 aa · TkA02G112470|TK1151|PROTEIN

MQQDPRRKNPKEVEFFTEYGESNRYKILEIIGKGSYGVVCSAIDTHTGEKVAIKKITDIFEHASDAIRILREIKLLRLLRHPDIVEIKRIMLPPSRRAFKDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTHEHHRFFLYQMLRALKYMHTANVYHRDLKPKNILANANCKLKICDFGLARVAFNDAPTAVLWTDYVATRWYRAPELCGSFSSKYTPAIDIWSIGCIFAEVLTGKPLFPGKSVVHQLELITDLLGTPSADTISGVRN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G112470
TK1151 IDTkA02G112470
OH-1004 IDLXL04_037820
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)70.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.074 / OH-1004 96.072
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G112470
位置Chr02:29466368-29470792 (+)
描述Similar to MPK18: Mitogen-activated protein kinase 18
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14720 丝裂原活化蛋白激酶19。 暂无已核实直接文献
At1g53510 丝裂原激活蛋白激酶 ，受 PHS1 和 MAPKKK20 特异性调节，并可能通过调节微管动态不稳定性介导调节皮质微管功能的信号传导。
Arabidopsis mitogen-activated protein kinase MPK18 mediates cortical microtubule functions in plant cells.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03895.x
The Arabidopsis Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 20 (MKKK20) Acts Upstream of MKK3 and MPK18 in Two Separate Signaling Pathways Involved in Root Microtubule Functions.2017 · DOI: 10.3389/fpls.2017.01352
At2g42880 丝裂原活化蛋白激酶 20。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0629900 丝裂原活化蛋白激酶10。 暂无已核实直接文献
Os01g0665200 丝裂原活化蛋白激酶8。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037820 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004707 MAP kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53510
ath:AT2G42880
ath:AT3G14720
dosa:Os01g0629900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.702
排名 1 · TkA02G112470 · TK1151
细胞核0.293
排名 2 · TkA02G112470 · TK1151
细胞膜0.145
排名 3 · TkA02G112470 · TK1151
高尔基体0.037
排名 4 · TkA02G112470 · TK1151
线粒体0.033
排名 5 · TkA02G112470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13095FTA23-42 aa
PF14531Kinase-like24-76 aa
PF00069Pkinase25-316 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr27-241 aa
PF03109ABC134-55 aa
PF06293Kdo59-163 aa
PF01636APH60-145 aa
PF14531Kinase-like107-219 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G112470PF13095FTA23420.008616.5
TkA02G112470PF14531Kinase-like24760.0003220.8
TkA02G112470PF00069Pkinase253161.1e-65222.4
TkA02G112470PF07714PK_Tyr_Ser-Thr272412.3e-31109.8
TkA02G112470PF03109ABC134550.1112.3
TkA02G112470PF06293Kdo591637.8e-0626.2
TkA02G112470PF01636APH601450.4610.9
TkA02G112470PF14531Kinase-like1072190.0003220.8
TkA02G112470PF01636APH1071760.4610.9
TkA02G112470PF13095FTA21311730.008616.5
TkA02G112470PF12330Haspin_kinase1321880.001118.8
TkA02G112470PF03109ABC11391740.1112.3
TkA02G112470PF01636APH2933370.4610.9
TkA02G112470PF06293Kdo3313527.8e-0626.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LUC3拟南芥sp|Q9LUC3|MPK19_ARATH Mitogen-activated protein kinase 1981.500%Swiss-Prot高置信
Q9C5C0拟南芥sp|Q9C5C0|MPK18_ARATH Mitogen-activated protein kinase 1880.800%Swiss-Prot高置信
Q9SJG9拟南芥sp|Q9SJG9|MPK20_ARATH Mitogen-activated protein kinase 2070.000%Swiss-Prot高置信
Q5ZCI1水稻sp|Q5ZCI1|MPK10_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 1071.500%Swiss-Prot高置信
Q5SN53水稻sp|Q5SN53|MPK8_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 880.900%Swiss-Prot高置信

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