本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G093190
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 24314133-24318402 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

745 bp · TkA02G093190|TK1151|cDNA

GTCAAATAGTAGTATACTTTTTCCTTAATTGTAAAACTTCATTTTCCCACGTTCTTCCTTTGCGTTAACTCCTATCTGCAAATCAACAAGAAAAAAAAACCTTGCTACCGTCGTTCCATGGCGATTCGACCTAAGCGCACTGATACCCAGAAAAATAACCCCATCTCCCAGACACCAGATTCTGTAACCTTCTCTATTAATGTCAAAGTATATCCCTTGATATCAACTGATTACAAACGAATAGTATCCGATGGGATCAT...

1539 bp · TkA02G093190|TK1151|CDS

ATGGGATCATCATCGGCAGATTCAATCTCTCCCCAATCATCAGCCACCGGAGAAAATGTAATAGTGGTGATGAACGGAAACAGGGGAAAGGGAAACCTCGATGCTCTAGAGTGGGCGATTAAGTATATCGTTGGCCCAAATGACACCGTCGTTGTTCTCGGAGTGTTGCCGGAAATCGGCAGGAAACCCACTCCTTCTTGTTTACCTTTTCACCTCGGAATCGGCACCTCCGGCATCTGGATAAAACTCGAGTTTTCACA...

512 aa · TkA02G093190|TK1151|PROTEIN

MGSSSADSISPQSSATGENVIVVMNGNRGKGNLDALEWAIKYIVGPNDTVVVLGVLPEIGRKPTPSCLPFHLGIGTSGIWIKLEFSHNEMTPSELQQAIGRKKREYQKFLQPYYHHCKKREVKLDIRLAAGYESKKLAVEEAEKLDPRWIVLDGYLKKDKEYIHKNVDCHVALLKEKGVATLIPSKITGPECEEWQTVCKKIDDQAFTDDDIMEEEIKEPNSPKQTPLTPSSYPLSWRTGFPRAFSLDEIEEITNGFKNV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G093190
TK1151 IDTkA02G093190
OH-1004 IDLXL04_016911
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G093190
位置Chr02:24314133-24318402 (+)
描述Similar to CCR1: Serine/threonine-protein kinase-like protein CCR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g09780 活性低的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
At2g39180 活性低的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
At1g06700 类受体胞质激酶(RLCK),通过磷酸化并激活ABA受体(例如PYR1/RCAR11、PYL1/RCAR12、PYL3/RCAR13和PYL2/RCAR14)以触发脱水响应的脱落酸(ABA)信号传导,支持其单体化并增强ABA结合亲和力;它们反过来抑制作为ABA响应负调控因子的PP2C蛋白磷酸酶。
At5g10520 受体样胞质丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RBK1。 暂无已核实直接文献
At1g01540 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g01540。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0637800 受体蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_016911 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071369 cellular response to ethylene stimulus 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48210
ath:AT3G09780
ath:AT5G10520
ath:AT5G38560
sly:544006
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.541
排名 1 · TkA02G093190 · TK1151
细胞质0.338
排名 2 · TkA02G093190 · TK1151
细胞核0.289
排名 3 · TkA02G093190 · TK1151
内质网0.042
排名 4 · TkA02G093190 · TK1151
高尔基体0.032
排名 5 · TkA02G093190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr155-179 aa
PF09207Yeast-kill-tox267-287 aa
PF00069Pkinase290-364 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr292-364 aa
PF09207Yeast-kill-tox327-369 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr423-437 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G093190PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1551796.5e-0626.4
TkA02G093190PF09207Yeast-kill-tox2672870.1113.9
TkA02G093190PF00069Pkinase2903640.01515.5
TkA02G093190PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2923646.5e-0626.4
TkA02G093190PF09207Yeast-kill-tox3273690.1113.9
TkA02G093190PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4234376.5e-0626.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9S7D9拟南芥sp|Q9S7D9|ACCR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein CCR128.200%Swiss-Prot低置信
O80963拟南芥sp|O80963|ACCR2_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein CCR226.900%Swiss-Prot低置信
Q8H1G6拟南芥sp|Q8H1G6|CARK7_ARATH Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 727.600%Swiss-Prot低置信
Q8H1D6拟南芥sp|Q8H1D6|RBK1_ARATH Receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK127.900%Swiss-Prot低置信
Q3EDL4拟南芥sp|Q3EDL4|Y1154_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g0154026.100%Swiss-Prot低置信
Q75J39水稻sp|Q75J39|CKI4_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase-like protein CR424.900%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看