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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G079690
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 20730560-20736200 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2255 bp · TkA02G079690|TK1151|cDNA

TTGAATAAGTCGTCATAGTGGTTCTATTTCATTGGGGTTATTTTTAGTATTTGACATTGTAGTTGCAGTCTTTTTTTTTCAACGTGAATAACAGCAGAAAATTGCCCCAAAAGACCTTCATCTTCTTCCTCTGTTTTACCCTGTTCTTTGTTGTTTCTTCACAGGAAAAGAACAGCCCCTGTTTTAGTTGAACAATAAACACAATCGAGTATTCTTCAATTGTTGTTTCGACGTTCCAAAAACCATGTCTGATCTTCTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1953 bp · TkA02G079690|TK1151|CDS

ATGTCTGATCTTCTTTACTCTCTCCTCCTCTTCCCCTTCTTCTTCATCATCCCCATTGCTGCTCAATCCAATGATTCCAGTTACCCCAACTGCCGTCCATACAGATGCAGAAACATCAATATCAGCTACCCTTTTTGGAGGATCGGCAGTGAATCCACCACCCAGTTCTGCGGTTATCCTGGTTTTGGAATTAACTGTTTCAACGACGGTGAACGTTCTTTTCCAAGTATTACTTTGGGGAACGATTCTTACTCTATCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

650 aa · TkA02G079690|TK1151|PROTEIN

MSDLLYSLLLFPFFFIIPIAAQSNDSSYPNCRPYRCRNINISYPFWRIGSESTTQFCGYPGFGINCFNDGERSFPSITLGNDSYSIPNIIYERESIVLIDDDVSNADSIMDCPRVRHNITIGTLPFVFVDQNVNLSFHFNCTGVPSFASEIPCLSSPIYKSCVNRVNSEPSNFNWEEFSCDEDVVTTVLDVSGSESRLGTEFIGALWGGFELRWGRNEDCEKCEESGGRCGYNRIMKELLCFCSGGTTSLDHCRGSTQTA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G079690
TK1151 IDTkA02G079690
OH-1004 IDLXL04_020183
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 83.385 / OH-1004 90.476
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G079690
位置Chr02:20730560-20736200 (+)
描述Similar to LRK10L-2.8: LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g38260 LEAF RUST 10疾病抗性基因座受体样蛋白激酶样2.1。 暂无已核实直接文献
At1g67000 叶锈病10号抗病位点受体样蛋白激酶样2.8。 暂无已核实直接文献
At1g66910 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 2.5。 暂无已核实直接文献
At1g66930 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 2.7。 暂无已核实直接文献
At1g66920 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 2.4。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020183 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030247 polysaccharide binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G66930
ath:AT1G67000
ath:AT5G38260
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.860
排名 1 · TkA02G079690 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkA02G079690 · TK1151
细胞质0.075
排名 3 · TkA02G079690 · TK1151
细胞核0.051
排名 4 · TkA02G079690 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA02G079690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947GUB_WAK_bind31-99 aa
PF06636DUF115781-101 aa
PF14380WAK_assoc168-245 aa
PF13947GUB_WAK_bind177-192 aa
PF10140YukC271-293 aa
PF06636DUF1157272-333 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr334-607 aa
PF00069Pkinase335-606 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G079690PF13947GUB_WAK_bind31998.1e-1349.3
TkA02G079690PF06636DUF1157811010.3910.2
TkA02G079690PF14380WAK_assoc1682451.7e-1455.1
TkA02G079690PF13947GUB_WAK_bind1771928.1e-1349.3
TkA02G079690PF10140YukC2712930.2311.0
TkA02G079690PF06636DUF11572723330.3910.2
TkA02G079690PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3346072.5e-45155.5
TkA02G079690PF00069Pkinase3356061.6e-44153.0
TkA02G079690PF03109ABC13403620.002417.8
TkA02G079690PF03109ABC14474860.002417.8
TkA02G079690PF17667Pkinase_fungal4515080.1811.2
TkA02G079690PF14531Kinase-like4535300.07113.1
TkA02G079690PF10140YukC4544800.2311.0
TkA02G079690PF13947GUB_WAK_bind5475588.1e-1349.3
TkA02G079690PF10140YukC5485790.2311.0
TkA02G079690PF14531Kinase-like5585990.07113.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FF31拟南芥sp|Q9FF31|LRL21_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.139.700%Swiss-Prot中等置信
Q3ECH2拟南芥sp|Q3ECH2|LRL28_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.837.400%Swiss-Prot中等置信
F4HQ20拟南芥sp|F4HQ20|LRL25_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.538.200%Swiss-Prot中等置信
F4HQ23拟南芥sp|F4HQ23|LRL27_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.738.400%Swiss-Prot中等置信
F4HQ22拟南芥sp|F4HQ22|LRL24_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.436.900%Swiss-Prot中等置信

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