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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G073590
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 19047791-19052013 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2318 bp · TkA02G073590|TK1151|cDNA

TCAAAATTATACTAAAATAGTTCACGAATATACCCGCCCCTGCGCATAATAGCGCAGTGACTTATGCCCTCCGTTTACGTTCGTCTCCGTCTAAAACCCTTTGTTTTCATAAAACCCTTGGAAACCCCTATTGCCACCGATACCGGAAATTCGTCGACTCTCCTCCGCCGACATCAACGATTTAAATACTATACCTTTAGAAATCACCTTCTAATCGGTGAATCGATCATCGATCGATGTCGTTAAAAGCTATAAACCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1830 bp · TkA02G073590|TK1151|CDS

ATGTCGTTAAAAGCTATAAACCTTGAGAAAGTCAAAACCCATGTCTCAAACCCAAAAGTATGGATCGTGATCGGCGTCAGCGTCGCCGGCATATTGATCCTCACCGCAGAGACTCGGAGGCGCCGATTAAAAGGTAGGTATGCGATAAAAGAAGACTATGGTGCTTTTATAGAGCGGTTCGAGTTACTTCCATTTCCTCAGCCGCCTCCTCCCGCCGCAAAACAGCCTCTTTCTGGCCTAACTTTCGCCATCAGCGACGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

609 aa · TkA02G073590|TK1151|PROTEIN

MSLKAINLEKVKTHVSNPKVWIVIGVSVAGILILTAETRRRRLKGRYAIKEDYGAFIERFELLPFPQPPPPAAKQPLSGLTFAISDVFDVKEYVTGFGNPDWKRTHEEAGKTAIVVTTLLKDGATCVGRTVMDELSFGTTGENSHYGTPTSPAMPSYIPGGSSSGSAVAVAAELVDFSIGTDTLGGVRIPASFCGVLGFRPSHGVVSTIGVLPNSQSLDTVGIFARDPSVLHRVGHVLLRLNPLEPRRTKRIIVADDLFQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G073590
TK1151 IDTkA02G073590
OH-1004 IDLXL04_017125
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.507 / OH-1004 61.460
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G073590
位置Chr02:19047791-19052013 (-)
描述Similar to OM64: Outer envelope protein 64, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g09420 分子伴侣受体，介导Hsp90依赖的蛋白质靶向到线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g17970 伴侣受体介导 Hsp90 依赖性蛋白靶向叶绿体。
Toc64/OEP64 is not essential for the efficient import of proteins into chloroplasts in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03207.x
At1g08980 酰胺酶参与生长素生物合成。
Molecular cloning and characterization of an amidase from Arabidopsis thaliana capable of converting indole-3-acetamide into the plant growth hormone, indole-3-acetic acid.2003 · DOI: 10.1016/s0031-9422(02)00563-0
Characterization of Four Bifunctional Plant IAM/PAM-Amidohydrolases Capable of Contributing to Auxin Biosynthesis.2014 · DOI: 10.3390/plants3030324

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0118100 参与生长素生物合成的酰胺酶（可能性）。
Characterization of Four Bifunctional Plant IAM/PAM-Amidohydrolases Capable of Contributing to Auxin Biosynthesis.2014 · DOI: 10.3390/plants3030324
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017125 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程
GO:0009684 indoleacetic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0030150 protein import into mitochondrial matrix 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08980
ath:AT3G17970
ath:AT5G09420
dosa:Os04g0118100
osa:4334958
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.674
排名 1 · TkA02G073590 · TK1151
细胞质0.201
排名 2 · TkA02G073590 · TK1151
过氧化物酶体0.124
排名 3 · TkA02G073590 · TK1151
细胞核0.080
排名 4 · TkA02G073590 · TK1151
细胞膜0.056
排名 5 · TkA02G073590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23489V-ATPase_su_f12-35 aa
PF01425Amidase73-460 aa
PF13424TPR_12312-333 aa
PF25068ARM_TT21_4th315-343 aa
PF23489V-ATPase_su_f332-361 aa
PF13414TPR_11360-373 aa
PF25575TPR_BSK1_C492-559 aa
PF00515TPR_1494-526 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G073590PF23489V-ATPase_su_f12350.2512.3
TkA02G073590PF01425Amidase734604.9e-58197.9
TkA02G073590PF13424TPR_123123330.001119.9
TkA02G073590PF25068ARM_TT21_4th3153430.001219.8
TkA02G073590PF23489V-ATPase_su_f3323610.2512.3
TkA02G073590PF13414TPR_113603733e-1143.6
TkA02G073590PF25575TPR_BSK1_C4925594e-0627.4
TkA02G073590PF00515TPR_14945268e-1657.8
TkA02G073590PF07719TPR_24945265.2e-1451.8
TkA02G073590PF13424TPR_124955240.001119.9
TkA02G073590PF13428TPR_144955340.1113.9
TkA02G073590PF13432TPR_164995570.0001123.3
TkA02G073590PF13414TPR_115005413e-1143.6
TkA02G073590PF13181TPR_85005263.8e-0524.2
TkA02G073590PF25068ARM_TT21_4th5005670.001219.8
TkA02G073590PF13371TPR_95075576.9e-0523.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4KCL7拟南芥sp|F4KCL7|OE64M_ARATH Outer envelope protein 64, mitochondrial64.000%Swiss-Prot高置信
Q9LVH5拟南芥sp|Q9LVH5|OE64C_ARATH Outer envelope protein 64, chloroplastic51.700%Swiss-Prot高置信
Q9FR37拟南芥sp|Q9FR37|AMI1_ARATH Amidase 151.000%Swiss-Prot中等置信
Q7XTK3水稻sp|Q7XTK3|AMI1_ORYSJ Amidase 148.000%Swiss-Prot中等置信

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