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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G063590
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 16548118-16550190 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1545 bp · TkA02G063590|TK1151|cDNA

ATGTCCAGCTTAACATGCTTCCTTTTCCTTCTCACCTTCACCCATTATGCTGCTTCGCTTAATTTCAGTTTTCCAAATATTACTCCAGAAAATGACAAGGAGATAGTATTGTCAGGTGATGGAGCATATATGTCTGACGACGGGATCCAGGTGACTCCAGAACGTTATCGTAAATGGTCAGCAGGCAGGGCGACATACTTCAGCCCGCTTCATCTATGGGACAAGAACTCTACTCAGCTAGCCAGCTTCTCTACAAGTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1545 bp · TkA02G063590|TK1151|CDS

ATGTCCAGCTTAACATGCTTCCTTTTCCTTCTCACCTTCACCCATTATGCTGCTTCGCTTAATTTCAGTTTTCCAAATATTACTCCAGAAAATGACAAGGAGATAGTATTGTCAGGTGATGGAGCATATATGTCTGACGACGGGATCCAGGTGACTCCAGAACGTTATCGTAAATGGTCAGCAGGCAGGGCGACATACTTCAGCCCGCTTCATCTATGGGACAAGAACTCTACTCAGCTAGCCAGCTTCTCTACAAGTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

514 aa · TkA02G063590|TK1151|PROTEIN

MSSLTCFLFLLTFTHYAASLNFSFPNITPENDKEIVLSGDGAYMSDDGIQVTPERYRKWSAGRATYFSPLHLWDKNSTQLASFSTSFTFVIDSYQNVNYGDGLTFFLAENRSMLESNNLSNVSFVAVEFDTFYNPQRDPINHTHVGININNLSSVSYAEWAADIYNRQECQASIKYDSVSKNLSSVKGKMGIGYIVGLIAGGCLIFALLVIVTIVCWKKWKNKGDEMEEPGSGVKMNTEFEMSTGPRRFSYRVLARSTGG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G063590
TK1151 IDTkA02G063590
OH-1004 IDLXL04_017242
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)67.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.693 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G063590
位置Chr02:16548118-16550190 (-)
描述Similar to LECRK91: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g10530 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At5g65600 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At5g06740 可能的L型凝集素结构域受体激酶 S.5。 暂无已核实直接文献
At5g55830 参与对病原卵菌马铃薯晚疫病菌和辣椒晚疫病菌的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At4g02410 含L型凝集素结构域的受体激酶 IV.3。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017242 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G55550
ath:AT4G02410
ath:AT5G10530
ath:AT5G55830
ath:AT5G65600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.822
排名 1 · TkA02G063590 · TK1151
内质网0.107
排名 2 · TkA02G063590 · TK1151
细胞质0.079
排名 3 · TkA02G063590 · TK1151
细胞核0.046
排名 4 · TkA02G063590 · TK1151
溶酶体／液泡0.045
排名 5 · TkA02G063590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB19-184 aa
PF18483Lectin_L-type_dom57-182 aa
PF03388Lectin_leg-like72-158 aa
PF16101PRIMA1195-244 aa
PF00069Pkinase264-282 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr264-279 aa
PF00069Pkinase280-447 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr280-447 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G063590PF00139Lectin_legB191845.3e-40138.2
TkA02G063590PF18483Lectin_L-type_dom571820.001619.1
TkA02G063590PF03388Lectin_leg-like721580.001119.1
TkA02G063590PF16101PRIMA11952440.113.1
TkA02G063590PF00069Pkinase2642822.4e-28100.0
TkA02G063590PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2642791.3e-2487.7
TkA02G063590PF00069Pkinase2804472.4e-28100.0
TkA02G063590PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2804471.3e-2487.7
TkA02G063590PF01636APH2883150.1912.2
TkA02G063590PF17667Pkinase_fungal2983660.007615.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LXA5拟南芥sp|Q9LXA5|LRK91_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.136.500%Swiss-Prot中等置信
Q9LSL5拟南芥sp|Q9LSL5|LRK92_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.257.400%Swiss-Prot低置信
Q9FG33拟南芥sp|Q9FG33|LRKS5_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.529.400%Swiss-Prot低置信
Q9FHG4拟南芥sp|Q9FHG4|LRKS7_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.753.200%Swiss-Prot低置信
O81292拟南芥sp|O81292|LRK43_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.353.600%Swiss-Prot低置信

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