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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G054890
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 14343179-14343812 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

561 bp · TkA02G054890|TK1151|cDNA

ATGGCTGCCATTACACCTGCTCTAGAACAACTGTGTAAGAAGAAGGAAGAGAGGGTGAAGAAGTTTAAAGATGCCCTGACACAAATACAAAAGATCCGTGGAGAAATTGCAGGGAGTGGTGACGTGGCAGGAAGCTTTGTAGTTGATGAGTCTGACATTTCCTTGAACAAGTTAGATGAATTTCATGATCATCTACAACAACTTCAGAAAGAAAAGAGTGAGAGATTGAACAAGGTTCTTGAATATGTGAACATAGTACA...

CDS

下载 CDS FASTA

561 bp · TkA02G054890|TK1151|CDS

ATGGCTGCCATTACACCTGCTCTAGAACAACTGTGTAAGAAGAAGGAAGAGAGGGTGAAGAAGTTTAAAGATGCCCTGACACAAATACAAAAGATCCGTGGAGAAATTGCAGGGAGTGGTGACGTGGCAGGAAGCTTTGTAGTTGATGAGTCTGACATTTCCTTGAACAAGTTAGATGAATTTCATGATCATCTACAACAACTTCAGAAAGAAAAGAGTGAGAGATTGAACAAGGTTCTTGAATATGTGAACATAGTACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

186 aa · TkA02G054890|TK1151|PROTEIN

MAAITPALEQLCKKKEERVKKFKDALTQIQKIRGEIAGSGDVAGSFVVDESDISLNKLDEFHDHLQQLQKEKSERLNKVLEYVNIVHDICGVVGIDFYETVTKVHPSMNDITDTQSKSISNDTLARLANNVLALKRGCIRYFTKNINLHLFQVPDTFSMVPNNPPLGNRRSSSESHYNNGNYFLLD

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G054890
TK1151 IDTkA02G054890
OH-1004 IDLXL04_016212
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 73.656 / OH-1004 24.464
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G054890
位置Chr02:14343179-14343812 (+)
描述Similar to MAP65-1: 65-kDa microtubule-associated protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55230 微管相关蛋白，可捆绑并稳定细胞皮质的相邻微管。
In vivo dynamics and differential microtubule-binding activities of MAP65 proteins.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.051623
Two microtubule-associated proteins of the Arabidopsis MAP65 family function differently on microtubules.2005 · DOI: 10.1104/pp.104.052456
Dynamic interaction of NtMAP65-1a with microtubules in vivo.2005 · DOI: 10.1242/jcs.02433
Modulated targeting of GFP-AtMAP65-1 to central spindle microtubules during division.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02464.x
Control of the AtMAP65-1 interaction with microtubules through the cell cycle.2006 · DOI: 10.1242/jcs.03051
AtMAP65-1 binds to tubulin dimers to promote tubulin assembly.2007 · DOI: 10.5483/bmbrep.2007.40.2.218
Two microtubule-associated proteins of Arabidopsis MAP65s promote antiparallel microtubule bundling.2008 · DOI: 10.1091/mbc.e08-04-0341
Arabidopsis homologs of nucleus- and phragmoplast-localized kinase 2 and 3 and mitogen-activated protein kinase 4 are essential for microtubule organization.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071746
At4g26760 稳定微管 的微管相关蛋白。
Arabidopsis microtubule-associated protein AtMAP65-2 acts as a microtubule stabilizer.2009 · DOI: 10.1007/s11103-008-9426-1
At1g14690 65 kDa 微管相关蛋白 7。 暂无已核实直接文献
At2g01910 微管相关蛋白，介导由单个微管 形成的网状稳定致密网络的形成。
Two microtubule-associated proteins of the Arabidopsis MAP65 family function differently on microtubules.2005 · DOI: 10.1104/pp.104.052456
At5g62250 65 kDa微管相关蛋白9。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016212 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程
GO:0000280 nuclear division 生物过程
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0007020 microtubule nucleation 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0031116 positive regulation of microtubule polymerization 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0046785 microtubule polymerization 生物过程
GO:0048528 post-embryonic root development 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0052096 formation of syncytium involving giant cell for nutrient acquisition 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14690
ath:AT2G01910
ath:AT4G26760
ath:AT5G51600
ath:AT5G55230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.552
排名 1 · TkA02G054890 · TK1151
细胞核0.374
排名 2 · TkA02G054890 · TK1151
线粒体0.108
排名 3 · TkA02G054890 · TK1151
细胞膜0.063
排名 4 · TkA02G054890 · TK1151
高尔基体0.057
排名 5 · TkA02G054890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03999MAP65_ASE13-128 aa
PF17649VPS387-109 aa
PF27943CCDC547-139 aa
PF05178Kri19-38 aa
PF16533SOAR15-79 aa
PF23191WHD_MCM3_C15-30 aa
PF01544CorA15-80 aa
PF24309IMEF_Flp49-82 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G054890PF03999MAP65_ASE131289.5e-1141.8
TkA02G054890PF17649VPS3871090.0314.0
TkA02G054890PF27943CCDC5471390.05513.3
TkA02G054890PF05178Kri19380.1413.4
TkA02G054890PF16533SOAR15790.004817.5
TkA02G054890PF23191WHD_MCM3_C15300.1113.5
TkA02G054890PF01544CorA15800.1811.8
TkA02G054890PF24309IMEF_Flp49820.212.2
TkA02G054890PF23191WHD_MCM3_C52840.1113.5
TkA02G054890PF05178Kri165860.1413.4
TkA02G054890PF01544CorA851290.1811.8
TkA02G054890PF24309IMEF_Flp1021560.212.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLP0拟南芥sp|Q9FLP0|MA651_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 162.000%Swiss-Prot高置信
Q8LEG3拟南芥sp|Q8LEG3|MA652_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 260.000%Swiss-Prot高置信
Q8L836拟南芥sp|Q8L836|MA657_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 750.000%Swiss-Prot高置信
Q9SIS3拟南芥sp|Q9SIS3|MA656_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 648.600%Swiss-Prot中等置信
Q4PSA3拟南芥sp|Q4PSA3|MA659_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 939.600%Swiss-Prot中等置信

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