TkA02G032650 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G032650

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 7910344-7911300 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

871 bp · TkA02G032650|TK1151|cDNA

GTCTTAAAGATGCCGTATTTTAAAATAGATGGAAAAGGAGACAGTACCCATGCAATTAACAATAGAATCTACAACCATGTAGATTAGCTGTATACATATGGAGCCACAAAAAAGATTGTTTCACCACCAAAAACCATCTCCACTATCCATCACTTCTTTAGCTTTCGCTATTCAGAAATCTGAAGTTAAAATATGTCGAACAAATACATTTTAATGACTGTTGTTGCTCTAGCTTTTAGCTACATTGCCTTAGCCTACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

651 bp · TkA02G032650|TK1151|CDS

ATGTCGAACAAATACATTTTAATGACTGTTGTTGCTCTAGCTTTTAGCTACATTGCCTTAGCCTACGAGCCTAGCCCCCTCCAAGATTTTTGTGTAACCGATCCCAACTCCTCAGTGAAAGTTAACGGTGTAACATGCAAGAACCCGATGCAAGTTCAAGCAGATGATTTCTTCTTCAGTGGGCTGCACCTTAGAGGTAACACATCGAACCAATTAGGGTCAAAGGTGACCCCAGTATTTGCGACTCAGTTACCAGGGCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

216 aa · TkA02G032650|TK1151|PROTEIN

MSNKYILMTVVALAFSYIALAYEPSPLQDFCVTDPNSSVKVNGVTCKNPMQVQADDFFFSGLHLRGNTSNQLGSKVTPVFATQLPGLNTLGISMVRIDYAPWGLNPPHTHPRATEILTVIEGTLQVGFVTSNPDNRFITKVLKKGDVFVFPVGLVHFQRNVGNGYAVVIAALSSQNPGAITIGNAVFGANPAIPADILAKAFQVDKNVVDQLQTKF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G032650`
TK1151 ID	TkA02G032650
OH-1004 ID	LXL04_027886
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	70.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 14.451 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G032650

位置 Chr02:7910344-7911300 (-)

描述 Similar to Os02g0491600: Putative germin-like protein 2-1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0491700`	可能在植物防御中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os02g0491800`	可能在植物防御中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os02g0491600`	可能在植物防御中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os08g0189100`	在广谱抗病性中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os08g0190100`	在广谱抗病性中发挥作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027886 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0048046 apoplast 细胞组分

GO:0030145 manganese ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

dosa:Os02g0491600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.792

排名 1 · TkA02G032650 · TK1151

溶酶体／液泡0.063

排名 2 · TkA02G032650 · TK1151

细胞质0.057

排名 3 · TkA02G032650 · TK1151

内质网0.051

排名 4 · TkA02G032650 · TK1151

细胞膜0.038

排名 5 · TkA02G032650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05899Cupin_345-58 aa

PF00190Cupin_163-209 aa

PF07883Cupin_297-169 aa

PF02311AraC_binding105-163 aa

PF19480DUF6016106-128 aa

PF05899Cupin_3113-154 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G032650	`PF05899`	Cupin_3	45	58	0.16	12.4
TkA02G032650	`PF00190`	Cupin_1	63	209	9.1e-51	172.1
TkA02G032650	`PF07883`	Cupin_2	97	169	1.6e-09	38.0
TkA02G032650	`PF02311`	AraC_binding	105	163	0.27	11.7
TkA02G032650	`PF19480`	DUF6016	106	128	0.28	11.5
TkA02G032650	`PF05899`	Cupin_3	113	154	0.16	12.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q6K5P9`	水稻	sp\|Q6K5P9\|GL22_ORYSJ Putative germin-like protein 2-2	65.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q6K5P8`	水稻	sp\|Q6K5P8\|GL23_ORYSJ Putative germin-like protein 2-3	69.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q6K5Q0`	水稻	sp\|Q6K5Q0\|GL21_ORYSJ Putative germin-like protein 2-1	62.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q6YZA9`	水稻	sp\|Q6YZA9\|GL82_ORYSJ Germin-like protein 8-2	64.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q6YZY5`	水稻	sp\|Q6YZY5\|GL811_ORYSJ Germin-like protein 8-11	62.200%	Swiss-Prot	高置信

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