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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G026640
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 6434429-6438169 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1022 bp · TkA02G026640|TK1151|cDNA

CGAGCATGTTACCATGTACATATCCCACAATGCTCATTAACCATCATCCGAACCCTATAAATAATACGCTGCTCCAGTGCTCCCTGTCGCATTCGATAACTGCCGTAGACCGGAAGCACTCCTGGAATATTCTTTATCTTCATATTTTCTCTCTGTGTGATTTCCATTACCATGAAATTCCAGCAAGAAGGGAAACACGAAGGTGGTGACATGTGCAGAATCATGAGCTTCGTTGAGCCGCTCCCCGCCCTATCAACAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

591 bp · TkA02G026640|TK1151|CDS

ATGAAATTCCAGCAAGAAGGGAAACACGAAGGTGGTGACATGTGCAGAATCATGAGCTTCGTTGAGCCGCTCCCCGCCCTATCAACAATGTCTACCGGAAAAGTTAATGCTAACGGCGACCGCGAGGAGCTCTATCCTCCGATCAACTTCTCCATGGTCGATTACGGCATCTACCGCTCCAGTTTCCCGGATTCCGCCAACTTCTCGTTCCTTAAATCGCTTGAACTTCGCTCAATCGTATATTTGTGTCCTGAGGCATA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

196 aa · TkA02G026640|TK1151|PROTEIN

MKFQQEGKHEGGDMCRIMSFVEPLPALSTMSTGKVNANGDREELYPPINFSMVDYGIYRSSFPDSANFSFLKSLELRSIVYLCPEAYPEHNLEFLKSNRIQLFHFGIEGTKESFYNIPEDTIREALKVVLDVRNHPLLIHCKRGKHRTGCLVGCLRKMQRWSLLSIFDEYHRFAAAKARVSDQRFMELFDASSLKW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G026640
TK1151 IDTkA02G026640
OH-1004 IDLXL04_017580
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G026640
位置Chr02:6434429-6438169 (+)
描述Similar to DSP1: Tyrosine-protein phosphatase DSP1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g05000 在可溶性肌醇焦磷酸盐的5位特异性裂解β-磷酸。
Structural and functional characterization of a novel phosphatase from the Arabidopsis thaliana gene locus At1g05000.2008 · DOI: 10.1002/prot.22041
Phylogenetic and genetic linkage between novel atypical dual-specificity phosphatases from non-metazoan organisms.2011 · DOI: 10.1007/s00438-011-0611-6
A structural exposé of noncanonical molecular reactivity within the protein tyrosine phosphatase WPD loop.2022 · DOI: 10.1038/s41467-022-29673-y
Arabidopsis PFA-DSP-Type Phosphohydrolases Target Specific Inositol Pyrophosphate Messengers.2022 · DOI: 10.1021/acs.biochem.2c00145
At4g03960 在可溶性肌醇焦磷酸盐的5位特异性裂解β-磷酸。 暂无已核实直接文献
At2g32960 在可溶性肌醇焦磷酸盐的5位特异性裂解β-磷酸。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0135700 裂解可溶性肌醇焦磷酸盐5位的β-磷酸（通过相似性推测）。
OsPFA-DSP1, a rice protein tyrosine phosphatase, negatively regulates drought stress responses in transgenic tobacco and rice plants.2012 · DOI: 10.1007/s00299-011-1220-x
Os02g0771400 裂解可溶性肌醇焦磷酸盐5位的β-磷酸（通过相似性推测）。
Two homologous putative protein tyrosine phosphatases, OsPFA-DSP2 and AtPFA-DSP4, negatively regulate the pathogen response in transgenic plants.2012 · DOI: 10.1371/journal.pone.0034995
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017580 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
GO:1900424 regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0016791 phosphatase activity 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
GO:0052845 inositol-5-diphosphate-1,2,3,4,6-pentakisphosphate diphosphatase activity 分子功能
GO:0052847 inositol-1,5-bisdiphosphate-2,3,4,6-tetrakisphosphate 5-diphosphatase activity 分子功能
GO:0052848 inositol-3,5-bisdiphosphate-2,3,4,6-tetrakisphosphate 5-diphosphatase activity 分子功能
GO:0106211 inositol-5-diphosphate-1,3,4,6-tetrakisphosphate diphosphatase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05000
ath:AT2G32960
ath:AT4G03960
dosa:Os02g0771400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.549
排名 1 · TkA02G026640 · TK1151
细胞核0.374
排名 2 · TkA02G026640 · TK1151
质体0.117
排名 3 · TkA02G026640 · TK1151
细胞膜0.075
排名 4 · TkA02G026640 · TK1151
内质网0.056
排名 5 · TkA02G026640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03162Y_phosphatase246-193 aa
PF22785Tc-R-P58-154 aa
PF01335DED71-97 aa
PF00782DSPc113-154 aa
PF22741PTP-NADK119-165 aa
PF13350Y_phosphatase3119-175 aa
PF22784PTP-SAK121-155 aa
PF00102Y_phosphatase127-160 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G026640PF03162Y_phosphatase2461931.9e-61207.1
TkA02G026640PF22785Tc-R-P581540.005717.9
TkA02G026640PF01335DED71970.08613.8
TkA02G026640PF00782DSPc1131540.01415.9
TkA02G026640PF22741PTP-NADK1191652.2e-0731.2
TkA02G026640PF13350Y_phosphatase31191751.1e-0629.5
TkA02G026640PF22784PTP-SAK1211550.001819.1
TkA02G026640PF00102Y_phosphatase1271600.005717.0
TkA02G026640PF01335DED1451720.08613.8
TkA02G026640PF23696YneP1451600.1212.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVN4拟南芥sp|Q9ZVN4|DSP1_ARATH Inositol diphosphatase DSP166.500%Swiss-Prot高置信
Q940L5拟南芥sp|Q940L5|DSP4_ARATH Inositol diphosphatase DSP468.500%Swiss-Prot高置信
Q84MD6拟南芥sp|Q84MD6|DSP2_ARATH Inositol diphosphatase DSP251.900%Swiss-Prot高置信
Q6K461水稻sp|Q6K461|DSP1_ORYSJ Inositol diphosphatase DSP174.300%Swiss-Prot高置信
Q0DX67水稻sp|Q0DX67|DSP2_ORYSJ Inositol diphosphatase DSP257.700%Swiss-Prot高置信

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