RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G616730
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 155583489-155585244 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1441 bp · TkA01G616730|TK1151|cDNA

GTGGGGGTAAATCCGCCCTCAACAAGAGTCGTCTATGATTCCATGTAAACAATTTCTTTACGAGGTGAGAGTTTGAAAACACACAAGGACGATACGTGATACGTCGCATAGTAAAAGGACTCTAATGAAAATATCGCGATAACGATATTACGATTACACCCTTCAATTCCCATTCATCAGGCAGCTCTTCTTCCCTGTCATTCTGCAATCTGGACTTTCGATTCCGCGTGGAGAAGACGACTTTCAACGCGGAATTCGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

765 bp · TkA01G616730|TK1151|CDS

ATGGGCACACCGGCGTTCCCAAATCTAGGTAAACATTGCTCCGTAGATGATTGTAAGCTCATCGATTTCCTACCCTTCACATGCGATTGTTGCAACAAGGTATTCTGTTTAGAACATCGAAGTTACACCACACATCAATGTCCAAACTCCAACAAGAACAATCGAACCGTAGTCATCTGCCCACTCTGTGCAAAGGCGGTTCATTTAATCCCTGAACAAGATCCAAACATAACATGGGAATCTCACGTCAACACAGATTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

254 aa · TkA01G616730|TK1151|PROTEIN

MGTPAFPNLGKHCSVDDCKLIDFLPFTCDCCNKVFCLEHRSYTTHQCPNSNKNNRTVVICPLCAKAVHLIPEQDPNITWESHVNTDCDPSNYEKATKKKKCPVRRCKTTLTFSTTVKCRDCTIEHCLKHRLGPDHDCPGPKKPEPSVPFWESSSKWGTSLLQAVSSLKVAVLGDDSGGGTGGSGGGGGGKVEECPICKMKFSNGAALIDHVQGVHGKKRGVMKVTIDVCPKCSKGFRDPVALVEHVEKEHRGVS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G616730
TK1151 IDTkA01G616730
OH-1004 IDLXL04_000375
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G616730
位置Chr01:155583489-155585244 (+)
描述Similar to SAP11: Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g41835 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
At3g57480 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
At3g28210 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0569700 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
Os09g0385700 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000375 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0097501 stress response to metal ion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G41835
ath:AT3G28210
ath:AT3G57480
dosa:Os07g0569700
dosa:Os09g0385700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.618
排名 1 · TkA01G616730 · TK1151
细胞核0.383
排名 2 · TkA01G616730 · TK1151
线粒体0.068
排名 3 · TkA01G616730 · TK1151
细胞膜0.067
排名 4 · TkA01G616730 · TK1151
内质网0.060
排名 5 · TkA01G616730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01428zf-AN113-51 aa
PF13894zf-C2H2_426-45 aa
PF05605zf-Di1926-67 aa
PF02928zf-C5HC226-52 aa
PF12874zf-met26-35 aa
PF12171zf-C2H2_jaz26-35 aa
PF13912zf-C2H2_626-35 aa
PF23107Zf-C2H2_ZNF451_C42-68 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G616730PF01428zf-AN113511.1e-2074.2
TkA01G616730PF13894zf-C2H2_426451.2e-0526.3
TkA01G616730PF05605zf-Di1926670.0005120.9
TkA01G616730PF02928zf-C5HC226520.002818.6
TkA01G616730PF12874zf-met26350.01316.5
TkA01G616730PF12171zf-C2H2_jaz26350.02515.5
TkA01G616730PF13912zf-C2H2_626351.010.2
TkA01G616730PF23107Zf-C2H2_ZNF451_C42680.07214.4
TkA01G616730PF21816Zap1_zf146530.0001721.9
TkA01G616730PF23475zf-Tbcl_FmdE52640.3311.2
TkA01G616730PF24333DUF750153670.0116.7
TkA01G616730PF01428zf-AN154651.1e-2074.2
TkA01G616730PF25403zf-C2H2_ZFAND256947e-1865.1
TkA01G616730PF13894zf-C2H2_459651.2e-0526.3
TkA01G616730PF15750UBZ_FAAP2059660.04814.2
TkA01G616730PF16293zf-C2H2_959630.05514.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZ42拟南芥sp|Q8VZ42|SAP11_ARATH Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 1153.700%Swiss-Prot高置信
Q9SCM4拟南芥sp|Q9SCM4|SAP13_ARATH Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 1349.300%Swiss-Prot中等置信
Q67YE6拟南芥sp|Q67YE6|SAP12_ARATH Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 1246.100%Swiss-Prot中等置信
Q0D5B9水稻sp|Q0D5B9|SAP16_ORYSJ Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 1649.800%Swiss-Prot中等置信
Q6H595水稻sp|Q6H595|SAP17_ORYSJ Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 1745.100%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看