基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G611100
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 154075851-154078744
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1684 bp · TkA01G611100|TK1151|cDNA
GTTTAATCTGAATAAAAAAACAAAATCACACGAAAACCCATTTATCTTAGAATTAGAAAGAGAAATCTTGCGACTTTCATCGATTTTGTCTAAGAACTTGCGGTTACAGCAAATGCTTAACGATCATCGTCAGGGTTGAAGCAACATAGCCGTACTCTTCCTTATCATAGCGATCGGACTTTCTACTCTGAACGAATTCAATCAGTTTCAGACCAAATCTCTTCCACTGACATCCGATTGCAACAAAAATCATGATCACA...
CDS
下载 CDS FASTA1215 bp · TkA01G611100|TK1151|CDS
ATGATCACAACGCAAAGAAGTCCTACAGGAGGAGGGGGTTTACAGAGCCCTAGATCCCCATCTTCGCAACCTCCGTTTCTGTCAGTATCTGTAACTGATCCTGCTAAAATGGGCAATGGAGTTCAAGCTTATATCTCCTATAAGGTCATCACCAAGACAAACTTTCCCGACTATCAAGGTCCAGAAAAGATTGTCATTCGCCGTTATACTGATTTTGTTTGGTTACGAGATTGTCTCTTCAAAAAGTACAAGGGCATCTT...
404 aa · TkA01G611100|TK1151|PROTEIN
MITTQRSPTGGGGLQSPRSPSSQPPFLSVSVTDPAKMGNGVQAYISYKVITKTNFPDYQGPEKIVIRRYTDFVWLRDCLFKKYKGIFIPPLPEKSTVEKFRFSAEFIEMRRQALDSFVNRIALHHELQHSEDLRTFLQADEQTMERARSQDTGIFKKKPSDFMQIFWDVQSKVSDVVLGKEKPVEETNPEYEKLKRYIFELEDHLAEAQKHAYRLVKRHRELGQSLGDFGKAIKLLGACEGDALGTAFSELGAKSEMLSV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G611100 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G611100 |
| OH-1004 ID | LXL04_000451 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 99.010 / OH-1004 99.502覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G611100 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:154075851-154078744 (+) |
| 描述 | Similar to SNX1: Sorting nexin 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程 GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程 GO:0006896 Golgi to vacuole transport 生物过程 GO:0008333 endosome to lysosome transport 生物过程 GO:0009958 positive gravitropism 生物过程 GO:0031623 receptor internalization 生物过程 GO:0034498 early endosome to Golgi transport 生物过程 GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程 GO:0045732 positive regulation of protein catabolic process 生物过程 GO:0048364 root development 生物过程 GO:0072659 protein localization to plasma membrane 生物过程 GO:0072673 lamellipodium morphogenesis 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G06140 bta:512029 hsa:6642 mmu:67804 pon:100174193 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.672
细胞膜0.285
高尔基体0.183
细胞核0.138
溶酶体／液泡0.079
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00787PX62-139 aaPF02601Exonuc_VII_L109-158 aaPF15754SPESP1119-198 aaPF13870CCDC113_CCDC96_CC124-141 aaPF09325Vps5181-394 aaPF08663HalX186-207 aaPF13870CCDC113_CCDC96_CC186-230 aaPF10456BAR_3_WASP_bdg195-390 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G611100 | PF00787 | PX | 62 | 139 | 1.5e-21 | 77.5 |
| TkA01G611100 | PF02601 | Exonuc_VII_L | 109 | 158 | 8.3 | 6.5 |
| TkA01G611100 | PF15754 | SPESP1 | 119 | 198 | 0.096 | 12.6 |
| TkA01G611100 | PF13870 | CCDC113_CCDC96_CC | 124 | 141 | 7.6 | 6.9 |
| TkA01G611100 | PF09325 | Vps5 | 181 | 394 | 1.8e-22 | 80.8 |
| TkA01G611100 | PF08663 | HalX | 186 | 207 | 0.39 | 11.8 |
| TkA01G611100 | PF13870 | CCDC113_CCDC96_CC | 186 | 230 | 7.6 | 6.9 |
| TkA01G611100 | PF10456 | BAR_3_WASP_bdg | 195 | 390 | 0.0041 | 17.3 |
| TkA01G611100 | PF02601 | Exonuc_VII_L | 249 | 363 | 8.3 | 6.5 |
| TkA01G611100 | PF13870 | CCDC113_CCDC96_CC | 303 | 364 | 7.6 | 6.9 |
| TkA01G611100 | PF08663 | HalX | 320 | 356 | 0.39 | 11.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FG38 | 拟南芥 | sp|Q9FG38|SNX1_ARATH Sorting nexin 1 | 76.000% | Swiss-Prot | 高置信 |