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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G606810
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 152891272-152893548 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1750 bp · TkA01G606810|TK1151|cDNA

CCCACACACACCTCCCCTCCCCAACCCTGAAAAAGAAAGGCGAAAAGGGTATTGGAAGTCTGAAGGGTTGGTGAGTAGGAAGAAGACCGTGTTAAGCTTCACCTCCTTTCTCTCTCCAAAAATGTTGGCTTCCCCTCACAAATTTAGCTGATTGCTTTACGTTTTAGAAGATTATTAACATCGAGTCATCAAAGAAGAATCTGACAGGGAGGACAGCACGTAACTAGGTTGCTCTCTGTTGAAGCAATCATTAAAAGGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1101 bp · TkA01G606810|TK1151|CDS

ATGGATTTTCGCTCCTTCTTTTGCTGCATAAGGGTTTCCGATCGGAAAGAGAAAGAGAAGAAACAATCAACATGGAGGATATTTTCATTGAAGGAATTACATGCTGCCACCAACAATTTCAATTACGACAACAAGCTTGGTGAAGGCGGATTTGGCAGCGTTTATTGGGGTCAACTATGGGACGGATCTCAAATTGCAGTAAAAAGATTAAAAGTCTATAGCAACAAAGCCGAAATGGAATTCGCTGTTGAAGTTGAGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

366 aa · TkA01G606810|TK1151|PROTEIN

MDFRSFFCCIRVSDRKEKEKKQSTWRIFSLKELHAATNNFNYDNKLGEGGFGSVYWGQLWDGSQIAVKRLKVYSNKAEMEFAVEVEILARVRHKNLLSLRGYCAEGQERLIVYDYMPNLSLLSHLHGQHSSEILLDWPRRMTIAIGSAEGIVYLHHQATPHIIHRDVKASNVLLDSEFKAQVADFGFAKLIPDGATHVTTRVKGTLGYLAPEYAMLGKASESCDVYSFGILLLELASGKKPIEKLNSTTRRSITEWALPL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G606810
TK1151 IDTkA01G606810
OH-1004 IDLXL04_009165
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G606810
位置Chr01:152891272-152893548 (-)
描述Similar to At3g15890: PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g15890
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g15890 PTI1样酪氨酸蛋白激酶 At3g15890。 暂无已核实直接文献
At1g70460 负向调控根毛伸长。 暂无已核实直接文献
At4g33430 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
The BRI1-associated kinase 1, BAK1, has a brassinolide-independent role in plant cell-death control.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.046
BAK1 and BKK1 regulate brassinosteroid-dependent growth and brassinosteroid-independent cell-death pathways.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.036
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
Phosphorylation of receptor-like cytoplasmic kinases by bacterial flagellin.2010 · DOI: 10.4161/psb.11500
The Arabidopsis leucine-rich repeat receptor-like kinases BAK1/SERK3 and BKK1/SERK4 are required for innate immunity to hemibiotrophic and biotrophic pathogens.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.084301
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306
An RLP23-SOBIR1-BAK1 complex mediates NLP-triggered immunity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.140
The SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1093/jxb/ery454
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
At1g68690 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献
At3g24540 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK3。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009165 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1990641 response to iron ion starvation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68690
ath:AT1G70460
ath:AT3G15890
ath:AT4G33430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.647
排名 1 · TkA01G606810 · TK1151
细胞质0.291
排名 2 · TkA01G606810 · TK1151
细胞核0.215
排名 3 · TkA01G606810 · TK1151
内质网0.041
排名 4 · TkA01G606810 · TK1151
高尔基体0.033
排名 5 · TkA01G606810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase41-308 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr42-310 aa
PF03109ABC146-71 aa
PF01636APH76-120 aa
PF03109ABC1152-191 aa
PF01636APH159-190 aa
PF17667Pkinase_fungal160-213 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G606810PF00069Pkinase413086.4e-42144.5
TkA01G606810PF07714PK_Tyr_Ser-Thr423102e-43149.3
TkA01G606810PF03109ABC146710.01215.5
TkA01G606810PF01636APH761200.2411.8
TkA01G606810PF03109ABC11521910.01215.5
TkA01G606810PF01636APH1591900.2411.8
TkA01G606810PF17667Pkinase_fungal1602130.2310.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSC2拟南芥sp|Q9LSC2|Y3589_ARATH PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g1589063.800%Swiss-Prot高置信
Q9CAL8拟南芥sp|Q9CAL8|PEK13_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1349.800%Swiss-Prot中等置信
Q94F62拟南芥sp|Q94F62|BAK1_ARATH BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 146.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SX31拟南芥sp|Q9SX31|PERK9_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK947.900%Swiss-Prot中等置信
Q1PEM5拟南芥sp|Q1PEM5|PERK3_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK347.900%Swiss-Prot中等置信

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