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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G598820
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 150824954-150826335 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

684 bp · TkA01G598820|TK1151|cDNA

ATGGTGACAAACGATGTGTTTTCTAACGACATCGGAGAGTGTTTAACTTGGGAAGAACTGAAAAACTACCCCAATTACGATCCGAATCATGGATTAATCAACCAAGTTGAAGCAATCAAATCTGTAAAGATCTCGAGAGGTTCTACAAAGCAATCGAAAGGTGGCAACAACTCTAAACTGTTGATCAAGGGACAATGGACAGAAGAAGAAGACAGCAAGCTAATCAGGCTGGTGAAGCAACATGGAATAACGAAATGGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

684 bp · TkA01G598820|TK1151|CDS

ATGGTGACAAACGATGTGTTTTCTAACGACATCGGAGAGTGTTTAACTTGGGAAGAACTGAAAAACTACCCCAATTACGATCCGAATCATGGATTAATCAACCAAGTTGAAGCAATCAAATCTGTAAAGATCTCGAGAGGTTCTACAAAGCAATCGAAAGGTGGCAACAACTCTAAACTGTTGATCAAGGGACAATGGACAGAAGAAGAAGACAGCAAGCTAATCAGGCTGGTGAAGCAACATGGAATAACGAAATGGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

227 aa · TkA01G598820|TK1151|PROTEIN

MVTNDVFSNDIGECLTWEELKNYPNYDPNHGLINQVEAIKSVKISRGSTKQSKGGNNSKLLIKGQWTEEEDSKLIRLVKQHGITKWAVIAEKMTGRAGKQCRERWRNHLRPDIRKDTWSEEEVRMLIDAHQKVGNKWAEIAKLIPGRTENAIKNQWNATKRRQNSSRKSKKTNAKNKKSQSSLLQDYIRRFAGNLRYGFSSSSLTLHDENSNMYLNNCPEDDSAHGY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G598820
TK1151 IDTkA01G598820
OH-1004 IDLXL04_000621
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)71.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 77.970
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G598820
位置Chr01:150824954-150826335 (+)
描述Similar to MYB119: Transcription factor MYB119
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58850 雌配子体生育力所需的转录因子。
MYB64 and MYB119 are required for cellularization and differentiation during female gametogenesis in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003783
At5g11050 雌配子体生育力所需的转录因子。
MYB64 and MYB119 are required for cellularization and differentiation during female gametogenesis in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003783
At4g18770 结合DD11、DD18等靶基因启动子5′-GTAACNT-3′基序，促进这些基因在胚珠助细胞（如丝状器部位）表达的转录因子。
MYB98 is required for pollen tube guidance and synergid cell differentiation in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.034603
Genome-wide expression profiling of the Arabidopsis female gametophyte identifies families of small, secreted proteins.2007 · DOI: 10.1371/journal.pgen.0030171
Cytoplasmic Ca2+ changes dynamically during the interaction of the pollen tube with synergid cells.2012 · DOI: 10.1242/dev.081208
At3g27785 转录激活因子，识别胚乳诱导基因启动子中的5'-TAACGG-3'基序。
Overexpression of PGA37/MYB118 and MYB115 promotes vegetative-to-embryonic transition in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1038/cr.2008.276
Involvement of an R2R3-MYB transcription factor gene AtMYB118 in embryogenesis in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1007/s00299-008-0644-4
MYB118 represses endosperm maturation in seeds of Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.130021
Transcriptional Activation of Two Delta-9 Palmitoyl-ACP Desaturase Genes by MYB115 and MYB118 Is Critical for Biosynthesis of Omega-7 Monounsaturated Fatty Acids in the Endosperm of Arabidopsis Seeds.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00612

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0841500 参与非生物胁迫反应的转录因子。
Overexpression of an R1R2R3 MYB gene, OsMYB3R-2, increases tolerance to freezing, drought, and salt stress in transgenic Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.094532
Enhanced tolerance to chilling stress in OsMYB3R-2 transgenic rice is mediated by alteration in cell cycle and ectopic expression of stress genes.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.133454
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000621 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009960 endosperm development 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0010439 regulation of glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0045691 regulation of embryo sac central cell differentiation 生物过程
GO:0045697 regulation of synergid differentiation 生物过程
GO:0045723 positive regulation of fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G27785
ath:AT4G18770
ath:AT5G11050
ath:AT5G40360
ath:AT5G58850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.916
排名 1 · TkA01G598820 · TK1151
细胞质0.175
排名 2 · TkA01G598820 · TK1151
细胞膜0.020
排名 3 · TkA01G598820 · TK1151
线粒体0.018
排名 4 · TkA01G598820 · TK1151
内质网0.008
排名 5 · TkA01G598820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23588HTH_CHD1_Hrp317-26 aa
PF29913MIC2158-173 aa
PF16282SANT_DAMP1_like59-94 aa
PF00249Myb_DNA-binding63-109 aa
PF11035SNAPC263-100 aa
PF15963Myb_DNA-bind_764-107 aa
PF26019HTH_TIMELESS64-81 aa
PF09111SLIDE65-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G598820PF23588HTH_CHD1_Hrp317260.01216.4
TkA01G598820PF29913MIC21581730.2111.7
TkA01G598820PF16282SANT_DAMP1_like59942.2e-0525.3
TkA01G598820PF00249Myb_DNA-binding631098.3e-35119.4
TkA01G598820PF11035SNAPC2631001.99.2
TkA01G598820PF15963Myb_DNA-bind_7641075.3e-0730.1
TkA01G598820PF26019HTH_TIMELESS64810.09513.6
TkA01G598820PF09111SLIDE65920.004717.6
TkA01G598820PF23588HTH_CHD1_Hrp365890.01216.4
TkA01G598820PF13837Myb_DNA-bind_4651070.02415.8
TkA01G598820PF13921Myb_DNA-bind_6661263.3e-2795.1
TkA01G598820PF08914Myb_Rap1671150.511.5
TkA01G598820PF10545MADF_DNA_bdg851150.2412.5
TkA01G598820PF16282SANT_DAMP1_like1041412.2e-0525.3
TkA01G598820PF09111SLIDE1111430.004717.6
TkA01G598820PF15963Myb_DNA-bind_71141665.3e-0730.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FIM4拟南芥sp|Q9FIM4|MY119_ARATH Transcription factor MYB11964.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FY60拟南芥sp|Q9FY60|MYB64_ARATH Transcription factor MYB6475.000%Swiss-Prot低置信
Q9S7L2拟南芥sp|Q9S7L2|MYB98_ARATH Transcription factor MYB9850.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LVW4拟南芥sp|Q9LVW4|MY118_ARATH Transcription factor MYB11865.300%Swiss-Prot低置信
Q0JHU7水稻sp|Q0JHU7|MB3R2_ORYSJ Transcription factor MYB3R-265.300%Swiss-Prot低置信

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