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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G598720
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 150789029-150789740 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

591 bp · TkA01G598720|TK1151|cDNA

CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTCTCGCCGGCTACAGAAATATCACCGCCATACTCCTTACCAAATTCAAGAGCTCGAATCGTTTTGATGCATTAGTTGTTTTTGTCGACAGTTCTCCACACCCAGATGAGAAAGAAAGATTAGCGCTTGGAAAACAAACAAGTCAAATTCTGGTTTCAAAATCGACGTACTCAAATGAAGAAACAACATCGTTGCAGACTCAATTGGAGCGCTATGAAAACGCGATTCTGAAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

591 bp · TkA01G598720|TK1151|CDS

CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTCTCGCCGGCTACAGAAATATCACCGCCATACTCCTTACCAAATTCAAGAGCTCGAATCGTTTTGATGCATTAGTTGTTTTTGTCGACAGTTCTCCACACCCAGATGAGAAAGAAAGATTAGCGCTTGGAAAACAAACAAGTCAAATTCTGGTTTCAAAATCGACGTACTCAAATGAAGAAACAACATCGTTGCAGACTCAATTGGAGCGCTATGAAAACGCGATTCTGAAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

196 aa · TkA01G598720|TK1151|PROTEIN

LSLSLSLSVLAGYRNITAILLTKFKSSNRFDALVVFVDSSPHPDEKERLALGKQTSQILVSKSTYSNEETTSLQTQLERYENAILKQENDKLRIENIAMKEAIRALVCNNCGGQAILGDISIDEHHLRIENARLRDELSRISILNRRTPSQCFPTPSFCIDLISPYSQDNQSSRPKHKSGNQIFGRFNCQREVEDC

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G598720
TK1151 IDTkA01G598720
OH-1004 IDLXL04_021674
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 53.571 / OH-1004 12.931
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G598720
位置Chr01:150789029-150789740 (+)
描述Similar to ANL2: Homeobox-leucine zipper protein ANTHOCYANINLESS 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g52170 可能的转录因子，可结合 DNA 序列 5'-GCATTAAATGC-3'。 暂无已核实直接文献
At3g61150 可能的转录因子（通过同源推测）。
CFL1, a WW domain protein, regulates cuticle development by modulating the function of HDG1, a class IV homeodomain transcription factor, in rice and Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.088625
Mutations in epidermis-specific HD-ZIP IV genes affect floral organ identity in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12211
At4g21750 可能参与胚胎发生过程中细胞规格和模式形成的转录因子。
Identification of a cis-regulatory element for L1 layer-specific gene expression, which is targeted by an L1-specific homeodomain protein.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01047.x
Regulation of shoot epidermal cell differentiation by a pair of homeodomain proteins in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1242/dev.00292
Arabidopsis DELLA and two HD-ZIP transcription factors regulate GA signaling in the epidermis through the L1 box cis-element.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.127647

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0674800 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os04g0569100 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021674 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009827 plant-type cell wall modification 生物过程
GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0043481 anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048497 maintenance of floral organ identity 生物过程
GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G61150
ath:AT4G00730
dosa:Os02g0674800
dosa:Os04g0569100
dosa:Os09g0526300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.462
排名 1 · TkA01G598720 · TK1151
细胞核0.462
排名 2 · TkA01G598720 · TK1151
细胞膜0.086
排名 3 · TkA01G598720 · TK1151
线粒体0.070
排名 4 · TkA01G598720 · TK1151
内质网0.050
排名 5 · TkA01G598720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29645CHCH3_N66-92 aa
PF02183HALZ68-79 aa
PF06156YabA70-103 aa
PF28489TUSC176-99 aa
PF21924XRCC4_CC78-107 aa
PF23204KIF21A_2nd80-110 aa
PF02183HALZ83-101 aa
PF21924XRCC4_CC101-141 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G598720PF29645CHCH3_N66920.000920.1
TkA01G598720PF02183HALZ68790.511.3
TkA01G598720PF06156YabA701030.07714.3
TkA01G598720PF28489TUSC176990.2611.9
TkA01G598720PF21924XRCC4_CC781070.113.5
TkA01G598720PF23204KIF21A_2nd801100.02415.6
TkA01G598720PF02183HALZ831010.511.3
TkA01G598720PF21924XRCC4_CC1011410.113.5
TkA01G598720PF06156YabA1181420.07714.3
TkA01G598720PF23204KIF21A_2nd1261350.02415.6
TkA01G598720PF02183HALZ1271400.511.3
TkA01G598720PF29645CHCH3_N1281490.000920.1
TkA01G598720PF28489TUSC11291470.2611.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LTK3拟南芥sp|Q9LTK3|HDG7_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HDG745.900%Swiss-Prot中等置信
Q9M2E8拟南芥sp|Q9M2E8|HDG1_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HDG148.500%Swiss-Prot中等置信
Q8RWU4拟南芥sp|Q8RWU4|ATML1_ARATH Homeobox-leucine zipper protein MERISTEM L144.500%Swiss-Prot中等置信
Q6EPF0水稻sp|Q6EPF0|ROC5_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein ROC551.900%Swiss-Prot中等置信
Q7Y0V9水稻sp|Q7Y0V9|ROC4_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein ROC451.900%Swiss-Prot中等置信

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