TkA01G598380 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G598380

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 150680430-150683039 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1903 bp · TkA01G598380|TK1151|cDNA

ATTGAATTGAATCCAATTTCAGAGCAAGATTCATAATTTATTCCAAAAGCTTTGCAATATGTTACTAGAAAACTGTTTCGTTTTGCCCAAACAAAGTATATTTCCTTTTACTTTTTAGGGCTTTATAACCAAAATGCTTTGAATTTTCGATCTGAAATTCAGTCACAGTTCAGCCGACTCACTCACACGTGCTGCCACATACGTCCTCCTCCGACCATCGACTCTTCCAACCGATGGCTGCTTGGCCATAATTCTTCCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1206 bp · TkA01G598380|TK1151|CDS

ATGTATTGGTTTAAAAACCTTATACGATTATCCTCTCCGGTGAAACACCGTTCCACCGCCAAATTCACACCCACTCTGTTCTCTCTGCAACACATCCACCAATTCGCCACCGCCGTCGATGCGGTTCCTCCTCCGGCGTCTGGGCTCGGACCCACAACGAAAACCGAGAAGCCAAGGGTGGTGGTTCTGGGTTCCGGTTGGGCAGGGTGTAGGCTGATGAAAGGGATCGACACCAGTATATACGACGTCGTTTGCGTCTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

401 aa · TkA01G598380|TK1151|PROTEIN

MYWFKNLIRLSSPVKHRSTAKFTPTLFSLQHIHQFATAVDAVPPPASGLGPTTKTEKPRVVVLGSGWAGCRLMKGIDTSIYDVVCVSPRNHMVFTPLLASTCVGTLEFRSVAEPIGRIQPAISTEPGSYFFLANCKGLDSKNHEVHCQTITDGLKTMDPWDFKISYDKLIIASGAEASTFGINGVKEHAIFLREVHHAQEIRRKLLLNLMVSDVPGVSDEEKRRLLHCVVVGGGPTGVEFSGELSDFIMKDVHQRYSHVK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G598380`
TK1151 ID	TkA01G598380
OH-1004 ID	LXL04_010160
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	71.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 82.294 / OH-1004 64.648 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G598380

位置 Chr01:150680430-150683039 (+)

描述 Similar to NDA2: Internal alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase A2, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g07180`	替代性NADH-泛醌氧化还原酶，催化线粒体NADH的氧化，但不将质子跨内线粒体膜转运。	暂无已核实直接文献
`At2g29990`	替代性NADH-泛醌氧化还原酶，催化线粒体NADH的氧化，但不将质子跨内线粒体膜转运。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010160 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0071482 cellular response to light stimulus 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0003954 NADH dehydrogenase activity 分子功能

GO:0003959 NADPH dehydrogenase activity 分子功能

GO:0008137 NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0120555 NADH dehydrogenase (ubiquinone) (non-electrogenic) activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G07180

ath:AT2G29990

ddi:DDB_G0270104

sot:102598594

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.944

排名 1 · TkA01G598380 · TK1151

细胞质0.077

排名 2 · TkA01G598380 · TK1151

细胞核0.069

排名 3 · TkA01G598380 · TK1151

细胞膜0.024

排名 4 · TkA01G598380 · TK1151

质体0.011

排名 5 · TkA01G598380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07992Pyr_redox_259-374 aa

PF00070Pyr_redox59-93 aa

PF05834Lycopene_cycl60-95 aa

PF00070Pyr_redox227-300 aa

PF05834Lycopene_cycl229-244 aa

PF05834Lycopene_cycl280-332 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G598380	`PF07992`	Pyr_redox_2	59	374	2.7e-51	175.4
TkA01G598380	`PF00070`	Pyr_redox	59	93	6.7e-08	33.7
TkA01G598380	`PF05834`	Lycopene_cycl	60	95	0.076	12.8
TkA01G598380	`PF00070`	Pyr_redox	227	300	6.7e-08	33.7
TkA01G598380	`PF05834`	Lycopene_cycl	229	244	0.076	12.8
TkA01G598380	`PF05834`	Lycopene_cycl	280	332	0.076	12.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GWA1`	拟南芥	sp\|Q8GWA1\|NDA1_ARATH Internal alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase A1, mitochondrial	71.800%	Swiss-Prot	高置信
`O80874`	拟南芥	sp\|O80874\|NDA2_ARATH Internal alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase A2, mitochondrial	82.200%	Swiss-Prot	高置信

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