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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G593260
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 149357578-149359374 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1030 bp · TkA01G593260|TK1151|cDNA

AAGAAATTCATCACTTTCCTTGCCTTTAAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGGTTTCTTGAATGTCCAGAGAAAGGGACTTCTATGACGATGCAGGCAAAAGGATAAAAAGAGAGATCGATGCGTATATAAACACCACTACGATGGGGCATATGGCGAGGAGACAGATATTGATTCCGGCACCTGGGACTTTGAACACGATCACACCATGCGCTGCGTGTAAGCTTCTCCGGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

732 bp · TkA01G593260|TK1151|CDS

ATGTCCAGAGAAAGGGACTTCTATGACGATGCAGGCAAAAGGATAAAAAGAGAGATCGATGCGTATATAAACACCACTACGATGGGGCATATGGCGAGGAGACAGATATTGATTCCGGCACCTGGGACTTTGAACACGATCACACCATGCGCTGCGTGTAAGCTTCTCCGGAGAAGATGCGCAGAAGAGTGTCCATTTTCGCCTTATTTCTCGCCACATGAACCCCATAAGTTTGCCGCCGTTCATAAAATCTTTGGTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

243 aa · TkA01G593260|TK1151|PROTEIN

MSRERDFYDDAGKRIKREIDAYINTTTMGHMARRQILIPAPGTLNTITPCAACKLLRRRCAEECPFSPYFSPHEPHKFAAVHKIFGASNVSKLLLEVPESQRADAANSLVYEANVRLRDPIYGCMGAISALQQQIQSLQSDLNAVRAEILRYKYREAAANTHDINIIASTLVSSGPITAAQLSTIQAPPTPPPPQPSIVISSSSSSSSSSSSSSSVHLYGIPSSTSGYSTSTIPNNNVSSYFA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G593260
TK1151 IDTkA01G593260
OH-1004 IDLXL04_000694
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.296 / OH-1004 11.812
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G593260
位置Chr01:149357578-149359374 (+)
描述Similar to LBD13: LOB domain-containing protein 13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g40470 含 LOB 结构域的蛋白质 15。 暂无已核实直接文献
At2g30340 含LOB结构域的蛋白13。 暂无已核实直接文献
At2g30130 含 LOB 结构域的蛋白 12。 暂无已核实直接文献
At1g31320 含LOB结构域蛋白4。 暂无已核实直接文献
At1g65620 叶片背面细胞增殖的负调控因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000694 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010016 shoot system morphogenesis 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:1905177 tracheary element differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0001216 DNA-binding transcription activator activity 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003824 catalytic activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G30130
ath:AT2G30340
ath:AT2G40470
ath:AT3G27650
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.969
排名 1 · TkA01G593260 · TK1151
细胞质0.089
排名 2 · TkA01G593260 · TK1151
细胞膜0.025
排名 3 · TkA01G593260 · TK1151
内质网0.017
排名 4 · TkA01G593260 · TK1151
质体0.013
排名 5 · TkA01G593260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16331TolA_bind_tri2-16 aa
PF03195LOB49-146 aa
PF16331TolA_bind_tri128-149 aa
PF05308Mito_fiss_reg133-211 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G593260PF16331TolA_bind_tri2160.02915.2
TkA01G593260PF03195LOB491461.1e-39135.7
TkA01G593260PF16331TolA_bind_tri1281490.02915.2
TkA01G593260PF05308Mito_fiss_reg1332110.003818.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L5T5拟南芥sp|Q8L5T5|LBD15_ARATH LOB domain-containing protein 1566.100%Swiss-Prot高置信
Q9AT61拟南芥sp|Q9AT61|LBD13_ARATH LOB domain-containing protein 1369.500%Swiss-Prot中等置信
Q8LBW3拟南芥sp|Q8LBW3|LBD12_ARATH LOB domain-containing protein 1268.000%Swiss-Prot低置信
Q9SHE9拟南芥sp|Q9SHE9|LBD4_ARATH LOB domain-containing protein 461.800%Swiss-Prot低置信
O04479拟南芥sp|O04479|AS2_ARATH Protein ASYMMETRIC LEAVES 256.700%Swiss-Prot中等置信

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