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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G580990
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 146193393-146198889 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3240 bp · TkA01G580990|TK1151|cDNA

CAACTTCGTCATCCCCACCTCATCAGATTCCACCTCCTCCGTCTTTCCTCCGGTACCCTGGCCCACTCTTTTTACCCCAACCTATTCAACCTTTATTCAAGGCACATATGCTATCACGGAGCCTCGTGCCATACCTGCCTCCCCTCTCTACCGAACCTAACTCGGAACCTATTTTATACTTTTACATTCACACCTGAGCCTGGTTTTCGCTTTCCGAACCTCGCCCTCAAGGTTTCGTCGTTCTTGGGATTTTAATGTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2325 bp · TkA01G580990|TK1151|CDS

ATGGCGCAGAGTAGTTGGGAAGCTGATAAAATGTTGGATGTTTACATCCATGACTATTTGTTGAAACGGAAGTTGCATGCATCTGCAAAAGCATTCATGACAGAAGGGAAGGTTGCTACAGACCCTGTAGCCATTGATGCTCCTGGTGGATTTCTCTTTGAGTGGTGGTCTGTCTTTTGGGACATTTTTATAGCACGGACTAACGAAAAACATTCTGAAGCAGCTGTAGCTTACATTGAGACACAGCAAATGAAAGCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

774 aa · TkA01G580990|TK1151|PROTEIN

MAQSSWEADKMLDVYIHDYLLKRKLHASAKAFMTEGKVATDPVAIDAPGGFLFEWWSVFWDIFIARTNEKHSEAAVAYIETQQMKAKEHQQQLQMQQMHFIQQRNAQMQRRDPNHPPIGGHVNPMNNDAINMMGKPSPSTLGGMKIYEESMKPSHSMDSETSPALLDASRMALLKSATNHQGQLMQGNSANMSASLQQIQGRPQLNTEIKQEVNMGSTQKTLPTDPSSIYGQAILQSKSGMGNTGFNQGVTGLPLKGWPL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G580990
TK1151 IDTkA01G580990
OH-1004 IDLXL04_000847
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G580990
位置Chr01:146193393-146198889 (+)
描述Similar to LUH: Transcriptional corepressor LEUNIG_HOMOLOG
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g32700 可能作为转录共抑制复合体的亚基，抑制非生物胁迫相关基因的表达。
The Arabidopsis transcription factor LUH/MUM1 is required for extrusion of seed coat mucilage.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.172023
At4g32551 花分生组织发育早期阶段 C 类花同源异型基因 AGAMOUS 的 SEU-LUG 转录辅阻遏物的转录阻遏子亚基。
The rotunda2 mutants identify a role for the LEUNIG gene in vegetative leaf morphogenesis.2004 · DOI: 10.1093/jxb/erh165
At5g56130 作为 TREX 复合体的 THO 子复合体的组成部分，被认为耦合 mRNA 转录、加工和核输出。
Putative Arabidopsis THO/TREX mRNA export complex is involved in transgene and endogenous siRNA biosynthesis.2010 · DOI: 10.1073/pnas.0911341107
The conserved RNA trafficking proteins HPR1 and TEX1 are involved in the production of endogenous and exogenous small interfering RNA in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.076638

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000847 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006974 DNA damage response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ana:alr3466
ath:AT2G32700
ath:AT4G32551
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.921
排名 1 · TkA01G580990 · TK1151
细胞质0.190
排名 2 · TkA01G580990 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA01G580990 · TK1151
线粒体0.018
排名 4 · TkA01G580990 · TK1151
溶酶体／液泡0.009
排名 5 · TkA01G580990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08513LisH10-36 aa
PF30097LisH_SSDP12-66 aa
PF25174Beta-prop_THOC373-102 aa
PF23775Beta-prop_RIG_2nd73-97 aa
PF23769Beta-prop_WDR75_2nd73-103 aa
PF25460Beta-prop_Aladin88-126 aa
PF23419WD40_RFWD3305-322 aa
PF25172Beta-prop_WDR3_2nd477-616 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G580990PF08513LisH10361.3e-0628.9
TkA01G580990PF30097LisH_SSDP12669e-2587.6
TkA01G580990PF25174Beta-prop_THOC3731025.5e-43147.6
TkA01G580990PF23775Beta-prop_RIG_2nd73974.7e-0626.9
TkA01G580990PF23769Beta-prop_WDR75_2nd731030.529.8
TkA01G580990PF25460Beta-prop_Aladin881264.4e-0936.7
TkA01G580990PF23419WD40_RFWD33053220.00218.2
TkA01G580990PF25172Beta-prop_WDR3_2nd4776161.9e-2590.5
TkA01G580990PF23769Beta-prop_WDR75_2nd4835600.529.8
TkA01G580990PF23414Beta-prop_EML_24926135.2e-2589.0
TkA01G580990PF25168Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd4925941.1e-1868.3
TkA01G580990PF24817WD40_WDHD1_1st4935701e-38133.9
TkA01G580990PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd4937336e-1452.5
TkA01G580990PF16529Ge1_WD404935397.4e-0625.9
TkA01G580990PF23393Beta-prop_WDR90_POC16_2nd4955263.1e-1247.0
TkA01G580990PF24780WD40_MABP1-WDR62_1st4956158.2e-0935.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O48847拟南芥sp|O48847|LUH_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG_HOMOLOG60.700%Swiss-Prot高置信
Q9FUY2拟南芥sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG40.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FKT5拟南芥sp|Q9FKT5|THOC3_ARATH THO complex subunit 320.500%Swiss-Prot低置信

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