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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G564290
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 141903155-141909043 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3021 bp · TkA01G564290|TK1151|cDNA

CTCGGACCTCAGTGTCTCCATCATCAGATTTCTCCCGCTGTACAAATAATAAGTATCCGACGCTATCATGCGAATGTCTGCGTACCTCGCCGTCGGTCAAGAAAAAAATTAGTTTCATAAATTTCAACGATTGATTCGTGTTTTTTTTCAACAGTGATAAATGACAAGCGGCTCGGCAGTAGGGGCACCAATTCCCGGTCGCCGGAGTACCGTACGCGTTGTGGTCGTCGGTGACCGTGGTACCGGTAAATCAAGCTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1950 bp · TkA01G564290|TK1151|CDS

ATGACAAGCGGCTCGGCAGTAGGGGCACCAATTCCCGGTCGCCGGAGTACCGTACGCGTTGTGGTCGTCGGTGACCGTGGTACCGGTAAATCAAGCTTAATCGCGGCAGCTGCCTCCGAGAATTTTCCGGAAAGCGTTTCACCTGTTCTTCCTCCTACTCGTCTTCCTGCGGATTACTATCCGGATGGCGTTCCTGTCACCATCATCGACACCGCGTCTAGTTTGGAAGGGAAAGCGAAGTTAGAGGAAGAATTGAAGCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

649 aa · TkA01G564290|TK1151|PROTEIN

MTSGSAVGAPIPGRRSTVRVVVVGDRGTGKSSLIAAAASENFPESVSPVLPPTRLPADYYPDGVPVTIIDTASSLEGKAKLEEELKRADAVVLTYACDKPETLNRLQNFWIPEVRRLKVKVPVIVVGCKLDLRDEHYPMSLEQVMAPIMQQFREIETCIECSAANLVQVPEVFYYAQKSVLHPTAPLFDQESQTLKPRCIRALKRIFILCDHDMDSALNDSELNEFQVKCFNAPLQPAEIVGVKRVVQEKVPEGVNDYGL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G564290
TK1151 IDTkA01G564290
OH-1004 IDLXL04_001058
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G564290
位置Chr01:141903155-141909043 (+)
描述Similar to MIRO2: Mitochondrial Rho GTPase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g63150 钙结合线粒体GTP酶，参与盐胁迫响应期间的钙信号传导。
Arabidopsis thaliana MIRO1 and MIRO2 GTPases are unequally redundant in pollen tube growth and fusion of polar nuclei during female gametogenesis.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0018530
At5g27540 线粒体 GTP 酶需要维持线粒体的正常发育、形态和细胞内分布，而这对于胚胎细胞分裂、单倍体雄性和雌性配子的发育以及花粉管生长的进展至关重要。
EMB2473/MIRO1, an Arabidopsis Miro GTPase, is required for embryogenesis and influences mitochondrial morphology in pollen.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.055756
MIRO1 influences the morphology and intracellular distribution of mitochondria during embryonic cell division in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1007/s00299-010-0926-5
Arabidopsis thaliana MIRO1 and MIRO2 GTPases are unequally redundant in pollen tube growth and fusion of polar nuclei during female gametogenesis.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0018530
At3g05310 线粒体 GTP 酶，可能参与线粒体发育。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001058 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000001 mitochondrion inheritance 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010821 regulation of mitochondrion organization 生物过程
GO:0015886 heme transport 生物过程
GO:0055091 phospholipid homeostasis 生物过程
GO:1990456 mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05310
ath:AT3G63150
ath:AT5G27540
cnb:CNBF0860
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.346
排名 1 · TkA01G564290 · TK1151
细胞膜0.279
排名 2 · TkA01G564290 · TK1151
细胞核0.169
排名 3 · TkA01G564290 · TK1151
线粒体0.140
排名 4 · TkA01G564290 · TK1151
高尔基体0.118
排名 5 · TkA01G564290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05621TniB14-39 aa
PF10236DAP315-36 aa
PF09439SRPRB18-85 aa
PF13479AAA_2418-37 aa
PF12775AAA_718-44 aa
PF00071Ras19-180 aa
PF08477Roc19-131 aa
PF01926MMR_HSR119-107 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G564290PF05621TniB14390.1712.1
TkA01G564290PF10236DAP315360.3310.8
TkA01G564290PF09439SRPRB18850.005416.8
TkA01G564290PF13479AAA_2418370.01715.6
TkA01G564290PF12775AAA_718440.2111.8
TkA01G564290PF00071Ras191801.1e-2281.1
TkA01G564290PF08477Roc191315.2e-1040.3
TkA01G564290PF01926MMR_HSR1191071.8e-0938.4
TkA01G564290PF13191AAA_1619390.0002122.6
TkA01G564290PF05673DUF81519410.03414.0
TkA01G564290PF20703nSTAND119370.2211.8
TkA01G564290PF00005ABC_tran19390.3112.3
TkA01G564290PF00350Dynamin_N20472.8e-0524.9
TkA01G564290PF13555AAA_2920370.0009919.6
TkA01G564290PF01637ATPase_220390.001119.5
TkA01G564290PF13173AAA_1420440.00218.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4J0W4拟南芥sp|F4J0W4|MIRO2_ARATH Mitochondrial Rho GTPase 261.700%Swiss-Prot高置信
Q8RXF8拟南芥sp|Q8RXF8|MIRO1_ARATH Mitochondrial Rho GTPase 163.000%Swiss-Prot高置信
Q9MA88拟南芥sp|Q9MA88|MIRO3_ARATH Mitochondrial Rho GTPase 348.200%Swiss-Prot中等置信

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