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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G559850
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 140827269-140829269 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1756 bp · TkA01G559850|TK1151|cDNA

AAATTGCTTTTAATTTGTCTGAAATAAGAATTCTTTGTGAACTTTTCTTTGAGCCGTTGTGAGGACACCTAAGATTTCGACCGTTGGGCGAAGGTCATGAATTTTCTCCTTTTAGGCTTCTCTTTTGTCTGTTAACGCTCCTCCTCATGCCGTTGAGTGTGAATCATGGCGTTGCGTTGACAGATTCTACTTATAAATCGTCACTGTTAAAACCCTATTCTTCATTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

768 bp · TkA01G559850|TK1151|CDS

ATGGAGGGAAAGAGCAAGTTGTCAGCACAGTGGTGGTGGTTTGACAGTCAGAGCAACAGTATTCCAAGGAAATCGCCATGGTTACACTCCACTCTTGCAGAACTGGATGAGAAGACAGAGTCAATGCTAAAACTGATCGAAGAAGACGCAGATTCTTTTGCAAAGCGTGCAGAAATGTATTACAGAAAACGGCCGGAGCTCATCAACATCGTTGAGGATCTGTACAGAGCCCATCGATCGCTAGCTGAAAAATACGATCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

255 aa · TkA01G559850|TK1151|PROTEIN

MEGKSKLSAQWWWFDSQSNSIPRKSPWLHSTLAELDEKTESMLKLIEEDADSFAKRAEMYYRKRPELINIVEDLYRAHRSLAEKYDQVKFDSGNRHLTPWTSCPLPLSKFRSSHLMKESEKSYDSYSESFDFDHDSDSVDSVMIDEENACFNDETEEEKSCSDEEGMKLIREELERLREENEVQKQELLQKDEEKREAIRQLSFSVDLLKQENVDLKTRIAKDSFKKHNISPFEFEFAKLKGVFWGRLFTTAVPL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G559850
TK1151 IDTkA01G559850
OH-1004 IDLXL04_001112
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G559850
位置Chr01:140827269-140829269 (+)
描述Similar to NET3A: Protein NETWORKED 3A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g03470 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g47920 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g22790 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。
A superfamily of actin-binding proteins at the actin-membrane nexus of higher plants.2012 · DOI: 10.1016/j.cub.2012.06.041
At2g30500 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g14760 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001112 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0031965 nuclear membrane 细胞组分
GO:0003779 actin binding 分子功能
GO:0051015 actin filament binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03470
ath:AT2G30500
ath:AT2G47920
ath:AT3G22790
ath:AT4G14760
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.409
排名 1 · TkA01G559850 · TK1151
细胞核0.397
排名 2 · TkA01G559850 · TK1151
细胞膜0.198
排名 3 · TkA01G559850 · TK1151
内质网0.087
排名 4 · TkA01G559850 · TK1151
质体0.064
排名 5 · TkA01G559850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07765KIP111-86 aa
PF04961FTCD_C28-60 aa
PF00170bZIP_128-44 aa
PF06785UPF024229-87 aa
PF11887Mce4_CUP138-88 aa
PF07765KIP1115-131 aa
PF04889Cwf_Cwc_15119-210 aa
PF06785UPF0242151-198 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G559850PF07765KIP111863.3e-33114.3
TkA01G559850PF04961FTCD_C28601.49.3
TkA01G559850PF00170bZIP_128441.89.4
TkA01G559850PF06785UPF024229870.3511.6
TkA01G559850PF11887Mce4_CUP138880.2511.6
TkA01G559850PF07765KIP11151313.3e-33114.3
TkA01G559850PF04889Cwf_Cwc_151192100.06413.8
TkA01G559850PF06785UPF02421511980.3511.6
TkA01G559850PF00170bZIP_11661871.89.4
TkA01G559850PF07765KIP11671893.3e-33114.3
TkA01G559850PF01166TSC221701800.4811.4
TkA01G559850PF04961FTCD_C1711931.49.3
TkA01G559850PF01166TSC221952280.4811.4
TkA01G559850PF00170bZIP_11952211.89.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q66GR8拟南芥sp|Q66GR8|NET3A_ARATH Protein NETWORKED 3A42.800%Swiss-Prot中等置信
O82259拟南芥sp|O82259|NET3C_ARATH Protein NETWORKED 3C41.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LUI2拟南芥sp|Q9LUI2|NET1A_ARATH Protein NETWORKED 1A46.200%Swiss-Prot低置信
Q84VY2拟南芥sp|Q84VY2|NET4B_ARATH Protein NETWORKED 4B51.600%Swiss-Prot低置信
F4JIF4拟南芥sp|F4JIF4|NET1B_ARATH Protein NETWORKED 1B48.500%Swiss-Prot低置信

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