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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G550530
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 138384892-138386618 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1130 bp · TkA01G550530|TK1151|cDNA

TTTGATTGTCATTTTTTAAATTTTTTGACAGTTATTTGGTTAAAAATGACTGTCTTCTAAAAGAAATTAATAATTGGAGATGTTTTAAGGAAATGATGAAAAAGCTGATGATTGTCAAAGTTAAGAAACTACCACCCCCACGCCTATGACGACTAAAGTTAGCCCGGCGGCCAAGAAGGCGCTTTTAGTCTTGAGCTGTATCTTGTTAGCCATCGGAAACTGCGGTGGCCCTTTGATCACGCGACTTTACTTCATCCACG...

CDS

下载 CDS FASTA

750 bp · TkA01G550530|TK1151|CDS

ATGACGACTAAAGTTAGCCCGGCGGCCAAGAAGGCGCTTTTAGTCTTGAGCTGTATCTTGTTAGCCATCGGAAACTGCGGTGGCCCTTTGATCACGCGACTTTACTTCATCCACGGTGGCAATCGCGTCTGGTTGTCCTCGTCCCTAGAAACCGCTGGATGGCCGTTTTTTCTTGTTGTCCACCTCATTCTCTACTTCCACCGCCTTCGTGCCGCCGGAAAAGATGGAAATAATAAACACGCGACTAAGTTTATTTACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

249 aa · TkA01G550530|TK1151|PROTEIN

MTTKVSPAAKKALLVLSCILLAIGNCGGPLITRLYFIHGGNRVWLSSSLETAGWPFFLVVHLILYFHRLRAAGKDGNNKHATKFIYMRPRLFFAVAFIGVLTGLDDYLYAYGVARLPISTSALILAPHLAFVAVFAYLLVKQKFTPYSINAVVLLTVGAGVLALHTSSDRPEGESKKEYWMGFVMTIAAALLYGFVLPLVELTYNKAKQGDYLHTGGGDSDNYVFVCYHILYDWDDRQQRLQGTTRKSG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G550530
TK1151 IDTkA01G550530
OH-1004 IDLXL04_031139
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 69.880 / OH-1004 21.805
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G550530
位置Chr01:138384892-138386618 (+)
描述Similar to PUP3: Purine permease 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g28230 质子偶联嘌呤转运蛋白介导腺嘌呤和反式玉米素摄取。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
Recycling of pyridoxine (vitamin B6) by PUP1 in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12195
At1g28220 可能参与花粉萌发和花管伸长过程中嘌呤衍生物的运输。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
At2g33750 介导腺嘌呤转运。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
At1g30840 可能的嘌呤转运蛋白4。 暂无已核实直接文献
At4g18195 可能的嘌呤转运蛋白 8。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031139 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006863 purine nucleobase transport 生物过程
GO:0010184 cytokinin transport 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005345 purine nucleobase transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015211 purine nucleoside transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28220
ath:AT1G28230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.314
排名 1 · TkA01G550530 · TK1151
细胞膜0.221
排名 2 · TkA01G550530 · TK1151
高尔基体0.211
排名 3 · TkA01G550530 · TK1151
内质网0.208
排名 4 · TkA01G550530 · TK1151
细胞质0.131
排名 5 · TkA01G550530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16481DUF50588-34 aa
PF25259DUF786011-35 aa
PF16913PUNUT13-209 aa
PF07331TctB42-124 aa
PF00892EamA47-162 aa
PF04142Nuc_sug_transp58-195 aa
PF11992TgpA_N60-200 aa
PF25259DUF786090-104 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G550530PF16481DUF50588340.07813.4
TkA01G550530PF25259DUF786011351.49.8
TkA01G550530PF16913PUNUT132096.7e-59200.4
TkA01G550530PF07331TctB421240.00817.1
TkA01G550530PF00892EamA471622.6e-0731.7
TkA01G550530PF04142Nuc_sug_transp581950.004416.9
TkA01G550530PF11992TgpA_N602000.3510.5
TkA01G550530PF25259DUF7860901041.49.8
TkA01G550530PF16481DUF50581221880.07813.4
TkA01G550530PF08449UAA1292080.0005819.8
TkA01G550530PF07331TctB1291990.00817.1
TkA01G550530PF25259DUF78601521611.49.8
TkA01G550530PF25259DUF78601802011.49.8
TkA01G550530PF00892EamA1812032.6e-0731.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FZ96拟南芥sp|Q9FZ96|PUP1_ARATH Purine permease 159.400%Swiss-Prot高置信
Q9FZ95拟南芥sp|Q9FZ95|PUP3_ARATH Purine permease 355.800%Swiss-Prot高置信
Q94GB1拟南芥sp|Q94GB1|PUP2_ARATH Purine permease 250.500%Swiss-Prot高置信
Q9SY29拟南芥sp|Q9SY29|PUP4_ARATH Probable purine permease 437.300%Swiss-Prot中等置信
Q0WRB9拟南芥sp|Q0WRB9|PUP8_ARATH Probable purine permease 831.100%Swiss-Prot中等置信

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