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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G547690
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 137550402-137555352 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3356 bp · TkA01G547690|TK1151|cDNA

AAAAATTCAACAGAAGTTTGGTAAACCAAGACGTCGAAAGGAGTGGGGGTTTAAAGAGGGCTTTAGGCCGAGCAAAGTCAAAATGTTAAATAGTATGGTTTCTTGTTCTTCAAGCTCGTCAATGGCGGTCCTTCACCCTGCCCAACATTCACATTAGTTTGAAAATTTTAACCAAGGAAAAGCTAAACGGCGACCTCTACAGCATTCCAATCTCATCATCATCGAATCACTCAAGTCCCCATGTTGAAGGCTTTGAGGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2799 bp · TkA01G547690|TK1151|CDS

ATGTTGAAGGCTTTGAGGTCTTCTTCGTGCTTACAACAAGCTCGATTCCCCACAGGGACGTCGTATTTACAGTCTAGTTCACGCCATGGAACTAAACTGGCTTCACCGTTTCATGGAGTGTTGCGCTCTGTTATAGGGAATAAAAACCCTAAATTGTTTCAAAGAGTTTTCTTCTGTTCGGATGCGGGCGATGGATCTGGGTCCGGACCCGAGTCCGCTATTGAAGAAGCTGAGTCGAAATCTCCAGCAGCAATTGTTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

932 aa · TkA01G547690|TK1151|PROTEIN

MLKALRSSSCLQQARFPTGTSYLQSSSRHGTKLASPFHGVLRSVIGNKNPKLFQRVFFCSDAGDGSGSGPESAIEEAESKSPAAIVPTAIKKPDDFLTVLALPLPHRPLFPGFYMPIYVKDPKLLAALVESRKRQAPYAGAFLVKDDPGSEGTGADAEKNIYELKGKDLLNRLHEVGTLAQITSIQGDQVVLIGHRRLRITEMVSEDPLTVQVDHLKDSPYNKDDDVIKATSFEVITTLRDVLKTSSLWRDHVQTYNQHI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G547690
TK1151 IDTkA01G547690
OH-1004 IDLXL04_001322
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.679
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G547690
位置Chr01:137550402-137555352 (-)
描述Similar to LON2: Lon protease homolog, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g26860 ATP依赖性丝氨酸蛋白酶，在线粒体基质中介导选择性降解错误折叠的、未组装的或氧化损伤的多肽，以及某些短寿命的调控蛋白。
Role of Lon1 protease in post-germinative growth and maintenance of mitochondrial function in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2008.02701.x
At3g05790 ATP依赖性丝氨酸蛋白酶，在线粒体基质中介导选择性降解错误折叠的、未组装的或氧化损伤的多肽，以及某些短寿命的调控蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YQ56 ATP依赖性丝氨酸蛋白酶，在线粒体基质中介导选择性降解错误折叠的、未组装的或氧化损伤的多肽，以及某些短寿命的调控蛋白。 暂无已核实直接文献
Os07g0689300 ATP依赖性丝氨酸蛋白酶，在线粒体基质中介导选择性降解错误折叠的、未组装的或氧化损伤的多肽，以及某些短寿命的调控蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001322 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006515 protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程
GO:0051131 chaperone-mediated protein complex assembly 生物过程
GO:0070407 oxidation-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0003697 single-stranded DNA binding 分子功能
GO:0004176 ATP-dependent peptidase activity 分子功能
GO:0004252 serine-type endopeptidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05790
dosa:Os07g0689300
zma:732810
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.889
排名 1 · TkA01G547690 · TK1151
细胞质0.087
排名 2 · TkA01G547690 · TK1151
细胞核0.058
排名 3 · TkA01G547690 · TK1151
过氧化物酶体0.033
排名 4 · TkA01G547690 · TK1151
细胞膜0.025
排名 5 · TkA01G547690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02190LON_substr_bdg99-305 aa
PF05496RuvB_N235-275 aa
PF00005ABC_tran245-293 aa
PF13086AAA_11266-374 aa
PF13401AAA_22283-334 aa
PF20720nSTAND3298-326 aa
PF26688RHH_12303-360 aa
PF00931NB-ARC305-323 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G547690PF02190LON_substr_bdg993059.2e-38130.9
TkA01G547690PF05496RuvB_N2352753.1e-0524.5
TkA01G547690PF00005ABC_tran2452930.3912.0
TkA01G547690PF13086AAA_112663742.58.5
TkA01G547690PF13401AAA_222833347.5e-0523.8
TkA01G547690PF20720nSTAND32983260.002318.4
TkA01G547690PF26688RHH_123033601.79.9
TkA01G547690PF00931NB-ARC3053230.2811.4
TkA01G547690PF13207AAA_173083440.5211.3
TkA01G547690PF07726AAA_33103610.04314.4
TkA01G547690PF01202SKI3223780.1313.1
TkA01G547690PF24883NPHP3_N3273620.0215.8
TkA01G547690PF26688RHH_123753851.79.9
TkA01G547690PF08298AAA_PrkA4264810.001918.1
TkA01G547690PF05496RuvB_N4284873.1e-0524.5
TkA01G547690PF20030bpMoxR4374990.08812.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P93655拟南芥sp|P93655|LONM1_ARATH Lon protease homolog 1, mitochondrial77.600%Swiss-Prot高置信
Q9M9L7拟南芥sp|Q9M9L7|LONM4_ARATH Lon protease homolog 4, chloroplastic/mitochondrial74.700%Swiss-Prot高置信
A2YQ56水稻sp|A2YQ56|LONM_ORYSI Lon protease homolog, mitochondrial73.000%Swiss-Prot高置信
Q69UZ3水稻sp|Q69UZ3|LONM_ORYSJ Lon protease homolog, mitochondrial72.900%Swiss-Prot高置信

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