TkA01G528690 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G528690

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 132703893-132705916 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1545 bp · TkA01G528690|TK1151|cDNA

CAAGTATTACCCAAAAGCAGCGTGCCACGTGCTTGACGCAGACAATTTCTACTCTTATTCTTCCTCAATTCTGTTTCTACGCAGTTTCATGCCTTTTCTGTAAAACAACTTCCATCTCCAACGGAATTTTCACACCAGCAGACAGCAGTCCGATCGGAAAAATATGACGACGGATGGGTTCCGGGTACTGGACGTGAAGTCGTTGACGGAATATATCAAAGCCACGCCATCTTTAGCTTCAAAGCTGGGGGATGAACTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1248 bp · TkA01G528690|TK1151|CDS

ATGACGACGGATGGGTTCCGGGTACTGGACGTGAAGTCGTTGACGGAATATATCAAAGCCACGCCATCTTTAGCTTCAAAGCTGGGGGATGAACTTGATAACTTGGAAATCAAAGAAGTTGGAGACGGGAATCTTAATTTCGTATACATCATCATCTCTACATCTGGCTCCCTTGTCATTAAACAGGCTGTGCCATACATCCGATTAATCGGCGAATCATGGCCAATGACCAAAGAAAGATCGTACTTCGAAGCCACAGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

415 aa · TkA01G528690|TK1151|PROTEIN

MTTDGFRVLDVKSLTEYIKATPSLASKLGDELDNLEIKEVGDGNLNFVYIIISTSGSLVIKQAVPYIRLIGESWPMTKERSYFEATALKRQHSLSPNHVPEVYHFDRTMSLIGMRYIEPPHIILRKGLIAGVEYPLLAEHMAEFMANTLFYTSLLHLTTTQHKSAVAEFCANVELCRLTEQVVFSDPYKISEFNRWTSPYLDSDAESIRNDKILKLEVAELKSKFCEKAQALIHGDLHTSSVMVTKESTQVIDPEFAFYG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G528690`
TK1151 ID	TkA01G528690
OH-1004 ID	LXL04_001525
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	98.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G528690

位置 Chr01:132703893-132705916 (-)

描述 Similar to MTK: Methylthioribose kinase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g49820`	催化甲硫糖在蛋氨酸循环中磷酸化为甲硫糖-1-磷酸。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0669900`	催化甲硫阿糖醇转化为甲硫阿糖醇-1-磷酸的磷酸化反应。	暂无已核实直接文献
`Os04g0669800`	催化甲基硫核糖磷酸化为甲基硫核糖-1-磷酸。	Functional analysis of methylthioribose kinase genes in plants.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.053587

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001525 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0019509 L-methionine salvage from methylthioadenosine 生物过程

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0042802 identical protein binding 分子功能

GO:0046522 S-methyl-5-thioribose kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G49820

dosa:Os04g0669800

ecz:ECS88_4901

gwc:GWCH70_0847

osa:107276080

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.737

排名 1 · TkA01G528690 · TK1151

细胞核0.333

排名 2 · TkA01G528690 · TK1151

线粒体0.095

排名 3 · TkA01G528690 · TK1151

细胞膜0.055

排名 4 · TkA01G528690 · TK1151

过氧化物酶体0.054

排名 5 · TkA01G528690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03881Fructosamin_kin24-61 aa

PF01636APH36-270 aa

PF01633Choline_kinase201-290 aa

PF02958EcKL223-270 aa

PF03881Fructosamin_kin228-268 aa

PF04655APH_6_hur229-269 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G528690	`PF03881`	Fructosamin_kin	24	61	0.048	13.6
TkA01G528690	`PF01636`	APH	36	270	2.2e-11	44.7
TkA01G528690	`PF01633`	Choline_kinase	201	290	0.0011	19.1
TkA01G528690	`PF02958`	EcKL	223	270	0.11	12.5
TkA01G528690	`PF03881`	Fructosamin_kin	228	268	0.048	13.6
TkA01G528690	`PF04655`	APH_6_hur	229	269	0.004	17.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C6D2`	拟南芥	sp\|Q9C6D2\|MTK_ARATH Methylthioribose kinase	69.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XR60`	水稻	sp\|Q7XR60\|MTK2_ORYSJ Methylthioribose kinase 2	69.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XR61`	水稻	sp\|Q7XR61\|MTK1_ORYSJ Methylthioribose kinase 1	69.300%	Swiss-Prot	高置信

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