TkA01G518650 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G518650

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 130013000-130022382 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

6640 bp · TkA01G518650|TK1151|cDNA

ATAACCCCGCCTCCCACGCACCCATGGGCATGGCCATGTCGGGGAAGGTTTAACAAGCCGGAAAGTCCAATTTTCAGTTTCAGATTTGATGGTAACGTAAACTTTTTCCTTCGTATTTTGACGGAAAACTCTTCACAAATGTCGTGGGAGCCGAAGGAGAAGTCGAGCAGCAGCATATTGACGGCAGCAACGGGTGGTAGGAGTTTTGTGGATTCCATTTAATGTCTACAAAAACGGAGAGGACAGAGAAGTCTATTTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

5808 bp · TkA01G518650|TK1151|CDS

ATGGAGGCATTAACGGAGCTTTGCGACTTGATCTCCCATAATCCTAATCTATATTCCGCCAAAATTGCCTGGATTTGCAAACGATGCCCTCCACCGGAGTCGCTCCTCTCCGGTTCTCCTCGGATTTCAAGGTTTCAACTCAACGCTGTTCTTGCAACGGCCAGATTCATCTCCAAATGCCCTAATTACGACGATCCAGGCCCTCGGAATACGGTTCTGGAGTTCATCCGCTCAATCCCATCGTCGTTTACCCAATCATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1935 aa · TkA01G518650|TK1151|PROTEIN

MEALTELCDLISHNPNLYSAKIAWICKRCPPPESLLSGSPRISRFQLNAVLATARFISKCPNYDDPGPRNTVLEFIRSIPSSFTQSFWPKSFPNASIASFYNEFFGYVVKATELYKDFSTDVAGFMGGIVFSALNDNSSDSVISRAFLSALSESFPQIIPADANKLVTSLLDSFASYNSPASSSSTNEESKGVTNFNEESIEQLEKQEIAFQLIERILDKVEIDTQLLERVRLITKDQLRLMTAFLKIRKHDWTEQGASL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G518650`
TK1151 ID	TkA01G518650
OH-1004 ID	LXL04_015971
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	39.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 13.282 / OH-1004 27.760 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G518650

位置 Chr01:130013000-130022382 (+)

描述 Similar to PI4KB1: Phosphatidylinositol 4-kinase beta 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g49340`	在生成第二信使肌醇-1,4,5-三磷酸的首要步骤作用于磷脂酰肌醇（PtdIns）（可能）。	A phosphatidylinositol 4-kinase pleckstrin homology domain that binds phosphatidylinositol 4-monophosphate.1998 · DOI: 10.1074/jbc.273.35.22761
`At1g51040`	在生成第二信使肌醇-1,4,5-三磷酸的第一步起作用于磷脂酰肌醇 (PtdIns)。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015971 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006661 phosphatidylinositol biosynthetic process 生物过程

GO:0009860 pollen tube growth 生物过程

GO:0043327 chemotaxis to cAMP 生物过程

GO:0046854 phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process 生物过程

GO:0048015 phosphatidylinositol-mediated signaling 生物过程

GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程

GO:0140459 response to Gram-positive bacterium 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G09350

ath:AT5G64070

ddi:DDB_G0288485

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.448

排名 1 · TkA01G518650 · TK1151

细胞核0.350

排名 2 · TkA01G518650 · TK1151

高尔基体0.139

排名 3 · TkA01G518650 · TK1151

细胞膜0.116

排名 4 · TkA01G518650 · TK1151

内质网0.096

排名 5 · TkA01G518650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19274PI4K_N211-1376 aa

PF31230TIGD5_C783-795 aa

PF00613PI3Ka1432-1552 aa

PF21245PI4KB-PIK1_PIK1481-1540 aa

PF00454PI3_PI4_kinase1675-1882 aa

PF03109ABC11786-1813 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G518650	`PF19274`	PI4K_N	211	1376		2054.0
TkA01G518650	`PF31230`	TIGD5_C	783	795	0.071	13.4
TkA01G518650	`PF00613`	PI3Ka	1432	1552	1.3e-20	74.4
TkA01G518650	`PF21245`	PI4KB-PIK1_PIK	1481	1540	0.00064	20.5
TkA01G518650	`PF00454`	PI3_PI4_kinase	1675	1882	8.1e-37	128.1
TkA01G518650	`PF03109`	ABC1	1786	1813	0.046	13.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SXA1`	拟南芥	sp\|Q9SXA1\|P4KA1_ARATH Phosphatidylinositol 4-kinase alpha 1	72.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9C680`	拟南芥	sp\|Q9C680\|P4KA2_ARATH Phosphatidylinositol 4-kinase alpha 2	65.800%	Swiss-Prot	低置信

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