本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G515840
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 129275786-129276678 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

579 bp · TkA01G515840|TK1151|cDNA

ATGTCTCAAATTCTCAGTGAATTGTTTCTTTCCGGGTTTATGATAAATTCCACATATAGACGCAGGACACATTTAGTTCAATCTTTTTCAGTTGTCTTCCTTTACTGGTTCTATTACAGTAATTCATACTTAATTCAGACCTCGGGGTCTGAAGAAGATCTTCAGCTGTTGATGAAAGAGAGGAAGAGGAAGAGAATGATTTCGAATCGTGAATCGGCGCGGAGATCTAGAAAGAGGAAGCAAAAGCATATAGACGATCT...

579 bp · TkA01G515840|TK1151|CDS

ATGTCTCAAATTCTCAGTGAATTGTTTCTTTCCGGGTTTATGATAAATTCCACATATAGACGCAGGACACATTTAGTTCAATCTTTTTCAGTTGTCTTCCTTTACTGGTTCTATTACAGTAATTCATACTTAATTCAGACCTCGGGGTCTGAAGAAGATCTTCAGCTGTTGATGAAAGAGAGGAAGAGGAAGAGAATGATTTCGAATCGTGAATCGGCGCGGAGATCTAGAAAGAGGAAGCAAAAGCATATAGACGATCT...

192 aa · TkA01G515840|TK1151|PROTEIN

MSQILSELFLSGFMINSTYRRRTHLVQSFSVVFLYWFYYSNSYLIQTSGSEEDLQLLMKERKRKRMISNRESARRSRKRKQKHIDDLTSHLNQLRVKNNQIISSVSITTQHYMSVEAENSVLRAQVAELSHRLQSLNEMIALMYQPLDAVCGFSDEQYRGGGTEFVDEFMNNSLSYLYANQPIMASADMIQY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G515840
TK1151 IDTkA01G515840
OH-1004 IDLXL04_001734
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 70.833 / OH-1004 70.149
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G515840
位置Chr01:129275786-129276678 (-)
描述Similar to BZIP44: bZIP transcription factor 44
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g75390 与 MAN7 启动子的 DNA G-box 基序 5'- CACGTG-3' 结合的转录因子。
At4g34590 转录因子,可结合靶基因启动子中的 DNA 序列 5'-ACTCAT-3'。
At2g18160 转录因子,可结合靶基因启动子中的特定DNA序列。 暂无已核实直接文献
At3g62420 可能结合靶基因启动子中的特定序列并激活转录。
At5g28770 参与控制饥饿反应的转录因子。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_001734 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006971 hypotonic response 生物过程
GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0080149 sucrose induced translational repression 生物过程
GO:2000693 positive regulation of seed maturation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G75390
ath:AT2G18160
ath:AT3G62420
ath:AT4G34590
zma:542394
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.958
排名 1 · TkA01G515840 · TK1151
细胞质0.131
排名 2 · TkA01G515840 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA01G515840 · TK1151
内质网0.012
排名 4 · TkA01G515840 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA01G515840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04977DivIC32-59 aa
PF13344Hydrolase_649-124 aa
PF03131bZIP_Maf50-117 aa
PF09727CortBP255-139 aa
PF30493DISC157-145 aa
PF25450Rab11-FIP358-138 aa
PF07716bZIP_260-101 aa
PF13863DUF420060-100 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G515840PF04977DivIC32590.4411.1
TkA01G515840PF13344Hydrolase_6491240.04814.4
TkA01G515840PF03131bZIP_Maf501170.1613.2
TkA01G515840PF09727CortBP2551390.113.3
TkA01G515840PF30493DISC1571450.1611.6
TkA01G515840PF25450Rab11-FIP3581380.00617.6
TkA01G515840PF07716bZIP_2601013.5e-0834.1
TkA01G515840PF13863DUF4200601000.4811.5
TkA01G515840PF00170bZIP_1611154e-1246.8
TkA01G515840PF04977DivIC761010.4411.1
TkA01G515840PF16331TolA_bind_tri79960.04714.5
TkA01G515840PF28121VPA1267981401.89.5
TkA01G515840PF13863DUF42001091380.4811.5
TkA01G515840PF04977DivIC1101430.4411.1
TkA01G515840PF16331TolA_bind_tri1111500.04714.5
TkA01G515840PF07716bZIP_21131293.5e-0834.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0Z2L5拟南芥sp|C0Z2L5|BZP44_ARATH bZIP transcription factor 4451.000%Swiss-Prot高置信
O65683拟南芥sp|O65683|BZP11_ARATH bZIP transcription factor 1151.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SI15拟南芥sp|Q9SI15|BZIP2_ARATH bZIP transcription factor 249.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LZP8拟南芥sp|Q9LZP8|BZP53_ARATH bZIP transcription factor 5342.400%Swiss-Prot中等置信
B9DGI8拟南芥sp|B9DGI8|BZP63_ARATH Basic leucine zipper 6341.600%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看