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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G502270
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 125810539-125815629 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3277 bp · TkA01G502270|TK1151|cDNA

GGGAAAAAGGGCATTGTTGGAACTGACAACTGACTAGAATTCTACCACAAAAATTCGACAAATACAGAATAATTCTTTGCCAATGCCACACGACTTCTTGCAAGCTTCTTTTACTATTTAAAGAGGCCACATTTGACGGATTAAAGATTAAAGCTCTTATTATGTTCTCTATCCAGCATCGATCACCTTCTCTTCATTAATTAATTGTTTATGTTATTCTTCTTCAATTTGGGGTTATGAAGTTTAAGTGACTCAAATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2799 bp · TkA01G502270|TK1151|CDS

ATGATAATGACACGAACAGTGTTGTTCTTGTTTTTCGCCATGGTGGCGGTGAAGGGTAGAACTGGAAATACAACAGCATCATCATCAAGATTGTCTAGTGTCGTCAACGTTGGAGCTTTGTTCACTGTGAATTCAGTAATTGGGCGTTCTGTGAAGCCTGCTGTTGAAGCTGCCATTGATGACGTCAATTCTAGTCCAAGTATTCTTGTGGGAACTCGATTGAATCTCATTTTGCATGATACTAATTGCAGTGGATTTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

932 aa · TkA01G502270|TK1151|PROTEIN

MIMTRTVLFLFFAMVAVKGRTGNTTASSSRLSSVVNVGALFTVNSVIGRSVKPAVEAAIDDVNSSPSILVGTRLNLILHDTNCSGFLGTIEALQLMENDVVAAIGPQSSGIAHVISHVVNELHVPLLSFGATDPTLSALEYPYFVRTTQSDDRQMSAIAEFILHFEWKEVIVIFVDDDYGRNGISAFSDTLSKKQAKISYKASLTPGASERDITELLIGVNLRESRVYVVHVNPDSGLEIFAAAKKLGMMTSGYVWITTD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G502270
TK1151 IDTkA01G502270
OH-1004 IDLXL04_038202
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)74.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.678 / OH-1004 99.356
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G502270
位置Chr01:125810539-125815629 (+)
描述Similar to GLR3.4: Glutamate receptor 3.4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g05200 谷氨酸门控受体，可能至少在下胚轴中作为非选择性阳离子通道（可能）。
AtGLR3.4, a glutamate receptor channel-like gene is sensitive to touch and cold.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1551-3
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Dual localization of plant glutamate receptor AtGLR3.4 to plastids and plasmamembrane.2011 · DOI: 10.1016/j.bbabio.2010.11.008
Interacting glutamate receptor-like proteins in Phloem regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110668
Glutamate Receptor Homolog3.4 is Involved in Regulation of Seed Germination Under Salt Stress in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1093/pcp/pcy034
At2g32390 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g42540 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道，至少在根和下胚轴中（可能）。
Calcium entry mediated by GLR3.3, an Arabidopsis glutamate receptor with a broad agonist profile.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088989
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Glutamate receptor-like channel3.3 is involved in mediating glutathione-triggered cytosolic calcium transients, transcriptional changes, and innate immunity responses in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.217208
Involvement of the glutamate receptor AtGLR3.3 in plant defense signaling and resistance to Hyaloperonospora arabidopsidis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12311
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
Real-time, in vivo intracellular recordings of caterpillar-induced depolarization waves in sieve elements using aphid electrodes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12807
At3g51480 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0585200 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
A rice glutamate receptor-like gene is critical for the division and survival of individual cells in the root apical meristem.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037713
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038202 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05200
ath:AT1G42540
ath:AT2G32390
ath:AT3G51480
osa:124544569
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.846
排名 1 · TkA01G502270 · TK1151
细胞质0.071
排名 2 · TkA01G502270 · TK1151
内质网0.070
排名 3 · TkA01G502270 · TK1151
溶酶体／液泡0.040
排名 4 · TkA01G502270 · TK1151
细胞核0.031
排名 5 · TkA01G502270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00060Lig_chan6-34 aa
PF27867Membra_charge7-17 aa
PF13433Peripla_BP_538-334 aa
PF13458Peripla_BP_645-399 aa
PF01094ANF_receptor51-408 aa
PF21056ZSWIM1-3_RNaseH-like115-180 aa
PF13433Peripla_BP_5370-406 aa
PF10613Lig_chan-Glu_bd475-575 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G502270PF00060Lig_chan6341.1e-39136.2
TkA01G502270PF27867Membra_charge7170.411.5
TkA01G502270PF13433Peripla_BP_5383340.1611.8
TkA01G502270PF13458Peripla_BP_6453995.6e-2176.3
TkA01G502270PF01094ANF_receptor514084.1e-98329.4
TkA01G502270PF21056ZSWIM1-3_RNaseH-like1151800.1312.9
TkA01G502270PF13433Peripla_BP_53704060.1611.8
TkA01G502270PF10613Lig_chan-Glu_bd4755753.2e-1144.1
TkA01G502270PF00497SBP_bac_35268121.6e-1248.0
TkA01G502270PF00060Lig_chan5908451.1e-39136.2
TkA01G502270PF27867Membra_charge6496730.411.5
TkA01G502270PF27867Membra_charge8348750.411.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GXJ4拟南芥sp|Q8GXJ4|GLR34_ARATH Glutamate receptor 3.464.700%Swiss-Prot高置信
Q9SW97拟南芥sp|Q9SW97|GLR35_ARATH Glutamate receptor 3.563.900%Swiss-Prot高置信
Q9C8E7拟南芥sp|Q9C8E7|GLR33_ARATH Glutamate receptor 3.355.000%Swiss-Prot高置信
Q84W41拟南芥sp|Q84W41|GLR36_ARATH Glutamate receptor 3.652.200%Swiss-Prot高置信
Q7XP59水稻sp|Q7XP59|GLR31_ORYSJ Glutamate receptor 3.155.200%Swiss-Prot高置信

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