TkA01G485030 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G485030

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 121396082-121402480 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3093 bp · TkA01G485030|TK1151|cDNA

TTTTCTTTGAGTAGGGTTGCAGAAGATAAACGCCACCAGTCACCCCTTTCACCCCATCTCTTTCACATCACACGTCGCCTTATAAACCCTCAAAAACTATCAAATTTCTCTCTACTCTCATTCACTACACATATTTTTCTCTCTTCAAATCGTCTAATCTGCAACACAAACAATGGGCGCTTCGCTTCCTCCCAAAGAGGCCAACCTCTTCAAGCTCATCGTCAAATCTTATGAAACAAAACAGTATAAAAAGGGACTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2661 bp · TkA01G485030|TK1151|CDS

ATGGGCGCTTCGCTTCCTCCCAAAGAGGCCAACCTCTTCAAGCTCATCGTCAAATCTTATGAAACAAAACAGTATAAAAAGGGACTAAAGGCTGCAGATGCTATCTTGAAGAAGTTCCCTGATCATGGAGAAACTCTTTCCATGAAAGGATTAACATTGAACTGCATGGACCGTAAGCAAGAAGCATATGAGCTTGTACGGCTAGGATTGAAGAATGACTTGAAAAGCCATGTTTGTTGGCACGTTTATGGTCTTCTCTA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

886 aa · TkA01G485030|TK1151|PROTEIN

MGASLPPKEANLFKLIVKSYETKQYKKGLKAADAILKKFPDHGETLSMKGLTLNCMDRKQEAYELVRLGLKNDLKSHVCWHVYGLLYRSDREYREAIKCYRNALRIDPDNIEILRDLSLLQAQMRDLAGFVETRQQLLTLKPNHRMNWIGFAVSHHLNSNASKAIDILEAYEGTLEDDYPPESERCEHGEMLLYKISLLEECGLLEKALKELRKREFKIVDKLSYKEEEVSLLVKLNSFEEGEKLYRVLLTMNPDNYQYY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G485030`
TK1151 ID	TkA01G485030
OH-1004 ID	LXL04_002068
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G485030

位置 Chr01:121396082-121402480 (+)

描述 Similar to NAA15: N-terminal acetyltransferase A complex auxiliary subunit NAA15

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g80410`	NatA N-α-乙酰转移酶复合物的辅助亚基。	Protein N-terminal acetylation is required for embryogenesis in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw257 NatA is required for suspensor development in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1080/15592324.2016.1231293

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002068 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0050821 protein stabilization 生物过程

GO:0051604 protein maturation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005667 transcription regulator complex 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G80410

hsa:79612

hsa:80155

mmu:66897

pon:100173970

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.579

排名 1 · TkA01G485030 · TK1151

细胞核0.375

排名 2 · TkA01G485030 · TK1151

高尔基体0.101

排名 3 · TkA01G485030 · TK1151

内质网0.091

排名 4 · TkA01G485030 · TK1151

细胞膜0.078

排名 5 · TkA01G485030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12569NatA_aux_su9-72 aa

PF25063ARM_TT21_C13-42 aa

PF31234TPR_Psidin_N19-250 aa

PF14853Fis1_TPR_C19-48 aa

PF07719TPR_220-42 aa

PF13174TPR_620-42 aa

PF13428TPR_1422-48 aa

PF14559TPR_1922-66 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G485030	`PF12569`	NatA_aux_su	9	72	1.6e-201	671.4
TkA01G485030	`PF25063`	ARM_TT21_C	13	42	0.017	15.7
TkA01G485030	`PF31234`	TPR_Psidin_N	19	250	1.9e-11	44.7
TkA01G485030	`PF14853`	Fis1_TPR_C	19	48	2e-05	25.4
TkA01G485030	`PF07719`	TPR_2	20	42	8.1e-12	45.0
TkA01G485030	`PF13174`	TPR_6	20	42	0.068	14.6
TkA01G485030	`PF13428`	TPR_14	22	48	6.1e-14	51.9
TkA01G485030	`PF14559`	TPR_19	22	66	3.1e-07	31.4
TkA01G485030	`PF12895`	ANAPC3	22	102	1.2e-05	26.3
TkA01G485030	`PF13371`	TPR_9	23	62	9.3e-07	29.5
TkA01G485030	`PF13432`	TPR_16	24	49	1e-07	33.0
TkA01G485030	`PF01239`	PPTA	26	42	0.049	14.1
TkA01G485030	`PF30993`	CABIN1_N	29	50	0.032	14.6
TkA01G485030	`PF13431`	TPR_17	34	62	8.6e-06	26.3
TkA01G485030	`PF13424`	TPR_12	40	65	0.00035	21.4
TkA01G485030	`PF29407`	CFAP70_TPR_C	57	129	0.027	14.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8VZM1`	拟南芥	sp\|Q8VZM1\|NAA15_ARATH N-terminal acetyltransferase A complex auxiliary subunit NAA15	73.400%	Swiss-Prot	高置信

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