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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G478280
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 119784112-119786982 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1553 bp · TkA01G478280|TK1151|cDNA

CTTTAACGAAGTTTTAAGCTTTCGTAGTTCGTATCCTCTGTATAACTTCGCTTCTGATTTCGAGGGTTTCTACCATAGTGTCATGGCCAGCAACAAGAATGAACAGTTCGATATGTATAATCTCGGCCCCTCCCTACCAGCCGCTGCCGCCGCTCTTAGTGCGGAGGATCGTACTGGGCTTGTGAACGCTTTAAAGAATAAGCTTCAAAATCTGGCTGGGCAAGGGCAACACTCTGACATTCTCGAGAATTTGACACCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1146 bp · TkA01G478280|TK1151|CDS

ATGGCCAGCAACAAGAATGAACAGTTCGATATGTATAATCTCGGCCCCTCCCTACCAGCCGCTGCCGCCGCTCTTAGTGCGGAGGATCGTACTGGGCTTGTGAACGCTTTAAAGAATAAGCTTCAAAATCTGGCTGGGCAAGGGCAACACTCTGACATTCTCGAGAATTTGACACCTACAGTTAGAAAGAGAGTCGAGGTTTTGAGAGAAATTCAGAGTGAACATGATGAGTTAGAGGCAAAGTTTTTTGAAGAAAAAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

381 aa · TkA01G478280|TK1151|PROTEIN

MASNKNEQFDMYNLGPSLPAAAAALSAEDRTGLVNALKNKLQNLAGQGQHSDILENLTPTVRKRVEVLREIQSEHDELEAKFFEEKAALELKYQKLYEPLYSKRYDIVNGVTEVDGVKHETTTVQPDGNTKEEKGVPGFWLNAMKTNEILTEEISERDEDALKYLKDIKWCRITDPKGFKLEFFFDTNPYFKNSVLTKIYHMIEDDEPILEKTTGTNIEWLPGKCLTQKTLKKKPKKGSKNARPVTKTEKCESFFNVFNP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G478280
TK1151 IDTkA01G478280
OH-1004 IDLXL04_032201
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G478280
位置Chr01:119784112-119786982 (+)
描述Similar to NAP1;2: Nucleosome assembly protein 1;2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0149400 可能通过调节核小体组装/解组装来调控染色质结构。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8AW64 可能通过调节核小体组装/解组装来调控染色质结构。 暂无已核实直接文献
Os05g0539700 可能通过调节核小体组装/解组装来调控染色质结构。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8B2R4 可能通过调节核小体组装/解组装来调控染色质结构。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032201 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000724 double-strand break repair via homologous recombination 生物过程
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0006334 nucleosome assembly 生物过程
GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程
GO:0016444 somatic cell DNA recombination 生物过程
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0003682 chromatin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19480
ath:AT5G56950
dosa:Os05g0539700
nta:107760768
osa:4339460
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.693
排名 1 · TkA01G478280 · TK1151
细胞核0.446
排名 2 · TkA01G478280 · TK1151
线粒体0.056
排名 3 · TkA01G478280 · TK1151
细胞膜0.049
排名 4 · TkA01G478280 · TK1151
内质网0.042
排名 5 · TkA01G478280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03938OmpH30-116 aa
PF00956NAP63-307 aa
PF05642Sporozoite_P67109-160 aa
PF28976RRM_ACIN1136-182 aa
PF15912VIR_N174-187 aa
PF05477SURF2215-355 aa
PF09073BUD22228-356 aa
PF02862DDHD234-260 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G478280PF03938OmpH301160.01316.4
TkA01G478280PF00956NAP633072.9e-85286.5
TkA01G478280PF05642Sporozoite_P671091600.07811.8
TkA01G478280PF28976RRM_ACIN11361820.212.5
TkA01G478280PF15912VIR_N1741871.29.2
TkA01G478280PF05477SURF22153557.76.7
TkA01G478280PF09073BUD222283560.0314.4
TkA01G478280PF02862DDHD2342600.2412.3
TkA01G478280PF09184PPP4R22423430.4910.6
TkA01G478280PF15912VIR_N2613451.29.2
TkA01G478280PF05327RRN32633491.48.0
TkA01G478280PF04147Nop142663481.28.1
TkA01G478280PF02862DDHD3003460.2412.3
TkA01G478280PF05642Sporozoite_P673043680.07811.8
TkA01G478280PF00956NAP3263432.9e-85286.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q5VND6水稻sp|Q5VND6|NAP1A_ORYSJ Nucleosome assembly protein 1;163.500%Swiss-Prot高置信
B8AW64水稻sp|B8AW64|NAP1B_ORYSI Nucleosome assembly protein 1;260.400%Swiss-Prot高置信
Q53WK4水稻sp|Q53WK4|NAP1B_ORYSJ Nucleosome assembly protein 1;260.700%Swiss-Prot高置信
B8B2R4水稻sp|B8B2R4|NAP1A_ORYSI Nucleosome assembly protein 1;163.200%Swiss-Prot高置信

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