基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G474370
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 118731916-118735760
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1755 bp · TkA01G474370|TK1151|cDNA
GAACATATTAAAGAAATGCAATCAGACTCGGTAGTGTGTATATTGCACCCGAAAAGTATCCAAAATGGCAACGATCATACGACGTTTATCCGTAAAAACACGTGCAACATATCGGCGACCGTGACAGATACCCACACTCTCGGTCCATCTTCATCTTTTTATTTCTTTCTCCTCTTTCGTTTTTGACCTGAACCTCATCAACTGTACCAGTCAAAAGAAATTGAAGTGAACAGAGCATAGCATAACATGGGTGAGGATCC...
CDS
下载 CDS FASTA1095 bp · TkA01G474370|TK1151|CDS
ATGGGTGAGGATCCAGTGAATCTGAATGAGTATCAAGAATTGGCAAGACAGGCCCTTCCAAAAATGTATTACGACTACTTTTCTGGAGGATCCGAGGATCAACACACGCTAAGAGAGAATGTTGAAGCATTTAAACGAATCACTCTTCGACCAAGAATTCTTGTGGATGTGAGCAAAATAGATATGTCGACAACAATTTTGGGTTACAAAACTTCAGCACCCATTATGATCGCCCCAACCGCTATGCATAAGTTAGCACA...
364 aa · TkA01G474370|TK1151|PROTEIN
MGEDPVNLNEYQELARQALPKMYYDYFSGGSEDQHTLRENVEAFKRITLRPRILVDVSKIDMSTTILGYKTSAPIMIAPTAMHKLAHPEGEVLTARAAGSCDVIMGLSFMSTCTIEEVASSCNAVRLFQLYVYKKREISALMVKRAEANGFKAILLTVDTPKLGRREADIKNKMIAPQLKNFEGLVSTKVEDDEGSNLEAFAARSFDPSLSWKDIAWLKSITKLPILVKGILTREDAIKALEVGVEGIIVSNHGARQLDF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G474370 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G474370 |
| OH-1004 ID | LXL04_002213 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 96.703 / OH-1004 33.911覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G474370 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:118731916-118735760 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to GLO4: Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源:OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释(OH1004 来源) | GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程 GO:0009853 photorespiration 生物过程 GO:0009854 oxidative photosynthetic carbon pathway 生物过程 GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0046718 symbiont entry into host cell 生物过程 GO:0050665 hydrogen peroxide biosynthetic process 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005777 peroxisome 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0003973 (S)-2-hydroxy-acid oxidase activity 分子功能 GO:0010181 FMN binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G14130 ath:AT3G14150 ath:AT4G18360 dosa:Os07g0616500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。
过氧化物酶体0.545
细胞质0.301
线粒体0.137
细胞核0.083
质体0.046
LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01070FMN_dh15-354 aaPF00478IMPDH90-111 aaPF01207Dus208-251 aaPF04309G3P_antiterm210-253 aaPF05690ThiG217-260 aaPF00977His_biosynth224-269 aaPF01180DHO_dh224-244 aaPF04309G3P_antiterm253-307 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G474370 | PF01070 | FMN_dh | 15 | 354 | 5.7e-136 | 453.9 |
| TkA01G474370 | PF00478 | IMPDH | 90 | 111 | 4.1e-08 | 33.3 |
| TkA01G474370 | PF01207 | Dus | 208 | 251 | 0.00067 | 19.6 |
| TkA01G474370 | PF04309 | G3P_antiterm | 210 | 253 | 0.018 | 15.2 |
| TkA01G474370 | PF05690 | ThiG | 217 | 260 | 8.6e-07 | 29.3 |
| TkA01G474370 | PF00977 | His_biosynth | 224 | 269 | 8.9e-05 | 22.8 |
| TkA01G474370 | PF01180 | DHO_dh | 224 | 244 | 0.00039 | 20.4 |
| TkA01G474370 | PF04309 | G3P_antiterm | 253 | 307 | 0.018 | 15.2 |
| TkA01G474370 | PF01207 | Dus | 262 | 308 | 0.00067 | 19.6 |
| TkA01G474370 | PF01180 | DHO_dh | 263 | 313 | 0.00039 | 20.4 |
| TkA01G474370 | PF00478 | IMPDH | 264 | 310 | 4.1e-08 | 33.3 |
| TkA01G474370 | PF03060 | NMO | 264 | 343 | 2.3e-06 | 27.9 |
| TkA01G474370 | PF00977 | His_biosynth | 264 | 309 | 8.9e-05 | 22.8 |
| TkA01G474370 | PF05690 | ThiG | 268 | 309 | 8.6e-07 | 29.3 |
| TkA01G474370 | PF01645 | Glu_synthase | 274 | 310 | 1.6e-05 | 25.0 |
| TkA01G474370 | PF00478 | IMPDH | 322 | 351 | 4.1e-08 | 33.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LJH5 | 拟南芥 | sp|Q9LJH5|HAOX1_ARATH Peroxisomal (S)-2-hydroxyacid oxidase GLO4 | 76.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q24JJ8 | 拟南芥 | sp|Q24JJ8|HAOX2_ARATH Peroxisomal (S)-2-hydroxyacid oxidase GLO3 | 73.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LRR9 | 拟南芥 | sp|Q9LRR9|GLO1_ARATH Glycolate oxidase 1 | 62.600% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8H3I4 | 水稻 | sp|Q8H3I4|HAOX_ORYSJ Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4 | 68.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
B8B8K5 | 水稻 | sp|B8B8K5|HAOX_ORYSI Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4 | 67.900% | Swiss-Prot | 高置信 |