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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G473660
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 118541913-118550633 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6200 bp · TkA01G473660|TK1151|cDNA

AAAAAAACTCGAAGTTTTGTCCATAAAAATGATATAAACATGTTAAGGTTGTTGTTTGCATGTCCCACATTTATTGTGGGTTTTCGTCGTATCTTATTCGTCTGGAATATGAAGGCATTATACGTTATAACGGGAGTGTTGATAACACAAATAATTCTTGAAGATATTGAGAACCAGAAAAAAAGAATTCAATTGCAATTCGTCTCCTTCTCCACGTTAACCTAATTCTGTTCAAGGTTTCTATGACTTCGTGTCACCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

5094 bp · TkA01G473660|TK1151|CDS

ATGGATGCTTCAGAGAGACCTTTAACTAACCTGATAGGTAACCTCAGATCCTGGATCCCTCGGCGGTCTGAGCCAGCTAATGTGTCGAGGGACTTTTGGATGCCCGATCAGAGTTGCAGGGTATGCTACGAGTGTGACACCCAGTTCACTTTATTCAACCGAAGACACCATTGCAGACTTTGTGGCCGAGTTTTCTGTGCCAAGTGCACTCACAACTGGATCCCTGCTAGACCTAGCTCCCAAAACATCATCGGGGAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1697 aa · TkA01G473660|TK1151|PROTEIN

MDASERPLTNLIGNLRSWIPRRSEPANVSRDFWMPDQSCRVCYECDTQFTLFNRRHHCRLCGRVFCAKCTHNWIPARPSSQNIIGEESEKIRACNYCFKQWQQGGLAGSVDHGIPDSSLDLSTSPSAASLISTKSSGTVDSSSIAFTSVPHSVSSYQHTHYPTGLTPHQSVVMEANLEEQNELATRGNELLLDVGTRSPSGDDFDEEFAYQLATSGGHVLQIDNGYYDELQMDDMDNEFESHKIHTDGEPHDVTSVSSCS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G473660
TK1151 IDTkA01G473660
OH-1004 IDLXL04_002221
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G473660
位置Chr01:118541913-118550633 (-)
描述Similar to FAB1A: 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14270 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。
Arabidopsis FAB1/PIKfyve proteins are essential for development of viable pollen.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.146159
Loss-of-function and gain-of-function mutations in FAB1A/B impair endomembrane homeostasis, conferring pleiotropic developmental abnormalities in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.167981
At4g33240 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。
Arabidopsis FAB1/PIKfyve proteins are essential for development of viable pollen.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.146159
Loss-of-function and gain-of-function mutations in FAB1A/B impair endomembrane homeostasis, conferring pleiotropic developmental abnormalities in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.167981
Arabidopsis FAB1A/B is possibly involved in the recycling of auxin transporters.2011 · DOI: 10.4161/psb.6.4.15023
At1g71010 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献
At1g34260 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002221 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007033 vacuole organization 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0010256 endomembrane system organization 生物过程
GO:0046854 phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0090332 stomatal closure 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0010008 endosome membrane 细胞组分
GO:0000285 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34260
ath:AT1G71010
ath:AT3G14270
ath:AT4G33240
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.333
排名 1 · TkA01G473660 · TK1151
细胞质0.333
排名 2 · TkA01G473660 · TK1151
细胞核0.275
排名 3 · TkA01G473660 · TK1151
高尔基体0.104
排名 4 · TkA01G473660 · TK1151
内质网0.081
排名 5 · TkA01G473660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01363FYVE33-102 aa
PF13639zf-RING_238-74 aa
PF13445zf-RING_UBOX39-73 aa
PF02318FYVE_240-98 aa
PF13639zf-RING_294-101 aa
PF00118Cpn60_TCP1405-652 aa
PF01363FYVE848-852 aa
PF13639zf-RING_2940-953 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G473660PF01363FYVE331026.6e-1762.1
TkA01G473660PF13639zf-RING_238749.27.3
TkA01G473660PF13445zf-RING_UBOX39739.57.0
TkA01G473660PF02318FYVE_240980.7710.7
TkA01G473660PF13639zf-RING_2941019.27.3
TkA01G473660PF00118Cpn60_TCP14056521.7e-31110.2
TkA01G473660PF01363FYVE8488526.6e-1762.1
TkA01G473660PF13639zf-RING_29409539.27.3
TkA01G473660PF13445zf-RING_UBOX9429529.57.0
TkA01G473660PF21109Stonustoxin_helical102310590.04714.5
TkA01G473660PF01504PIP5K144216088.9e-44150.6
TkA01G473660PF01504PIP5K160716648.9e-44150.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LUM0拟南芥sp|Q9LUM0|FAB1B_ARATH 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1B58.400%Swiss-Prot高置信
Q0WUR5拟南芥sp|Q0WUR5|FAB1A_ARATH 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1A53.800%Swiss-Prot高置信
Q9SSJ8拟南芥sp|Q9SSJ8|FAB1C_ARATH Putative 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1C47.800%Swiss-Prot中等置信
Q9XID0拟南芥sp|Q9XID0|FAB1D_ARATH Putative 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1D35.100%Swiss-Prot中等置信

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