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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G464080
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 116271075-116271829 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

472 bp · TkA01G464080|TK1151|cDNA

GCGTAGAACTGCAAAAGAAATGCTTCTTTCAAGCGATTTGTGGGCAGTCCGGATTCAAAGTTTATGGAAAGATGTCGATGGTAGCTTCTGGTTTCGGGGTCAATGGTATATAATCCCCGAGGAAACATCTGCAGGCAGACAACCTCATAATCTGAAACGCGAGCTATATAGAACCAACGACTTTGCTGATAATGAGATGGAAACTGTTCTTCGCCATTGCTATGTCATGCCTCCAAATGAATATGCTAAAGCTTCCAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

453 bp · TkA01G464080|TK1151|CDS

ATGCTTCTTTCAAGCGATTTGTGGGCAGTCCGGATTCAAAGTTTATGGAAAGATGTCGATGGTAGCTTCTGGTTTCGGGGTCAATGGTATATAATCCCCGAGGAAACATCTGCAGGCAGACAACCTCATAATCTGAAACGCGAGCTATATAGAACCAACGACTTTGCTGATAATGAGATGGAAACTGTTCTTCGCCATTGCTATGTCATGCCTCCAAATGAATATGCTAAAGCTTCCAATGAAGGTGATGATGTGTTTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

151 aa · TkA01G464080|TK1151|PROTEIN

MLLSSDLWAVRIQSLWKDVDGSFWFRGQWYIIPEETSAGRQPHNLKRELYRTNDFADNEMETVLRHCYVMPPNEYAKASNEGDDVFLCEYEYDVKWHSFKRILETDNNEEDEEEAEHDDDWSGDEDSDSETDDDMEYEKEDTYKSTSTHKM

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G464080
TK1151 IDTkA01G464080
OH-1004 IDLXL04_030906
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.338 / OH-1004 34.965
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G464080
位置Chr01:116271075-116271829 (+)
描述Similar to ORC1: Origin of replication complex subunit 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g14700 必需蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g12620 受精所需的关键蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0187000 必需蛋白（根据相似性）。
Molecular cloning and characterization of a plant homologue of the origin recognition complex 1 (ORC1).2000 · DOI: 10.1016/s0168-9452(00)00297-1
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030906 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0006270 DNA replication initiation 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0033314 mitotic DNA replication checkpoint signaling 生物过程
GO:0000808 origin recognition complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005664 nuclear origin of replication recognition complex 细胞组分
GO:0003682 chromatin binding 分子功能
GO:0003688 DNA replication origin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G12620
ath:AT4G14700
dosa:Os06g0187000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.926
排名 1 · TkA01G464080 · TK1151
细胞质0.207
排名 2 · TkA01G464080 · TK1151
线粒体0.023
排名 3 · TkA01G464080 · TK1151
细胞膜0.021
排名 4 · TkA01G464080 · TK1151
细胞外0.015
排名 5 · TkA01G464080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04910Tcf254-70 aa
PF01426BAH10-101 aa
PF06524NOA3677-140 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G464080PF04910Tcf254700.03314.0
TkA01G464080PF01426BAH101019e-1658.6
TkA01G464080PF06524NOA36771400.2611.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q710E8拟南芥sp|Q710E8|ORC1A_ARATH Origin of replication complex subunit 1A70.300%Swiss-Prot高置信
Q9SU24拟南芥sp|Q9SU24|ORC1B_ARATH Origin of replication complex subunit 1B68.500%Swiss-Prot高置信
Q5SMU7水稻sp|Q5SMU7|ORC1_ORYSJ Origin of replication complex subunit 168.800%Swiss-Prot高置信

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