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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G452910
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 113340817-113344455 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

998 bp · TkA01G452910|TK1151|cDNA

TTTTGCTCATTTTTGTGATTAGCCCTTGATTTGAAAGATCAAGAAATTAAAATCTTATGTTCCCTTGAAATTGGATCTTGGTTTGTTAGGTGAATGTGTATAAGGAGCGAAAATTTCTGGCACTTTCTCTGAATGACACAAAAACAGCCATAGAGGAACTGAACAGGCTTGCTTCCGGATTTACAGCATTTGTACTCATAATAGTTTGGTTACTTTTAATGGGTATTGCTACAACAGAAGTGTTGCTTTTCATCTCATCG...

CDS

下载 CDS FASTA

2178 bp · TkA01G452910|TK1151|CDS

ATGGAAAAAGAGTTGGATGGTGGTGGTGGTGGTGGCGACGGGGTGATAGTAGAGATTCCAGGTGTTGAAGAGAAGTCCAAAAATGAAGAAACTGAAGGCATTCAGACACCACTACCAATTTCTGTTCCTACTACTATTCCGCCTCTTCAAATTCAATCAAAACAAGATCAAAATCTTATATCAATGGCACAGTCGCCGTATCCAAAGCCAAAATCAAGACTCGTTGAGCCATCGGTTCCCGCCAATTGGAAGATAGATAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

725 aa · TkA01G452910|TK1151|PROTEIN

MEKELDGGGGGGDGVIVEIPGVEEKSKNEETEGIQTPLPISVPTTIPPLQIQSKQDQNLISMAQSPYPKPKSRLVEPSVPANWKIDNEKVSTTASSFQKPKTPKTSTPITPRTPLMASPGGQDDDDTDVYYTTALENKKRKQPKKKRILVLIEFTLFVCVTIMLVLSKTVDKLEKSEIWSLGLWKWCVLVMVIFCGRLFSEWFTSGVVFLIEREFLLKKKVLYFVYSLQKSVRVFIWLGLILLTWGLLINRGVHRSRNTH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G452910
TK1151 IDTkA01G452910
OH-1004 IDLXL04_002354
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G452910
位置Chr01:113340817-113344455 (-)
描述Similar to MSL10: Mechanosensitive ion channel protein 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g12080 响应膜脂质双层中的拉伸力而打开的机械敏感通道。
Two MscS homologs provide mechanosensitive channel activities in the Arabidopsis root.2008 · DOI: 10.1016/j.cub.2008.04.039
AtMSL9 and AtMSL10: Sensors of plasma membrane tension in Arabidopsis roots.2008 · DOI: 10.4161/psb.3.9.6487
At5g19520 响应膜脂质双层中的拉伸力而打开的机械敏感通道。
Two MscS homologs provide mechanosensitive channel activities in the Arabidopsis root.2008 · DOI: 10.1016/j.cub.2008.04.039
AtMSL9 and AtMSL10: Sensors of plasma membrane tension in Arabidopsis roots.2008 · DOI: 10.4161/psb.3.9.6487
At1g53470 响应膜脂质双层中的拉伸力而打开的机械敏感通道。 暂无已核实直接文献
At3g14810 响应膜脂质双层中的拉伸力而打开的机械敏感通道。 暂无已核实直接文献
At1g78610 响应膜脂质双层中的拉伸力而打开的机械敏感通道。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002354 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006820 monoatomic anion transport 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009859 pollen hydration 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0050982 detection of mechanical stimulus 生物过程
GO:0097468 programmed cell death in response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0008381 mechanosensitive monoatomic ion channel activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53470
ath:AT2G17010
ath:AT3G14810
ath:AT5G12080
ath:AT5G19520
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.811
排名 1 · TkA01G452910 · TK1151
内质网0.121
排名 2 · TkA01G452910 · TK1151
细胞质0.068
排名 3 · TkA01G452910 · TK1151
溶酶体／液泡0.050
排名 4 · TkA01G452910 · TK1151
高尔基体0.034
排名 5 · TkA01G452910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00924MS_channel_2nd203-215 aa
PF00924MS_channel_2nd545-603 aa
PF00924MS_channel_2nd608-633 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G452910PF00924MS_channel_2nd2032154.4e-1040.2
TkA01G452910PF00924MS_channel_2nd5456034.4e-1040.2
TkA01G452910PF00924MS_channel_2nd6086334.4e-1040.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYG9拟南芥sp|Q9LYG9|MSL10_ARATH Mechanosensitive ion channel protein 1048.200%Swiss-Prot中等置信
Q84M97拟南芥sp|Q84M97|MSL9_ARATH Mechanosensitive ion channel protein 950.400%Swiss-Prot高置信
Q9LPG3拟南芥sp|Q9LPG3|MSL4_ARATH Mechanosensitive ion channel protein 443.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LH74拟南芥sp|Q9LH74|MSL5_ARATH Mechanosensitive ion channel protein 543.400%Swiss-Prot中等置信
Q9SYM1拟南芥sp|Q9SYM1|MSL6_ARATH Mechanosensitive ion channel protein 641.500%Swiss-Prot中等置信

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