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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G452610
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 113262232-113265279 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1577 bp · TkA01G452610|TK1151|cDNA

ATTGATCAAATTAAAATGTGTAATAAACTATAATTGCCTATGGAGTAATGAGTATTGAGTGATGAATGGGGCAAAATAGCAAAGCTTTCCCATTTCATTTTCCCCTTTCCAGCCTCGCTTGTTCAGATTATCGGTTTTGAGACCAAAAAGCAAACTCTTTGTAACATAGACTACTAGCAAAACTACTGCTGATCAAGATCGAGAATACGGATACGGATTGGGGAAAAGTGTGTTTGTGTTGTGCGTGAGTGAGAGTTAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

924 bp · TkA01G452610|TK1151|CDS

ATGGTGTCGTATATGAGCTTGGTGATGTATGGAGTGGGCGGAATAGTGGTGGCCGGAATGGCATTATTGGTGGCGTTTCAGGAAAAATTAGTCTACGTGCCGGTTTTGCCTGGTCTGACCAAGTCCTATCCAATCACACCAGCTCGACTACGCATGATTTACGAAGACGTATGGCTTACTTCTTCCGATGGTATACGCCTTCACTCCTGGTTCATCAAGTTCTCTCCAGATTGCACAGGCCCAACTATTCTATTCTTCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

307 aa · TkA01G452610|TK1151|PROTEIN

MVSYMSLVMYGVGGIVVAGMALLVAFQEKLVYVPVLPGLTKSYPITPARLRMIYEDVWLTSSDGIRLHSWFIKFSPDCTGPTILFFQENAGNIAHRLEMVRIMLQKLQCNIFMLSYRGYGASDGYPSQQGITRDAQAALDHLSQRTDIDTSQIVVFGRSLGGAVGVVVTKNNPDKVAALILENTFTSILDMAGVLLPFLKWFIGGSISKGPKILNFVVRSPWNTLDVVGQVKQPVLFLSGLRDEMVPPVHMQMLYAKTAV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G452610
TK1151 IDTkA01G452610
OH-1004 IDLXL04_002358
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G452610
位置Chr01:113262232-113265279 (-)
描述Similar to WAV2: Alpha/beta hydrolase domain-containing protein WAV2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g20520 参与根生长的调节。
The Arabidopsis WAVY GROWTH 2 protein modulates root bending in response to environmental stimuli.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.028530

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002358 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002084 protein depalmitoylation 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0019866 organelle inner membrane 细胞组分
GO:0008236 serine-type peptidase activity 分子功能
GO:0008474 palmitoyl-(protein) hydrolase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G20520
dre:561333
mmu:68904
spo:2540264
xla:432053
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.560
排名 1 · TkA01G452610 · TK1151
线粒体0.171
排名 2 · TkA01G452610 · TK1151
细胞质0.167
排名 3 · TkA01G452610 · TK1151
细胞核0.104
排名 4 · TkA01G452610 · TK1151
细胞膜0.096
排名 5 · TkA01G452610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12697Abhydrolase_67-71 aa
PF05677DUF81894-165 aa
PF06342DUF105798-174 aa
PF07859Abhydrolase_399-172 aa
PF12146Hydrolase_4104-195 aa
PF00561Abhydrolase_1104-205 aa
PF01764Lipase_3108-169 aa
PF12697Abhydrolase_6109-267 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G452610PF12697Abhydrolase_67710.0002722.4
TkA01G452610PF05677DUF818941650.0214.6
TkA01G452610PF06342DUF1057981740.1611.8
TkA01G452610PF07859Abhydrolase_3991720.01415.8
TkA01G452610PF12146Hydrolase_41041957.2e-1349.1
TkA01G452610PF00561Abhydrolase_11042051.2e-1248.7
TkA01G452610PF01764Lipase_31081690.1612.6
TkA01G452610PF12697Abhydrolase_61092670.0002722.4
TkA01G452610PF20434BD-FAE1111730.009216.2
TkA01G452610PF02129Peptidase_S151151890.0002421.6
TkA01G452610PF01738DLH1291787.2e-0626.5
TkA01G452610PF05448AXE11312630.0003220.3
TkA01G452610PF00326Peptidase_S91322963.1e-1350.5
TkA01G452610PF20408Abhydrolase_111351800.0215.3
TkA01G452610PF08840BAAT_C1371850.05714.2
TkA01G452610PF02230Abhydrolase_21441810.001119.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RXP6拟南芥sp|Q8RXP6|WAV2_ARATH Alpha/beta hydrolase domain-containing protein WAV279.100%Swiss-Prot高置信

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