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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G432590
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 108054747-108057097 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1654 bp · TkA01G432590|TK1151|cDNA

ATAAAACTTACTTTATCCGTAAAAAGCCTGTCTCCACGAATATTCATATATAAAGAGCGAAGGAGAAAACAAAATATAAGTTCAGTCTTACTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCAAGCCATCATGGCAACTTTAACCAGAGATGAATCCGACTACGATAGTAGCTGTTCATCGATTACCGTCCCAGATTCCAGCCGGAGCTGGATGAGCAACGTCAGTTTTGGCAGCCGCCGTAGCTCCATCTCCGGCGACCCTTCCCACAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

732 bp · TkA01G432590|TK1151|CDS

ATGGCAACTTTAACCAGAGATGAATCCGACTACGATAGTAGCTGTTCATCGATTACCGTCCCAGATTCCAGCCGGAGCTGGATGAGCAACGTCAGTTTTGGCAGCCGCCGTAGCTCCATCTCCGGCGACCCTTCCCACAAACCACACAAAGCACACCAAGCCGCATGGAAGGCCATGAAGAGGCTACGGGCAGAGAAGGGTGGTCGGGTGAGTTTGGACCATTTTAAGATCTTGAAACGAGTCGGGTCCGGCGACATAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

243 aa · TkA01G432590|TK1151|PROTEIN

MATLTRDESDYDSSCSSITVPDSSRSWMSNVSFGSRRSSISGDPSHKPHKAHQAAWKAMKRLRAEKGGRVSLDHFKILKRVGSGDIGNVYLCQIRNPVVGLPNCFYAMKVVDREALAIRKKLQRAEMEKEILAGLDHPFLPTLYAEFDASHYSCLVMEFCPGGDLHAARQRQPAKCFSISSAKFYVAETLLALEYLHMMGIVYRDLKPENVLVREDGHIMLSDFDLSLKCDVVPKLIDLNRTN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G432590
TK1151 IDTkA01G432590
OH-1004 IDLXL04_002653
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.531 / OH-1004 50.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G432590
位置Chr01:108054747-108057097 (-)
描述Similar to PID2: Protein kinase PINOID 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26700 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与生长素信号传导的调节。
NPY genes and AGC kinases define two key steps in auxin-mediated organogenesis in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809761106
At4g26610 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
At5g47750 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节 PIN 生长素外排促进剂的生长素转运活性。
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
At5g55910 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。
The polarly localized D6 PROTEIN KINASE is required for efficient auxin transport in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1242/dev.028365
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
Arabidopsis D6PK is a lipid domain-dependent mediator of root epidermal planar polarity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.162

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0174700 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与生长素信号传导的调节。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002653 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009638 phototropism 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0010540 basipetal auxin transport 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0048608 reproductive structure development 生物过程
GO:0048825 cotyledon development 生物过程
GO:0099402 plant organ development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26700
ath:AT5G47750
dosa:Os01g0174700
dosa:Os06g0291600
osa:4340792
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.592
排名 1 · TkA01G432590 · TK1151
细胞核0.407
排名 2 · TkA01G432590 · TK1151
细胞膜0.150
排名 3 · TkA01G432590 · TK1151
内质网0.047
排名 4 · TkA01G432590 · TK1151
线粒体0.038
排名 5 · TkA01G432590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01163RIO130-66 aa
PF03109ABC151-93 aa
PF12260PIP49_C56-126 aa
PF00069Pkinase75-229 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr76-229 aa
PF01636APH140-167 aa
PF03109ABC1141-227 aa
PF01163RIO1152-229 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G432590PF01163RIO130660.02714.8
TkA01G432590PF03109ABC151930.0001621.6
TkA01G432590PF12260PIP49_C561260.1412.4
TkA01G432590PF00069Pkinase752294e-32112.4
TkA01G432590PF07714PK_Tyr_Ser-Thr762298.3e-1865.3
TkA01G432590PF01636APH1401670.1312.7
TkA01G432590PF03109ABC11412270.0001621.6
TkA01G432590PF01163RIO11522290.02714.8
TkA01G432590PF14531Kinase-like1942250.2911.1
TkA01G432590PF01636APH1992250.1312.7
TkA01G432590PF12260PIP49_C2052250.1412.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q64FQ2拟南芥sp|Q64FQ2|PID2_ARATH Protein kinase PINOID 265.700%Swiss-Prot高置信
Q9SUA3拟南芥sp|Q9SUA3|D6KL1_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PKL160.400%Swiss-Prot高置信
Q39183拟南芥sp|Q39183|D6KL2_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PKL258.200%Swiss-Prot高置信
Q9FG74拟南芥sp|Q9FG74|D6PK_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PK59.900%Swiss-Prot高置信
Q94E49水稻sp|Q94E49|PID2_ORYSJ Protein kinase PINOID 266.500%Swiss-Prot高置信

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