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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G414790
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 103494615-103497579 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1882 bp · TkA01G414790|TK1151|cDNA

GTAGAAACGAAAAGAGTAGAAAACGCATCCGGTCGTTGGCAAATTGAGACACGTCGATTCCGCATATAAAAGGCAATTCGCTAAAACCCTCCAAATCTACGCGCACCCGGCCAGATCTTTATGGATCAACCGATCCATCCTTGGGCATCAACAACTGTTTTAGGGCTTCTTTCGACCTTTAATTCCATCAAACACTTGTTTCTTCCCCCCTGCATCTCTGCCTAACTCGTTGATTCTACATTCCCCGACACAGCCGTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1035 bp · TkA01G414790|TK1151|CDS

ATGAGGAAGAAGAGAAAAGGCAGTGACCTAAATAAAAAGAAAATGGTGGAATCAACAGAGTCTCTGATATCAAATCTCAAGTGTCATTACTCTCTAGAAGATTACGTTAGATTGAAAAAAAGCTGCTGTAAGGAAGATGTGATCTGCGGTGGTGGTGATTTCAGGCTTGCTGCAACTGCTCCCCCTTGTGCAACCTCGTCACTGGTTTTATCAGGGAGAGGGATTAAGAGGAAAATTGGGTGTATCGATGTAGCCACTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

344 aa · TkA01G414790|TK1151|PROTEIN

MRKKRKGSDLNKKKMVESTESLISNLKCHYSLEDYVRLKKSCCKEDVICGGGDFRLAATAPPCATSSLVLSGRGIKRKIGCIDVATQNKIAEDYVKGATIGKGKFGSVWLCRCRVSGVEFACKTLVKGEETVHREVEIMQHLSGHPGVVTLKAVYEDSESFHLVMELCSGGRLIDQMTKEEGRYSEQRAANIFKELMMVIKFCHDMGVVHRDVKPENILLTASGKIKLADFGLAVRITNGQRLGGLAGSPAYVAPEVLTE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G414790
TK1151 IDTkA01G414790
OH-1004 IDLXL04_031130
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)83.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.837 / OH-1004 78.105
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G414790
位置Chr01:103494615-103497579 (-)
描述Similar to PEPKR2: Serine/threonine-protein kinase PEPKR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12680 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 PEPKR2。 暂无已核实直接文献
At4g23650 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
CDPKs CPK6 and CPK3 function in ABA regulation of guard cell S-type anion- and Ca(2+)-permeable channels and stomatal closure.2006 · DOI: 10.1371/journal.pbio.0040327
At4g04695 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g04530 一种钙离子非依赖性激酶，参与光依赖性磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的磷酸化。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0491900 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031130 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12680
ath:AT1G50700
ath:AT1G76040
dosa:Os03g0788500
gmx:547825
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.521
排名 1 · TkA01G414790 · TK1151
细胞核0.493
排名 2 · TkA01G414790 · TK1151
细胞膜0.072
排名 3 · TkA01G414790 · TK1151
线粒体0.070
排名 4 · TkA01G414790 · TK1151
内质网0.052
排名 5 · TkA01G414790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14531Kinase-like93-141 aa
PF00069Pkinase94-289 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr98-294 aa
PF06293Kdo129-241 aa
PF01636APH129-175 aa
PF01163RIO1131-239 aa
PF03109ABC1154-242 aa
PF12330Haspin_kinase157-234 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G414790PF14531Kinase-like931410.001518.6
TkA01G414790PF00069Pkinase942898.8e-55186.6
TkA01G414790PF07714PK_Tyr_Ser-Thr982942.8e-30106.2
TkA01G414790PF06293Kdo1292415.1e-0523.5
TkA01G414790PF01636APH1291750.001119.5
TkA01G414790PF01163RIO11312390.0001622.1
TkA01G414790PF03109ABC11542421.3e-0731.8
TkA01G414790PF12330Haspin_kinase1572340.07612.8
TkA01G414790PF14531Kinase-like1962590.001518.6
TkA01G414790PF17667Pkinase_fungal2042590.1311.7
TkA01G414790PF01636APH2052340.001119.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W490拟南芥sp|Q8W490|PEPK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase PEPKR262.300%Swiss-Prot高置信
Q42479拟南芥sp|Q42479|CDPK3_ARATH Calcium-dependent protein kinase 338.100%Swiss-Prot中等置信
Q9S9V0拟南芥sp|Q9S9V0|CDPKV_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3139.700%Swiss-Prot中等置信
Q93VK0拟南芥sp|Q93VK0|PPCK2_ARATH Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 234.500%Swiss-Prot中等置信
B9FKW9水稻sp|B9FKW9|CDPKE_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1439.900%Swiss-Prot中等置信

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