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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G402810
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 100648767-100652601 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3024 bp · TkA01G402810|TK1151|cDNA

GATAAGAAATGACAAAGAATTCGAAATCCACGTTGGAACCCACGCCATGCCTTGCATTTCGATTTTCGAATTCGAAATCCACACTCTCAAGCGCGAAAACAGAGGTACTACGACCCACCCCATTTCAAATTTCAGCAAATATAATACCTCCATTAAAATATCTCCTTCACTGCCTATGGATTCCCTTCCAGTTCCTCACTCCTTGATACAGCTAATCTCCCCCATTCTCTTGTATCATTCCAGGCTTGATCTTCATCTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2301 bp · TkA01G402810|TK1151|CDS

ATGAAGATGCATGCTCCATTGAAATCAAAAGGGATCGCGACCAGGGTTAACAGCCAACATGTAATTTTTGAGCTAAAACAACGTGTTATTCTCTCATTAAACAAGATCGCTGATAGAGACACATATGAAATTGGGGTTGAAGAACTCGGAAGAACAATCTCAAGTTTAACTCCAGATGGGGTTTCTCCATTCTTGTCATGCATTCTAGATACCGATTCTGAACAGAAGATAGCTGTCAGAAAAGAATGTATAAAACTAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

766 aa · TkA01G402810|TK1151|PROTEIN

MKMHAPLKSKGIATRVNSQHVIFELKQRVILSLNKIADRDTYEIGVEELGRTISSLTPDGVSPFLSCILDTDSEQKIAVRKECIKLMGTMATFHQDLIVPHLNKMVISIIKRLKDPDSVVRNACIETMGILASKTSTTDNEPDGTFVMLVRPLFEALGEQNKHVQFGSALCLSRVIDHTRDPPLSILQRMLIRTTKMLKNPHFMAKPAMIELNRSIIQAGGASTQSTLNGAMSSIQEGLKNSDWRTRKAACEALAEIASS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G402810
TK1151 IDTkA01G402810
OH-1004 IDLXL04_003033
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.608 / OH-1004 98.579
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G402810
位置Chr01:100648767-100652601 (+)
描述Similar to TOR1L2: TORTIFOLIA1-like protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g07170 TORTIFOLIA1样蛋白 2。 暂无已核实直接文献
At1g50890 植物特异性微管相关蛋白 ，调节皮质微管的方向和器官生长的方向。
Arabidopsis SPIRAL2 promotes uninterrupted microtubule growth by suppressing the pause state of microtubule dynamics.2008 · DOI: 10.1242/jcs.030221
At4g27060 植物特异性微管相关蛋白 ，调节皮质微管的方向和器官生长的方向。
Arabidopsis SPIRAL2 promotes uninterrupted microtubule growth by suppressing the pause state of microtubule dynamics.2008 · DOI: 10.1242/jcs.030221
At1g27210 TORTIFOLIA1 样蛋白 4。 暂无已核实直接文献
At1g59850 TORTIFOLIA1样蛋白5。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003033 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010031 circumnutation 生物过程
GO:0170002 halotropism 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0010005 cortical microtubule, transverse to long axis 细胞组分
GO:0055028 cortical microtubule 细胞组分
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27210
ath:AT1G50890
ath:AT2G07170
ath:AT4G27060
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.550
排名 1 · TkA01G402810 · TK1151
细胞核0.337
排名 2 · TkA01G402810 · TK1151
细胞膜0.195
排名 3 · TkA01G402810 · TK1151
高尔基体0.062
排名 4 · TkA01G402810 · TK1151
溶酶体／液泡0.053
排名 5 · TkA01G402810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24492HEAT_ECM298-39 aa
PF24714TOR1L1_N23-300 aa
PF10392COG5_N44-100 aa
PF13646HEAT_246-90 aa
PF12755Vac14_Fab1_bd49-123 aa
PF23271HEAT_GCN152-141 aa
PF24987HEAT_EF3_N52-128 aa
PF25801HEAT_GCN1_C_266-176 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G402810PF24492HEAT_ECM298390.0006220.7
TkA01G402810PF24714TOR1L1_N233002.1e-119398.7
TkA01G402810PF10392COG5_N441000.7210.8
TkA01G402810PF13646HEAT_246902.1e-0938.3
TkA01G402810PF12755Vac14_Fab1_bd491230.0003921.7
TkA01G402810PF23271HEAT_GCN1521411.3e-0732.6
TkA01G402810PF24987HEAT_EF3_N521280.004717.6
TkA01G402810PF25801HEAT_GCN1_C_2661760.04713.8
TkA01G402810PF25782TPR_CAND1711610.001120.0
TkA01G402810PF23227HEAT_MROH2B_C741280.01515.4
TkA01G402810PF25757TPR_DNAAF5761770.02214.7
TkA01G402810PF02985HEAT77922.3e-1143.6
TkA01G402810PF13646HEAT_2781352.1e-0938.3
TkA01G402810PF13513HEAT_EZ791292.4e-0731.8
TkA01G402810PF24492HEAT_ECM29831370.0006220.7
TkA01G402810PF10508Proteasom_PSMB831340.2310.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IK92拟南芥sp|F4IK92|TORL2_ARATH TORTIFOLIA1-like protein 244.200%Swiss-Prot中等置信
F4I6M4拟南芥sp|F4I6M4|TORL1_ARATH TORTIFOLIA1-like protein 125.900%Swiss-Prot低置信
Q9T041拟南芥sp|Q9T041|TOR1_ARATH Microtubule-associated protein TORTIFOLIA130.300%Swiss-Prot中等置信
Q93ZH1拟南芥sp|Q93ZH1|TORL4_ARATH TORTIFOLIA1-like protein 438.600%Swiss-Prot低置信
Q9XIE4拟南芥sp|Q9XIE4|TORL5_ARATH TORTIFOLIA1-like protein 529.300%Swiss-Prot低置信

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