TkA01G401440 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G401440

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 100289518-100293677 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3677 bp · TkA01G401440|TK1151|cDNA

GTTGGAGCAGGTGGATAATAAACACACAAAAACACCTCACGTCTTCTTCCTCCATCACCATCAGTCCTCGCGGCCCTCACCTTCATCTAATTAACGATTAAACCTCTTTCAGGAACTCAAAATCACCACCTCATCAAGGATCCATGGGCAGTGTGAATGAAGGCAAGCTCAGGTTCTGTATAGACAGAGGAGGCACATTCACTGATGTCTATGCAGAAATTCCAGGTCAACCTGAAGGCAAAGTAATGAAACTGTTATCT...

CDS

下载 CDS FASTA

3534 bp · TkA01G401440|TK1151|CDS

ATGGGCAGTGTGAATGAAGGCAAGCTCAGGTTCTGTATAGACAGAGGAGGCACATTCACTGATGTCTATGCAGAAATTCCAGGTCAACCTGAAGGCAAAGTAATGAAACTGTTATCTGTTGATCCATCTAACTATGAAGATGCTCCAGTTGAAGGAATCAGAAGAATTCTAGAAGACTTCACTGGAAACAAAATCCCTAGAACTTCAAAACTCCCTACTGACAACATCGAGTGGATTCGAATGGGAACTACAGTTGCAAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1178 aa · TkA01G401440|TK1151|PROTEIN

MGSVNEGKLRFCIDRGGTFTDVYAEIPGQPEGKVMKLLSVDPSNYEDAPVEGIRRILEDFTGNKIPRTSKLPTDNIEWIRMGTTVATNALLERKGERIALCVTKGFRDLLQIGNQARPNIFDLTVSKPSNLYEEVIEVDERIQLVLENEKEYHESNIVTGISGEKVRIMKQVNEASLRPLLNGLLQKGIKCLAVVLMHSYTYPDHELAVKNLAVTMGFKHVSLSSSLTPMVRAVPRGLTASVDAYLTPVIKEYLSGFISK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G401440`
TK1151 ID	TkA01G401440
OH-1004 ID	LXL04_005677
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 91.176 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G401440

位置 Chr01:100289518-100293677 (-)

描述 Similar to OXP1: 5-oxoprolinase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g37830`	催化 5-氧代-L-脯氨酸裂解形成 L-谷氨酸，同时与 ATP 水解为 ADP 和无机磷酸盐。	A gamma-glutamyl transpeptidase-independent pathway of glutathione catabolism to glutamate via 5-oxoproline in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.125716

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005677 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程

GO:0006751 glutathione catabolic process 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0017168 5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing) activity 分子功能

GO:0042802 identical protein binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G37830

bta:408006

ddi:DDB_G0284953

hsa:26873

rno:116684

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.567

排名 1 · TkA01G401440 · TK1151

线粒体0.168

排名 2 · TkA01G401440 · TK1151

过氧化物酶体0.163

排名 3 · TkA01G401440 · TK1151

细胞核0.152

排名 4 · TkA01G401440 · TK1151

质体0.060

排名 5 · TkA01G401440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05378Hydant_A_N10-214 aa

PF01968Hydantoinase_A12-31 aa

PF01968Hydantoinase_A236-535 aa

PF05378Hydant_A_N316-331 aa

PF19278Hydant_A_C559-709 aa

PF02538Hydantoinase_B734-1178 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G401440	`PF05378`	Hydant_A_N	10	214	4e-60	203.2
TkA01G401440	`PF01968`	Hydantoinase_A	12	31	1.3e-107	360.1
TkA01G401440	`PF01968`	Hydantoinase_A	236	535	1.3e-107	360.1
TkA01G401440	`PF05378`	Hydant_A_N	316	331	4e-60	203.2
TkA01G401440	`PF19278`	Hydant_A_C	559	709	1.2e-10	41.8
TkA01G401440	`PF02538`	Hydantoinase_B	734	1178	5.6e-178	593.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FIZ7`	拟南芥	sp\|Q9FIZ7\|OPLA_ARATH 5-oxoprolinase 1	80.300%	Swiss-Prot	高置信

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