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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G363290
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 90419345-90423506 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1646 bp · TkA01G363290|TK1151|cDNA

GAGGTGTATTTTGTCCGCATTTTGACTATAATTTCAAATGCAAACAGCTTGACTTCTGTAACCTACGCTTCTCCGTTTCGCTTATATGTATACTTCACAAAGACCACGACTTTTCATGCCTCGACCTCTCTCTCTAAATTTACGCGCGAAGAAAAGATGAAGAACAACCGAGGCGGAGGGGGAAAAGTATCACCTAAATGGATTATCATTTTCAGCATCTTCAGTTTCGTACTTGGCATGCTTTTTACAAACAGGGTGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1374 bp · TkA01G363290|TK1151|CDS

GAGGTGTATTTTGTCCGCATTTTGACTATAATTTCAAATGCAAACAGCTTGACTTCTGTAACCTACGCTTCTCCGTTTCGCTTATATGTATACTTCACAAAGACCACGACTTTTCATGCCTCGACCTCTCTCTCTAAATTTACGCGCGAAGAAAAGATGAAGAACAACCGAGGCGGAGGGGGAAAAGTATCACCTAAATGGATTATCATTTTCAGCATCTTCAGTTTCGTACTTGGCATGCTTTTTACAAACAGGGTGTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

457 aa · TkA01G363290|TK1151|PROTEIN

EVYFVRILTIISNANSLTSVTYASPFRLYVYFTKTTTFHASTSLSKFTREEKMKNNRGGGGKVSPKWIIIFSIFSFVLGMLFTNRVWAPIESDGRIMRRKEQEMKIVTDDCITNKDNDLMGEVHKTQEAIQSLENSISELRLELPHNQSSFEEVKDDNLHSNKTNEDKSGRRKKAFMVIGINTAFSSRRRRDSIRETWMPRGEKLLQLEKEKGIVVRFMIGHSATSKSILDRAIDSEEAQHKDFFRLEHVEGYHELTAKT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G363290
TK1151 IDTkA01G363290
OH-1004 IDLXL04_022845
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.777 / OH-1004 95.157
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G363290
位置Chr01:90419345-90423506 (-)
描述Similar to B3GALT7: Beta-1,3-galactosyltransferase 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g77810 Beta-1,3-半乳糖基转移酶，可将半乳糖从 UDP-半乳糖转移至具有末端糖基残基的底物。
Identification of a novel group of putative Arabidopsis thaliana beta-(1,3)-galactosyltransferases.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9351-3
At1g22015 β-1,3-半乳糖基转移酶，将半乳糖从 UDP-半乳糖转移到具有末端糖基残基的底物上。 暂无已核实直接文献
At1g05170 β-1,3-半乳糖基转移酶，将半乳糖从 UDP-半乳糖转移到具有末端糖基残基的底物上。 暂无已核实直接文献
At1g33430 β-1,3-半乳糖基转移酶，将半乳糖从 UDP-半乳糖转移到具有末端糖基残基的底物上。 暂无已核实直接文献
At1g32930 参与阿拉伯半乳糖蛋白中β-1,6-连结半乳聚糖侧链延长的β-半乳糖基转移酶。
A galactosyltransferase acting on arabinogalactan protein glycans is essential for embryo development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12281
Galactosyltransferases from Arabidopsis thaliana in the biosynthesis of type II arabinogalactan: molecular interaction enhances enzyme activity.2014 · DOI: 10.1186/1471-2229-14-90

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022845 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程
GO:0010407 non-classical arabinogalactan protein metabolic process 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0008378 galactosyltransferase activity 分子功能
GO:0048531 beta-1,3-galactosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05170
ath:AT1G22015
ath:AT1G32930
ath:AT1G33430
ath:AT1G77810
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.816
排名 1 · TkA01G363290 · TK1151
内质网0.082
排名 2 · TkA01G363290 · TK1151
细胞膜0.065
排名 3 · TkA01G363290 · TK1151
细胞质0.056
排名 4 · TkA01G363290 · TK1151
细胞外0.046
排名 5 · TkA01G363290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13334DUF409464-149 aa
PF02434Fringe88-112 aa
PF30757CCDC12598-153 aa
PF19745FUT8_N_cat102-260 aa
PF15770DUF4699112-146 aa
PF13339AATF-Che1114-169 aa
PF30081MAL13P1_147_C126-163 aa
PF15770DUF4699152-197 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G363290PF13334DUF4094641491.3e-2384.0
TkA01G363290PF02434Fringe881120.0001421.9
TkA01G363290PF30757CCDC125981530.0514.4
TkA01G363290PF19745FUT8_N_cat1022600.02514.1
TkA01G363290PF15770DUF46991121460.02214.8
TkA01G363290PF13339AATF-Che11141690.05714.7
TkA01G363290PF30081MAL13P1_147_C1261630.1313.1
TkA01G363290PF15770DUF46991521970.02214.8
TkA01G363290PF30355zf_C2H2-Disco1781930.0414.7
TkA01G363290PF01762Galactosyl_T1893869.5e-48163.3
TkA01G363290PF02434Fringe2553420.0001421.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6NQB7拟南芥sp|Q6NQB7|B3GT7_ARATH Beta-1,3-galactosyltransferase 766.300%Swiss-Prot高置信
Q9LM60拟南芥sp|Q9LM60|B3GT5_ARATH Probable beta-1,3-galactosyltransferase 560.800%Swiss-Prot高置信
A8MRC7拟南芥sp|A8MRC7|B3GT2_ARATH Probable beta-1,3-galactosyltransferase 258.500%Swiss-Prot高置信
Q9C809拟南芥sp|Q9C809|B3GT8_ARATH Probable beta-1,3-galactosyltransferase 859.800%Swiss-Prot高置信
Q9MAP8拟南芥sp|Q9MAP8|B3GT6_ARATH Beta-1,6-galactosyltransferase GALT31A59.000%Swiss-Prot高置信

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