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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G355910
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 88369029-88372477 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1713 bp · TkA01G355910|TK1151|cDNA

AAAAAGAAAAACAATTAAAAAAGAAAAGGGATCTCAGAAGCATGTCAGCATATTTAGGGGGACGCATGAAATCTGAGACTTCTGTTCTCTAATCAACCAATTTTTTCGAAAAAATTGATGTGCTTAGAGGTTCATGCAAACAATACTCACACCGTTGCCAGGATTTTGAAAAAAATTAGTGCTTAGTTTTGGGGATGATTGTTAGAGATGACTCGAGACGTGTTAATGGTGCAGCCGGAGACCGAAACGACGTCGGGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1176 bp · TkA01G355910|TK1151|CDS

ATGACTCGAGACGTGTTAATGGTGCAGCCGGAGACCGAAACGACGTCGGGAGATGGTGGCGTTGGTATGCTGGTGAAGAAGAAGGGGACAGCGAGTGCCAGAAGTTGGATATCGATCGATTCTAATGTGAATGAGACGATTATGGATATCGATAAGTACGCAATCATGCATAGAGTTCAGATTCATGCTCGTGATCTTCGTATCCTTGACCCTCTTTTATCTTATCCTTCTACAATTTTGGGCCGTGAAAGGGCAATCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

391 aa · TkA01G355910|TK1151|PROTEIN

MTRDVLMVQPETETTSGDGGVGMLVKKKGTASARSWISIDSNVNETIMDIDKYAIMHRVQIHARDLRILDPLLSYPSTILGRERAIVLNLEHIKAIITAEEVLLRDPSDDNVIPVVEELRRRLPVINASHGDLHEVDEEDESPFEFRALEVFLEAICSFHAARTTELETDAYPALDELTSKISSRNLDRVRKLKSAMTRLTARVQKVRDELERLLDDDDDMADLYLSRKLSSASPVSDSGGGAVSWFHGSPTIGSKISRA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G355910
TK1151 IDTkA01G355910
OH-1004 IDLXL04_003465
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.233 / OH-1004 91.304
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G355910
位置Chr01:88369029-88372477 (+)
描述Similar to MRS2-7: Magnesium transporter MRS2-7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g64560 低亲和力镁转运蛋白，介导镁的流入。
Magnesium transporter AtMGT9 is essential for pollen development in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1038/cr.2009.58
At5g09690 低亲和力镁转运蛋白，介导镁的流入。
AtMGT7: An Arabidopsis gene encoding a low-affinity magnesium transporter.2008 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2008.00770.x
UniProt: P0CZ21 镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AJT9 镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。 暂无已核实直接文献
Os03g0742400 镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003465 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0015693 magnesium ion transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0015095 magnesium ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G09690
ath:AT5G64560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.581
排名 1 · TkA01G355910 · TK1151
细胞质0.174
排名 2 · TkA01G355910 · TK1151
细胞核0.129
排名 3 · TkA01G355910 · TK1151
溶酶体／液泡0.093
排名 4 · TkA01G355910 · TK1151
内质网0.075
排名 5 · TkA01G355910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22099MRS2-like41-231 aa
PF05235CHAD92-121 aa
PF01544CorA122-222 aa
PF05235CHAD147-218 aa
PF28121VPA1267168-214 aa
PF05055DUF677180-224 aa
PF00038Filament183-216 aa
PF14712Snapin_Pallidin186-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G355910PF22099MRS2-like412313.8e-35122.0
TkA01G355910PF05235CHAD921210.311.7
TkA01G355910PF01544CorA1222225.4e-1039.7
TkA01G355910PF05235CHAD1472180.311.7
TkA01G355910PF28121VPA12671682140.07114.0
TkA01G355910PF05055DUF6771802240.2411.0
TkA01G355910PF00038Filament1832160.0001921.9
TkA01G355910PF14712Snapin_Pallidin1862140.3712.0
TkA01G355910PF29562DUF85671872140.9110.0
TkA01G355910PF05377FlaC_arch1892162.29.5
TkA01G355910PF25450Rab11-FIP31892184.18.4
TkA01G355910PF08663HalX1982230.113.7
TkA01G355910PF00038Filament2573260.0001921.9
TkA01G355910PF05055DUF6772683080.2411.0
TkA01G355910PF25450Rab11-FIP32683194.18.4
TkA01G355910PF22099MRS2-like2693183.8e-35122.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLG2拟南芥sp|Q9FLG2|MRS22_ARATH Magnesium transporter MRS2-278.400%Swiss-Prot高置信
Q304A0拟南芥sp|Q304A0|MRS27_ARATH Magnesium transporter MRS2-772.100%Swiss-Prot高置信
P0CZ21拟南芥sp|P0CZ21|MRS28_ARATH Magnesium transporter MRS2-863.300%Swiss-Prot高置信
B8AJT9水稻sp|B8AJT9|MRS2I_ORYSI Magnesium transporter MRS2-I81.200%Swiss-Prot高置信
Q10D38水稻sp|Q10D38|MRS2I_ORYSJ Magnesium transporter MRS2-I81.900%Swiss-Prot高置信

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