TkA01G345970 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G345970

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 85969745-85975925 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2643 bp · TkA01G345970|TK1151|cDNA

CTTCGATCCAACTCAGTTTTAGTGGGAAGGCAACCTTGATTCATAGCAATTGATCTCTCCAATAAATGAATCCGAGAACAAGTTACTGCAAGCAGCAGATGCGATGATTATTAGGGCATTTTCGCGTTCTGCAAGTTGTACTGAAGTTTGTTAAAGAAGTCATGTAAGTCTGATATTGAGTTGTACGATTGAGATTATAATACAACATTGGATCAAGGAGTGATGGAGTCAAGAATGGATCAGTACGAGATGATGGAGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1266 bp · TkA01G345970|TK1151|CDS

ATGGACATTTATGTCCTCAATAACGATGAGCAAGAGGCAGGCAAACCGAGACCCGATGAACCCAAGTCAAATTACGAAACTGCCCATGTGAAAAATACACGGATGGGTGTCAAAGATGGTAAATTTAGGGAACAGAGTTCGCCCATGAGAGGCGGGCGGTTAAAGACCGATACACCATCATCGGAAAAGAGCACCAAGAGAACTCCGGGATCTAATTCTGTTAAGCATCAGGTACCTAAACAAGAGGAACCGTCAGATAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

421 aa · TkA01G345970|TK1151|PROTEIN

MDIYVLNNDEQEAGKPRPDEPKSNYETAHVKNTRMGVKDGKFREQSSPMRGGRLKTDTPSSEKSTKRTPGSNSVKHQVPKQEEPSDNLNPRIRTPPPPTLLRKPSFLGRIKHLPIDAPIPDPSTVAKNVQPTEPIQTPDRVPVTKTIHTPVRDTIHTNRRQKLDPPPLDPIPVTKNVEPIATFQTPAPMQHTNGHQNPLSKIIQESRVVVSDNKQTDSSFEEAASSASIQRFEPPSLPTPDSGVPSESNSDSTTALQIPT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G345970`
TK1151 ID	TkA01G345970
OH-1004 ID	LXL04_003526
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	74.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 56.460 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G345970

位置 Chr01:85969745-85975925 (-)

描述 Similar to NEK5: Serine/threonine-protein kinase Nek5

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g44200`	参与下胚轴和根部的表皮细胞形态发生。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0864700`	可能参与植物发育过程。	暂无已核实直接文献
`Os05g0440800`	可能参与植物发育过程。	暂无已核实直接文献
`Os07g0176600`	可能参与植物发育过程（可能）。	Cytoplasmic male sterility-related protein kinase, OsNek3, is regulated downstream of mitochondrial protein phosphatase 2C, DCW11.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp026
`Os03g0636800`	可能参与植物发育过程。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003526 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007017 microtubule-based process 生物过程

GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程

GO:0090627 plant epidermal cell differentiation 生物过程

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0055028 cortical microtubule 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G44200

dosa:Os01g0864700

dosa:Os05g0440800

osa:4324792

osa:4338922

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.419

排名 1 · TkA01G345970 · TK1151

细胞核0.327

排名 2 · TkA01G345970 · TK1151

细胞膜0.320

排名 3 · TkA01G345970 · TK1151

内质网0.086

排名 4 · TkA01G345970 · TK1151

高尔基体0.062

排名 5 · TkA01G345970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q0WPH8`	拟南芥	sp\|Q0WPH8\|NEK5_ARATH Serine/threonine-protein kinase Nek5	83.300%	Swiss-Prot	低置信
`Q94CU5`	水稻	sp\|Q94CU5\|NEK5_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase Nek5	79.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q60DG4`	水稻	sp\|Q60DG4\|NEK4_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase Nek4	75.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q6ZEZ5`	水稻	sp\|Q6ZEZ5\|NEK3_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase Nek3	72.400%	Swiss-Prot	低置信
`Q10GB1`	水稻	sp\|Q10GB1\|NEK1_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase Nek1	71.900%	Swiss-Prot	低置信

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