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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G321500
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 79881408-79889640 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3561 bp · TkA01G321500|TK1151|cDNA

ATGGCGCAATCTCTGAATCTCTCTATTTCCATTCCCCATTCCGTCAAACTCTCCCTCCCTCTCACCAACTACCCCGTCTCCCGTTTCGCCTTCTCCAATAACCCTAGCAAAATCTCTTTATGCACCAGAGCTGCCACATCAGAGTCTAATTCTTCTGTTTTGACATCCAAAAATGGATCTGACGGCATTTTATCTGCCGCGGTCTCTGATTCCAGCTCGATTGAGATTGATACAGTGACGGAGGCGGAGATGAAGGAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

3561 bp · TkA01G321500|TK1151|CDS

ATGGCGCAATCTCTGAATCTCTCTATTTCCATTCCCCATTCCGTCAAACTCTCCCTCCCTCTCACCAACTACCCCGTCTCCCGTTTCGCCTTCTCCAATAACCCTAGCAAAATCTCTTTATGCACCAGAGCTGCCACATCAGAGTCTAATTCTTCTGTTTTGACATCCAAAAATGGATCTGACGGCATTTTATCTGCCGCGGTCTCTGATTCCAGCTCGATTGAGATTGATACAGTGACGGAGGCGGAGATGAAGGAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1186 aa · TkA01G321500|TK1151|PROTEIN

MAQSLNLSISIPHSVKLSLPLTNYPVSRFAFSNNPSKISLCTRAATSESNSSVLTSKNGSDGILSAAVSDSSSIEIDTVTEAEMKENGFRSTRRTKLICTIGPATCMPEQLEALAVGGMNVARINMCHGTREWHREVIQRVRKLNEDKGYAVAIMMDTEGSEIHMGDLGGGASSAKTEDGEIWTFSVRAFESVLPERTINVNYGGFAEDVEVGDDLLVDGGMVRFEVIEKIGPDVKCRCTDPGLLLPRANLTFWRNGSLV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G321500
TK1151 IDTkA01G321500
OH-1004 IDLXL04_003420
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)75.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 44.604 / OH-1004 97.089
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G321500
位置Chr01:79881408-79889640 (+)
描述Similar to Pyruvate kinase isozyme A, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g22960 质体丙酮酸激酶活性所需。
Function of plastidial pyruvate kinases in seeds of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03232.x
At1g32440 质体丙酮酸激酶活性所需。 暂无已核实直接文献
At5g52920 质体丙酮酸激酶活性所需。
Function of plastidial pyruvate kinases in seeds of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03232.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003420 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006096 glycolytic process 生物过程
GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0004743 pyruvate kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016301 kinase activity 分子功能
GO:0030955 potassium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G32440
ath:AT3G22960
nta:107822892
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.538
排名 1 · TkA01G321500 · TK1151
质体0.316
排名 2 · TkA01G321500 · TK1151
细胞质0.128
排名 3 · TkA01G321500 · TK1151
线粒体0.062
排名 4 · TkA01G321500 · TK1151
细胞膜0.036
排名 5 · TkA01G321500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00224PK93-425 aa
PF03328HpcH_HpaI281-350 aa
PF02887PK_C471-529 aa
PF25585zf-CCCH_DUS3L472-480 aa
PF29102Su_sable_N975-998 aa
PF16131Torus997-1052 aa
PF29102Su_sable_N1024-1052 aa
PF00642zf-CCCH1026-1049 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G321500PF00224PK934252.4e-89300.4
TkA01G321500PF03328HpcH_HpaI2813500.001618.5
TkA01G321500PF02887PK_C4715293.6e-0834.2
TkA01G321500PF25585zf-CCCH_DUS3L4724800.01116.3
TkA01G321500PF29102Su_sable_N9759980.004118.2
TkA01G321500PF16131Torus99710523.2e-0938.0
TkA01G321500PF29102Su_sable_N102410520.004118.2
TkA01G321500PF00642zf-CCCH102610491.8e-1041.2
TkA01G321500PF15663zf-CCCH_3102810770.1612.9
TkA01G321500PF18345zf_CCCH_4103010481.7e-1144.5
TkA01G321500PF18044zf-CCCH_4103010491.9e-0525.0
TkA01G321500PF14608zf-CCCH_2103010480.0006920.7
TkA01G321500PF25585zf-CCCH_DUS3L103010490.01116.3
TkA01G321500PF25261zf-CCCH_PARP12103010490.3511.8
TkA01G321500PF25584zf-CCCH_RBM22103010460.7210.7
TkA01G321500PF25542zf-CCCH_12103210492.58.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LIK0拟南芥sp|Q9LIK0|PKP1_ARATH Plastidial pyruvate kinase 1, chloroplastic79.700%Swiss-Prot低置信
Q93Z53拟南芥sp|Q93Z53|PKP3_ARATH Plastidial pyruvate kinase 3, chloroplastic41.900%Swiss-Prot低置信
Q9FLW9拟南芥sp|Q9FLW9|PKP2_ARATH Plastidial pyruvate kinase 244.700%Swiss-Prot中等置信

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