TkA01G208590 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G208590

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 53075553-53078669 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1444 bp · TkA01G208590|TK1151|cDNA

AGCATTTGGTGAATTATAGCTTCAGGCCCATCCGAAGCATCCGACCTACCGTGTGGCTTAAACTCTTAACCGATCACCAAAATATCTATAAACAATTATCTCAAAATAACGAACAAAATCAGCAATCCAAATCTCCCATATTTCTCCCTCCATTTTTCTGCCTGCAATCACCGTGTTCGTGTTTTCTCAAAGCTTATGTCTTCTTCTCTTCCTCTGAGCTTTAATTATCTTCCTTCGTGGCCGAAATCGTCAACAACTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1176 bp · TkA01G208590|TK1151|CDS

ATGTCTTCTTCTCTTCCTCTGAGCTTTAATTATCTTCCTTCGTGGCCGAAATCGTCAACAACTTCTTCAGAATTCAATAAGAATGTCTTTAGCTTTCCGATTTTATCCAAACCTACGCCCCTCTCCCTCTCAAAATCTCAAATTTGCTTCGTATTTACCAACAATAGCTCGGAATACGAACGGGAAGAGACCAGATGGCTCCGAGAAGAGCAACGGTGGTTGCGGGAGGAGCAGCGGTGGATTCGAGAGGAGCGACGGTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

391 aa · TkA01G208590|TK1151|PROTEIN

MSSSLPLSFNYLPSWPKSSTTSSEFNKNVFSFPILSKPTPLSLSKSQICFVFTNNSSEYEREETRWLREEQRWLREEQRWIREERRWEAERESLLDEIKALKLQIEELRHEEARSSVSNVTNLLHVLKKEVNQIAESGSSAAPLVVEAAAAAVEEAEEVVVKEVIRTTEEVKEKEVKEEVTKKRTTLRVGTEGDQVQMMQEALQKLGFYCGEEDEEFSVFSSGTERAVKTWQASIDVPETGMMTPELLERLYTGQKDGNS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G208590`
TK1151 ID	TkA01G208590
OH-1004 ID	LXL04_004059
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	97.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G208590

位置 Chr01:53075553-53078669 (-)

描述 Similar to PTAC5: Protein disulfide isomerase pTAC5, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g13670`	表现出依赖锌的二硫键异构酶活性。	Chloroplast small heat shock protein HSP21 interacts with plastid nucleoid protein pTAC5 and is essential for chloroplast development in Arabidopsis under heat stress.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111229

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004059 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0009658 chloroplast organization 生物过程

GO:0042793 plastid transcription 生物过程

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分

GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0042644 chloroplast nucleoid 细胞组分

GO:0003756 protein disulfide isomerase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G13670

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.958

排名 1 · TkA01G208590 · TK1151

细胞核0.054

排名 2 · TkA01G208590 · TK1151

细胞质0.038

排名 3 · TkA01G208590 · TK1151

线粒体0.034

排名 4 · TkA01G208590 · TK1151

过氧化物酶体0.025

排名 5 · TkA01G208590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11932DUF345060-144 aa

PF04632FUSC64-190 aa

PF26572DUF818567-75 aa

PF31006DYAD_CC112-185 aa

PF26572DUF8185140-224 aa

PF25112zf-AtTam37148-161 aa

PF08823PG_binding_2182-233 aa

PF01471PG_binding_1193-251 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G208590	`PF11932`	DUF3450	60	144	0.13	12.2
TkA01G208590	`PF04632`	FUSC	64	190	0.32	10.3
TkA01G208590	`PF26572`	DUF8185	67	75	9.6	7.5
TkA01G208590	`PF31006`	DYAD_CC	112	185	2.5	9.2
TkA01G208590	`PF26572`	DUF8185	140	224	9.6	7.5
TkA01G208590	`PF25112`	zf-AtTam37	148	161	0.89	11.0
TkA01G208590	`PF08823`	PG_binding_2	182	233	0.00012	23.0
TkA01G208590	`PF01471`	PG_binding_1	193	251	9.7e-11	42.4
TkA01G208590	`PF21002`	TMEM106_N	307	352	0.99	10.8
TkA01G208590	`PF30758`	Orange_C	318	352	0.014	16.5
TkA01G208590	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	326	340	0.00025	22.0
TkA01G208590	`PF22415`	PSV_ORF131-like_dom	326	346	8.8	7.1
TkA01G208590	`PF25112`	zf-AtTam37	329	352	0.89	11.0
TkA01G208590	`PF15777`	Anti-TRAP	331	342	0.38	11.5
TkA01G208590	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	333	387	0.00025	22.0
TkA01G208590	`PF25436`	BSD2_CRD	333	352	0.00045	21.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`A1A6M1`	拟南芥	sp\|A1A6M1\|PTAC5_ARATH Protein disulfide isomerase pTAC5, chloroplastic	54.900%	Swiss-Prot	中等置信

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