TkA01G207110 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G207110

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 52723788-52724951 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

738 bp · TkA01G207110|TK1151|cDNA

AGCCGACATCCTACTCTAAAGTGGGCCCAGAGGGATGATTTGGTTTATATCACAATTGATCTACCAGATGCTAAAAACGTGAACCTCAAACTCACCCCAGAGGGAAAGTTCTACTTCTCTGCAACAAGTGGACCCGATAGTACACCTTATGAAATTGATATCAACCTTTATGACAACGTCAATGTGGACGAGAGCAAGGCTAATGTTGGGTCAAGAAATGTTGTGTACATTGTGAAGAAGGAAGAGAGTAAATGGTGGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

441 bp · TkA01G207110|TK1151|CDS

AGCCGACATCCTACTCTAAAGTGGGCCCAGAGGGATGATTTGGTTTATATCACAATTGATCTACCAGATGCTAAAAACGTGAACCTCAAACTCACCCCAGAGGGAAAGTTCTACTTCTCTGCAACAAGTGGACCCGATAGTACACCTTATGAAATTGATATCAACCTTTATGACAACGTCAATGTGGACGAGAGCAAGGCTAATGTTGGGTCAAGAAATGTTGTGTACATTGTGAAGAAGGAAGAGAGTAAATGGTGGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

146 aa · TkA01G207110|TK1151|PROTEIN

SRHPTLKWAQRDDLVYITIDLPDAKNVNLKLTPEGKFYFSATSGPDSTPYEIDINLYDNVNVDESKANVGSRNVVYIVKKEESKWWNRLLKQEGRTPAFVKVDWNKWVDEDEQDEKAGPDMDYDDVNFSSLNLGGGGGEDFDADDE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G207110`
TK1151 ID	TkA01G207110
OH-1004 ID	LXL04_031205
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.260 / OH-1004 60.944 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G207110

位置 Chr01:52723788-52724951 (-)

描述 Similar to P23-1: Co-chaperone protein p23-1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g03773`	充当 HSP90 的辅助伴侣。	Characterization of plant p23-like proteins for their co-chaperone activities.2010 · DOI: 10.1007/s12192-010-0182-1
`At4g02450`	作为HSP90的辅助手分子。	Characterization of plant p23-like proteins for their co-chaperone activities.2010 · DOI: 10.1007/s12192-010-0182-1

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: P0C8Z0`	未表征蛋白 OsI_027940。	暂无已核实直接文献
`Os08g0359500`	未表征蛋白 Os08g0359500。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031205 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0006950 response to stress 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0010449 root meristem growth 生物过程

GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程

GO:0051131 chaperone-mediated protein complex assembly 生物过程

GO:0080037 negative regulation of cytokinin-activated signaling pathway 生物过程

GO:2000012 regulation of auxin polar transport 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G03773

ath:AT4G02450

dosa:Os08g0359500

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.700

排名 1 · TkA01G207110 · TK1151

细胞核0.574

排名 2 · TkA01G207110 · TK1151

线粒体0.075

排名 3 · TkA01G207110 · TK1151

细胞膜0.059

排名 4 · TkA01G207110 · TK1151

内质网0.047

排名 5 · TkA01G207110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21413SHQ1-like_CS4-66 aa

PF04969CS5-80 aa

PF21413SHQ1-like_CS96-126 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G207110	`PF21413`	SHQ1-like_CS	4	66	0.015	16.0
TkA01G207110	`PF04969`	CS	5	80	1.3e-11	46.0
TkA01G207110	`PF21413`	SHQ1-like_CS	96	126	0.015	16.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q6ID70`	拟南芥	sp\|Q6ID70\|P23B_ARATH Co-chaperone protein p23-2	47.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8L7U4`	拟南芥	sp\|Q8L7U4\|P23A_ARATH Co-chaperone protein p23-1	47.300%	Swiss-Prot	中等置信
`P0C8Z0`	水稻	sp\|P0C8Z0\|Y8359_ORYSI Uncharacterized protein OsI_027940	52.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q6YYB0`	水稻	sp\|Q6YYB0\|Y8359_ORYSJ Uncharacterized protein Os08g0359500	52.700%	Swiss-Prot	高置信

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