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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G196810
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 50215742-50222242 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3071 bp · TkA01G196810|TK1151|cDNA

GTGGGACCCATTGACTTTGGTCATTAACCGATTTTAGTTCTCTTCCATTGATGCGAAACACTTGCTGCAATAAAGTTGTTCAGTTCTATTCTGGCTTGTTCCACTCACCATACGCTAAGCCCTAATCACCCGTTCAGAAACTTCCCACGATCTCTAAACGCCCAACCCCCCCGGCCCACCGTTGCGACCAGATTTCTTCTTCAGCCTCTCAATTCCACGAATGATGATTCGACATCTACTTCTCGATTGTTTCCCCATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1935 bp · TkA01G196810|TK1151|CDS

ATGGTTGCATTCAAGCTCCAAGTCAACGGAACCGATGAATACTACGTGGATAACATCGATGGATTCAACTTGCCGGTATCCGTGGATGCGATTGGCGGGTCGGGTTCCGGTGTATACACATGTGCAAAAGCCGGGTGCATCGGACAAATGAAGGGATGGTGTCCCCCAGAGCTCAAAGTGCAGGGTGGGGACGGATGCCGCAGTGCCTGCAACGTCTTTCATACACCAGAATACTGTTGCAGCCATTCGTTCTCCACCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

644 aa · TkA01G196810|TK1151|PROTEIN

MVAFKLQVNGTDEYYVDNIDGFNLPVSVDAIGGSGSGVYTCAKAGCIGQMKGWCPPELKVQGGDGCRSACNVFHTPEYCCSHSFSTPSTCKPTSYAKAFQRVCPRSRTLPYNTDNSTSIFTCEGADYIVRFCPAAGTFSTIQVGGQLRCTDRLTSTNGTFTLGFYGVHFGSLGIWYSNDENNKVWVAKPTLSTSGNHVLSIDPNTGSLIIIAGGSTLRVIADVQTGPSLNVMATLGEDGRLRLIANTTVLWQTPFHPFIQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G196810
TK1151 IDTkA01G196810
OH-1004 IDLXL04_029217
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)34.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.789 / OH-1004 45.628
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G196810
位置Chr01:50215742-50222242 (+)
描述Similar to CES101: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase CES101
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g23180 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 10。 暂无已核实直接文献
At4g23260 富半胱氨酸的类受体蛋白激酶 18。 暂无已核实直接文献
At4g23240 推测的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶16。 暂无已核实直接文献
At4g23250 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶17。 暂无已核实直接文献
At4g00960 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶44。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029217 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G67520
ath:AT3G16030
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.844
排名 1 · TkA01G196810 · TK1151
细胞质0.107
排名 2 · TkA01G196810 · TK1151
细胞核0.072
排名 3 · TkA01G196810 · TK1151
内质网0.070
排名 4 · TkA01G196810 · TK1151
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · TkA01G196810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00314Thaumatin2-133 aa
PF01636APH113-137 aa
PF15807MAP17263-308 aa
PF28423Epiregulin_C271-293 aa
PF00069Pkinase333-601 aa
PF03109ABC1334-360 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr335-602 aa
PF03109ABC1401-483 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G196810PF00314Thaumatin21331.4e-32113.8
TkA01G196810PF01636APH1131370.009816.4
TkA01G196810PF15807MAP172633080.07813.8
TkA01G196810PF28423Epiregulin_C2712930.004217.6
TkA01G196810PF00069Pkinase3336019.8e-49166.8
TkA01G196810PF03109ABC13343600.0003220.6
TkA01G196810PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3356026.8e-47160.7
TkA01G196810PF03109ABC14014830.0003220.6
TkA01G196810PF06293Kdo4034720.0215.0
TkA01G196810PF01636APH4064800.009816.4
TkA01G196810PF12330Haspin_kinase4274820.01315.3
TkA01G196810PF17667Pkinase_fungal4405248.8e-0625.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYA4拟南芥sp|Q8GYA4|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1047.300%Swiss-Prot低置信
Q8RX80拟南芥sp|Q8RX80|CRK18_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1845.800%Swiss-Prot低置信
O65476拟南芥sp|O65476|CRK16_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 1645.600%Swiss-Prot低置信
Q8L710拟南芥sp|Q8L710|CRK17_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1745.700%Swiss-Prot低置信
O23082拟南芥sp|O23082|CRK44_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 4440.800%Swiss-Prot中等置信

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