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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G167570
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 42853321-42855254 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1875 bp · TkA01G167570|TK1151|cDNA

ATGCTGATAATTATGGCGGTTTTACTGGTCATCGCCGCTAGGGCGGCGGCCATCCCCTGCCCAGATTGCGGGAAAATTCCAGTCCCGTATCCACTCAGTACAACACCAACGTGTGGCCATCAATCATACAAGATTCGGTGCGATAGGGGTGTGTTGAAATTCGATTCCATCAATAACACTTACCCAATCATCTCAATCTCCCCCAAAAATCAACGCATGGTAATCGGTCAATCGCATCTATTACCAAACACCTGCGTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1875 bp · TkA01G167570|TK1151|CDS

ATGCTGATAATTATGGCGGTTTTACTGGTCATCGCCGCTAGGGCGGCGGCCATCCCCTGCCCAGATTGCGGGAAAATTCCAGTCCCGTATCCACTCAGTACAACACCAACGTGTGGCCATCAATCATACAAGATTCGGTGCGATAGGGGTGTGTTGAAATTCGATTCCATCAATAACACTTACCCAATCATCTCAATCTCCCCCAAAAATCAACGCATGGTAATCGGTCAATCGCATCTATTACCAAACACCTGCGTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

624 aa · TkA01G167570|TK1151|PROTEIN

MLIIMAVLLVIAARAAAIPCPDCGKIPVPYPLSTTPTCGHQSYKIRCDRGVLKFDSINNTYPIISISPKNQRMVIGQSHLLPNTCVMADFVTKGIQLDNSLPFTIAPTNTVFFFNCTDTMGAVILDCTPENVCQAYQNASPEMSMCRRAPASTCCSFKKGSSTSLFSIPLNMEKCRAYSSFVNLNISLPISKWPDPGVELIWAPPPEPPCTSQGHCDSTSTCRDDHDGTRRCFCNPKFRWDANTGQCAKDKFVADLKKAR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G167570
TK1151 IDTkA01G167570
OH-1004 IDLXL04_012391
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G167570
位置Chr01:42853321-42855254 (-)
描述Similar to WAKL20: Wall-associated receptor kinase-like 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g02070 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At3g53840 推定的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能作为细胞外基质组分的信号受体。 暂无已核实直接文献
At5g66790 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g69730 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g79680 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012391 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004383 guanylate cyclase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69730
ath:AT1G79680
ath:AT3G53840
ath:AT5G02070
ath:AT5G66790
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.877
排名 1 · TkA01G167570 · TK1151
细胞质0.082
排名 2 · TkA01G167570 · TK1151
内质网0.068
排名 3 · TkA01G167570 · TK1151
细胞核0.051
排名 4 · TkA01G167570 · TK1151
细胞外0.023
排名 5 · TkA01G167570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947GUB_WAK_bind20-75 aa
PF25387ADGRF3_N131-142 aa
PF12946EGF_MSP1_1210-244 aa
PF12947EGF_3212-241 aa
PF25387ADGRF3_N219-244 aa
PF06305LapA_dom266-307 aa
PF13314DUF4083270-299 aa
PF00069Pkinase337-603 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G167570PF13947GUB_WAK_bind20751.5e-0835.6
TkA01G167570PF25387ADGRF3_N1311420.01616.3
TkA01G167570PF12946EGF_MSP1_12102440.03714.8
TkA01G167570PF12947EGF_32122413.48.7
TkA01G167570PF25387ADGRF3_N2192440.01616.3
TkA01G167570PF06305LapA_dom2663070.4111.3
TkA01G167570PF13314DUF40832702990.6910.7
TkA01G167570PF00069Pkinase3376037.4e-44150.8
TkA01G167570PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3396054e-47161.4
TkA01G167570PF03109ABC13403881.7e-0524.8
TkA01G167570PF12330Haspin_kinase4284860.0812.7
TkA01G167570PF03109ABC14324851.7e-0524.8
TkA01G167570PF25387ADGRF3_N5035110.01616.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZM4拟南芥sp|Q9LZM4|WAKLQ_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 2048.300%Swiss-Prot中等置信
Q9M342拟南芥sp|Q9M342|WAKLP_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 1548.900%Swiss-Prot中等置信
Q8GYF5拟南芥sp|Q8GYF5|WAKLR_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 2141.600%Swiss-Prot中等置信
Q9C9L5拟南芥sp|Q9C9L5|WAKLH_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 949.100%Swiss-Prot低置信
Q8VYA3拟南芥sp|Q8VYA3|WAKLJ_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 1048.000%Swiss-Prot低置信

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